SNX21

SNX21
Ідентифікатори
Символи	SNX21, C20orf161, PP3993, SNX-L, dJ337O18.4, sorting nexin family member 21, SNXL
Зовнішні ІД	MGI: 1917729 HomoloGene: 43132 GeneCards: SNX21
Онтологія гена Молекулярна функція • lipid binding • phosphatidylinositol binding • phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate binding • phosphatidylinositol-3-phosphate binding Клітинна компонента • мембрана • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • cytoplasmic vesicle membrane • ендосома • early endosome membrane Біологічний процес • protein transport Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	90203	101113
Ensembl	ENSG00000124104	ENSMUSG00000050373
UniProt	Q969T3	Q3UR97
RefSeq (мРНК)	NM_001042632 NM_001042633 NM_033421 NM_152897	NM_133924 NM_001399716
RefSeq (білок)	NP_001036097 NP_001036098 NP_219489 NP_690857	NP_598685 NP_001386645
Локус (UCSC)	Хр. 20: 45.83 – 45.84 Mb	Хр. 2: 164.63 – 164.64 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SNX21 (англ. Sorting nexin family member 21) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 373 амінокислот, а молекулярна маса — 41 365.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MHRGTQEGAM		ASRLLHRLRH		ALAGDGPGEA		AASPEAEQFP		ESSELEDDDA
EGLSSRLSGT		LSFTSAEDDE		DDEDEDDEEA		GPDQLPLGDG		TSGEDAERSP
PPDGQWGSQL		LARQLQDFWK		KSRNTLAPQR		LLFEVTSANV		VKDPPSKYVL
YTLAVIGPGP		PDCQPAQISR		RYSDFERLHR		NLQRQFRGPM		AAISFPRKRL
RRNFTAETIA		RRSRAFEQFL		GHLQAVPELR		HAPDLQDFFV		LPELRRAQSL
TCTGLYREAL		ALWANAWQLQ		AQLGTPSGPD		RPLLTLAGLA		VCHQELEDPG
EARACCEKAL		QLLGDKSLHP		LLAPFLEAHV		RLSWRLGLDK		RQSEARLQAL
QEAGLTPTPP		PSLKELLIKE		VLD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ліпідами. Локалізований у мембрані, цитоплазматичних везикулах, ендосомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 20