SSBP4

SSBP4
Ідентифікатори
Символи	SSBP4, single stranded DNA binding protein 4
Зовнішні ІД	OMIM: 607391 MGI: 1924150 HomoloGene: 41881 GeneCards: SSBP4
Онтологія гена Молекулярна функція • single-stranded DNA binding • DNA binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • клітинне ядро Біологічний процес • transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	170463	76900
Ensembl	ENSG00000130511	ENSMUSG00000070003
UniProt	Q9BWG4	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_001009998 NM_032627	NM_133772
RefSeq (білок)	NP_001009998 NP_116016	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 19: 18.42 – 18.43 Mb	Хр. 8: 70.6 – 70.61 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SSBP4 (англ. Single stranded DNA binding protein 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 385 амінокислот, а молекулярна маса — 39 388.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MYAKGGKGSA		VPSDSQAREK		LALYVYEYLL		HIGAQKSAQT		FLSEIRWEKN
ITLGEPPGFL		HSWWCVFWDL		YCAAPDRREA		CEHSGEAKAF		QDYSAAAAPS
PVMGSMAPGD		TMAAGSMAAG		FFQGPPGSQP		SPHNPNAPMM		GPHGQPFMSP
RFPGGPRPTL		RMPSQPPAGL		PGSQPLLPGA		MEPSPRAQGH		PSMGGPMQRV
TPPRGMASVG		PQSYGGGMRP		PPNSLAGPGL		PAMNMGPGVR		GPWASPSGNS
IPYSSSSPGS		YTGPPGGGGP		PGTPIMPSPG		DSTNSSENMY		TIMNPIGQGA
GRANFPLGPG		PEGPMAAMSA		MEPHHVNGSL		GSGDMDGLPK		SSPGAVAGLS
NAPGTPRDDG		EMAAAGTFLH		PFPSESYSPG		MTMSV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Castro P.D., Liang H., Liang J.C., Nagarajan L. (2002). A novel, evolutionarily conserved gene family with putative sequence-specific single-stranded DNA-binding activity. Genomics. 80: 78—85. PMID 12079286 DOI:10.1006/geno.2002.6805
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 19