SREK1

SREK1
Ідентифікатори
Символи	SREK1, SFRS12, SRrp508, SRrp86, splicing regulatory glutamic acid/lysine-rich protein 1, splicing regulatory glutamic acid and lysine rich protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 609268 MGI: 2145245 HomoloGene: 10581 GeneCards: SREK1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • RNA binding Клітинна компонента • spliceosomal complex • клітинне ядро • Нуклеоплазма • nuclear speck Біологічний процес • mRNA processing • Сплайсинг РНК • regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	140890	218543
Ensembl	ENSG00000153914	ENSMUSG00000032621
UniProt	Q8WXA9	Q8BZX4
RefSeq (мРНК)	NM_001077199 NM_001270492 NM_001270493 NM_139168 NM_001323527 NM_001323529 NM_001323533 NM_001323534 NM_001323535	NM_172592 NM_001361085
RefSeq (білок)	NP_001070667 NP_001257421 NP_001310456 NP_001310458 NP_001310462 NP_001310463 NP_001310464 NP_631907	NP_766180 NP_001348014
Локус (UCSC)	Хр. 5: 66.14 – 66.18 Mb	Хр. 13: 103.88 – 103.91 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SREK1 (англ. Splicing regulatory glutamic acid and lysine rich protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 508 амінокислот, а молекулярна маса — 59 380.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTSLMPGAGL		LPIPTPNPLT		TLGVSLSSLG		AIPAAALDPN		IATLGEIPQP
PLMGNVDPSK		IDEIRRTVYV		GNLNSQTTTA		DQLLEFFKQV		GEVKFVRMAG
DETQPTRFAF		VEFADQNSVP		RALAFNGVMF		GDRPLKINHS		NNAIVKPPEM
TPQAAAKELE		EVMKRVREAQ		SFISAAIEPE		SGKSNERKGG		RSRSHTRSKS
RSSSKSHSRR		KRSQSKHRSR		SHNRSRSRQK		DRRRSKSPHK		KRSKSRERRK
SRSRSHSRDK		RKDTREKIKE		KERVKEKDRE		KEREREKERE		KEKERGKNKD
RDKEREKDRE		KDKEKDRERE		REKEHEKDRD		KEKEKEQDKE		KEREKDRSKE
IDEKRKKDKK		SRTPPRSYNA		SRRSRSSSRE		RRRRRSRSSS		RSPRTSKTIK
RKSSRSPSPR		SRNKKDKKRE		KERDHISERR		ERERSTSMRK		SSNDRDGKEK
LEKNSTSLKE		KEHNKEPDSS		VSKEVDDKDA		PRTEENKIQH		NGNCQLNEEN
LSTKTEAV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Rappsilber J., Ryder U., Lamond A.I., Mann M. (2002). Large-scale proteomic analysis of the human spliceosome. Genome Res. 12: 1231—1245. PMID 12176931 DOI:10.1101/gr.473902
• Zhang D.L., Sun X.J., Ling L.J., Chen R.S., Ma D.L. (2002). Molecular cloning, characterization, chromosomal assignment, genomic organization and verification of SFRS12(SRrp508), a novel member of human SR protein superfamily and a human homolog of rat SRrp86. Yi Chuan Xue Bao. 29: 377—383. PMID 12043562

Див. також

• Хромосома 5