SUFU

SUFU
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1M1L, 4BL8, 4BL9, 4BLA, 4BLB, 4BLD, 4KM8, 4KM9, 4KMD, 4KMH
Ідентифікатори
Символи	SUFU, PRO1280, SUFUH, SUFUXL, SUFU negative regulator of hedgehog signaling, JBTS32
Зовнішні ІД	OMIM: 607035 MGI: 1345643 HomoloGene: 9262 GeneCards: SUFU
Пов'язані генетичні захворювання
Joubert syndrome 32, cerebellar medulloblastoma
Онтологія гена Молекулярна функція • beta-catenin binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • transcription factor binding • signal transducer activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein kinase binding Клітинна компонента • гіалоплазма • Війка • ciliary base • ciliary tip • клітинне ядро • цитоплазма Біологічний процес • skeletal system development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • ventricular septum development • smoothened signaling pathway involved in ventral spinal cord interneuron specification • negative regulation of smoothened signaling pathway involved in dorsal/ventral neural tube patterning • spinal cord dorsal/ventral patterning • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • coronary vasculature development • negative regulation of DNA-binding transcription factor activity • negative regulation of osteoblast differentiation • протеоліз • heart looping • aorta development • neural tube closure • determination of left/right symmetry • smoothened signaling pathway involved in spinal cord motor neuron cell fate specification • negative regulation of ubiquitin-dependent protein catabolic process • GO:0072468 сигнальна трансдукція • skin development • multicellular organism development • cytoplasmic sequestering of transcription factor • negative regulation of protein import into nucleus • negative regulation of smoothened signaling pathway Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	51684	24069
Ensembl	ENSG00000107882	ENSMUSG00000025231
UniProt	Q9UMX1	Q9Z0P7
RefSeq (мРНК)	NM_001178133 NM_016169	NM_001025391 NM_015752
RefSeq (білок)	NP_001171604 NP_057253	NP_001020562 NP_056567
Локус (UCSC)	Хр. 10: 102.5 – 102.63 Mb	Хр. 19: 46.39 – 46.48 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SUFU (англ. SUFU negative regulator of hedgehog signaling) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 484 амінокислот, а молекулярна маса — 53 947.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAELRPSGAP		GPTAPPAPGP		TAPPAFASLF		PPGLHAIYGE		CRRLYPDQPN
PLQVTAIVKY		WLGGPDPLDY		VSMYRNVGSP		SANIPEHWHY		ISFGLSDLYG
DNRVHEFTGT		DGPSGFGFEL		TFRLKRETGE		SAPPTWPAEL		MQGLARYVFQ
SENTFCSGDH		VSWHSPLDNS		ESRIQHMLLT		EDPQMQPVQT		PFGVVTFLQI
VGVCTEELHS		AQQWNGQGIL		ELLRTVPIAG		GPWLITDMRR		GETIFEIDPH
LQERVDKGIE		TDGSNLSGVS		AKCAWDDLSR		PPEDDEDSRS		ICIGTQPRRL
SGKDTEQIRE		TLRRGLEINS		KPVLPPINPQ		RQNGLAHDRA		PSRKDSLESD
SSTAIIPHEL		IRTRQLESVH		LKFNQESGAL		IPLCLRGRLL		HGRHFTYKSI
TGDMAITFVS		TGVEGAFATE		EHPYAAHGPW		LQILLTEEFV		EKMLEDLEDL
TSPEEFKLPK		EYSWPEKKLK		VSILPDVVFD		SPLH

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Delattre M., Briand S., Paces-Fessy M., Blanchet-Tournier M.-F. (1999). Suppressor of fused gene involved in hedgehog signal transduction in Drosophila melanogaster is conserved in mammals. Dev. Genes Evol. 209: 294—300. PMID 11252182 DOI:10.1007/s004270050255

Див. також

• Хромосома 10