STAMBPL1

STAMBPL1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2ZNR, 2ZNV
Ідентифікатори
Символи	STAMBPL1, ALMalpha, AMSH-FP, AMSH-LP, bA399O19.2, STAM binding protein like 1
Зовнішні ІД	OMIM: 612352 MGI: 1923880 HomoloGene: 23253 GeneCards: STAMBPL1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0070122 peptidase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity • metallopeptidase activity • зв'язування з іоном металу • Lys63-specific deubiquitinase activity • thiol-dependent deubiquitinase Клітинна компонента • мембрана • гіалоплазма • ендосома Біологічний процес • протеоліз • protein deubiquitination • protein K63-linked deubiquitination Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	57559	76630
Ensembl	ENSG00000138134	ENSMUSG00000024776
UniProt	Q96FJ0	Q76N33
RefSeq (мРНК)	NM_020799	NM_029682 NM_001360716 NM_001360717 NM_001360718 NM_001360719 NM_001360720
RefSeq (білок)	NP_065850	NP_083958 NP_001347645 NP_001347646 NP_001347647 NP_001347648 NP_001347649
Локус (UCSC)	Хр. 10: 88.88 – 88.98 Mb	Хр. 19: 34.17 – 34.22 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

STAMBPL1 (англ. STAM binding protein like 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 436 амінокислот, а молекулярна маса — 49 783.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDQPFTVNSL		KKLAAMPDHT		DVSLSPEERV		RALSKLGCNI		TISEDITPRR
YFRSGVEMER		MASVYLEEGN		LENAFVLYNK		FITLFVEKLP		NHRDYQQCAV
PEKQDIMKKL		KEIAFPRTDE		LKNDLLKKYN		VEYQEYLQSK		NKYKAEILKK
LEHQRLIEAE		RKRIAQMRQQ		QLESEQFLFF		EDQLKKQELA		RGQMRSQQTS
GLSEQIDGSA		LSCFSTHQNN		SLLNVFADQP		NKSDATNYAS		HSPPVNRALT
PAATLSAVQN		LVVEGLRCVV		LPEDLCHKFL		QLAESNTVRG		IETCGILCGK
LTHNEFTITH		VIVPKQSAGP		DYCDMENVEE		LFNVQDQHDL		LTLGWIHTHP
TQTAFLSSVD		LHTHCSYQLM		LPEAIAIVCS		PKHKDTGIFR		LTNAGMLEVS
ACKKKGFHPH		TKEPRLFSIC		KHVLVKDIKI		IVLDLR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, металопротеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку.

Література

• Kikuchi K., Ishii N., Asano H., Sugamura K. (2003). Identification of AMSH-LP containing a Jab1/MPN domain metalloenzyme motif. Biochem. Biophys. Res. Commun. 306: 637—643. PMID 12810066 DOI:10.1016/S0006-291X(03)01009-X
• Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVI. The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 65—73. PMID 10718198 DOI:10.1093/dnares/7.1.65
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 10