SNX13

SNX13
Ідентифікатори
Символи	SNX13, RGS-PX1, sorting nexin 13
Зовнішні ІД	OMIM: 606589 MGI: 2661416 HomoloGene: 41011 GeneCards: SNX13
Онтологія гена Молекулярна функція • phosphatidylinositol binding • phosphatidylinositol-3-phosphate binding • lipid binding Клітинна компонента • ендосома • early endosome • early endosome membrane • мембрана Біологічний процес • protein transport • negative regulation of signal transduction • intracellular protein transport • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23161	217463
Ensembl	ENSG00000071189	ENSMUSG00000020590
UniProt	Q9Y5W8	Q6PHS6
RefSeq (мРНК)	NM_015132	NM_001014973
RefSeq (білок)	NP_055947 NP_001337791 NP_001337792 NP_001337793 NP_001337795 NP_001337796 NP_001337797 NP_001337799	NP_001014973
Локус (UCSC)	н/д	Хр. 12: 35.1 – 35.2 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SNX13 (англ. Sorting nexin 13) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 968 амінокислот, а молекулярна маса — 112 189.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLTEASLSIW		GWGSLGIVLF		LITFGPFVIF		YLTFYILCFV		GGGLVVTLLF
GKTNSEKYLE		QCEHSFLPPT		SPGVPKCLEE		MKREARTIKI		DRRLTGANII
DEPLQQVIQF		SLRDYVQYWY		YTLSDDESFL		LEIRQTLQNA		LIQFATRSKE
IDWQPYFTTR		IVDDFGTHLR		VFRKAQQKIT		EKDDQVKGTA		EDLVDTFFEV
EVEMEKEVCR		DLVCTSPKDE		EGFLRDLCEV		LLYLLLPPGD		FQNKIMRYFV
REILARGILL		PLINQLSDPD		YINQYVIWMI		RDSNCNYEAF		MNIIKLSDNI
GELEAVRDKA		AEELQYLRSL		DTAGDDINTI		KNQINSLLFV		KKVCDSRIQR
LQSGKEINTV		KLAANFGKLC		TVPLDSILVD		NVALQFFMDY		MQQTGGQAHL
FFWMTVEGYR		VTAQQQLEVL		LSRQRDGKHQ		TNQTKGLLRA		AAVGIYEQYL
SEKASPRVTV		DDYLVAKLAD		TLNHEDPTPE		IFDDIQRKVY		ELMLRDERFY
PSFRQNALYV		RMLAELDMLK		DPSFRGSDDG		DGESFNGSPT		GSINLSLDDL
SNVSSDDSVQ		LHAYISDTVY		ADYDPYAVAG		VCNDHGKTYA		LYAITVHRRN
LNSEEMWKTY		RRYSDFHDFH		MRITEQFESL		SSILKLPGKK		TFNNMDRDFL
EKRKKDLNAY		LQLLLAPEMM		KASPALAHYV		YDFLENKAYS		KGKGDFARKM
DTFVNPLRNS		MRNVSNAVKS		LPDSLAEGMT		KMSDNMGKMS		ERLGQDIKQS
FFKVPPLIPK		TDSDPEHRRV		SAQLDDNVDD		NIPLRVMLLL		MDEVFDLKER
NQWLRRNIKN		LLQQLIRATY		GDTINRKIVD		HVDWMTSPEQ		VADSVKRFRD
AFWPNGILAE		AVPCRDKSIR		MRTRVAGKTK		LLAIMPDELK		HIIGAETTRK
GILRVFEMFQ		HNQLNRRMVY		VFLEGFLETL		FPQYKFRELF		NKLHSRSKQM
QKYKQKLQTT		QAPSLQKR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до інгібіторів передачі внутрішньоклітинних сигналів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ліпідами. Локалізований у мембрані, ендосомах.

Література

• Teasdale R.D., Loci D., Houghton F., Karlsson L., Gleeson P.A. (2001). A large family of endosome-localized proteins related to sorting nexin 1. Biochem. J. 358: 7—16. PMID 11485546 DOI:10.1042/0264-6021:3580007
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Hillman R.T., Green R.E., Brenner S.E. (2004). An unappreciated role for RNA surveillance. Genome Biol. 5: R8.1—R8.16. PMID 14759258 DOI:10.1186/gb-2004-5-2-r8

Див. також

• Хромосома 7