SUV39H1

SUV39H1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3MTS
Ідентифікатори
Символи	SUV39H1, H3-K9-HMTase 1, KMT1A, MG44, SUV39H, suppressor of variegation 3-9 homolog 1, SUV39H1 histone lysine methyltransferase
Зовнішні ІД	OMIM: 300254 MGI: 1099440 HomoloGene: 2388 GeneCards: SUV39H1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0102674, GO:0102675 methyltransferase activity • transferase activity • histone methyltransferase activity • histone methyltransferase activity (H3-K9 specific) • S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase activity • protein N-terminus binding • zinc ion binding • chromatin binding • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • histone-lysine N-methyltransferase activity Клітинна компонента • Ядерна пластинка • Нуклеоплазма • хромосома • GO:0035328 Гетерохроматин • condensed nuclear chromosome • rDNA heterochromatin • chromatin silencing complex • центромера • клітинне ядро Біологічний процес • диференціація клітин • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • histone H3-K9 dimethylation • ритмічний процес • negative regulation of circadian rhythm • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • histone H3-K9 trimethylation • cellular response to DNA damage stimulus • Метилювання • rDNA heterochromatin assembly • rRNA processing • histone lysine methylation • клітинний цикл • GO:0022415 viral process • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • cellular response to hypoxia • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6839	20937
Ensembl	ENSG00000101945	ENSMUSG00000039231
UniProt	O43463	O54864
RefSeq (мРНК)	NM_003173 NM_001282166	NM_001290716 NM_011514 NM_001358237
RefSeq (білок)	NP_001269095 NP_003164	NP_001277645 NP_035644 NP_001345166
Локус (UCSC)	Хр. X: 48.7 – 48.71 Mb	Хр. X: 7.93 – 7.94 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SUV39H1 (англ. Suppressor of variegation 3-9 homolog 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 412 амінокислот, а молекулярна маса — 47 907.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAENLKGCSV		CCKSSWNQLQ		DLCRLAKLSC		PALGISKRNL		YDFEVEYLCD
YKKIREQEYY		LVKWRGYPDS		ESTWEPRQNL		KCVRILKQFH		KDLERELLRR
HHRSKTPRHL		DPSLANYLVQ		KAKQRRALRR		WEQELNAKRS		HLGRITVENE
VDLDGPPRAF		VYINEYRVGE		GITLNQVAVG		CECQDCLWAP		TGGCCPGASL
HKFAYNDQGQ		VRLRAGLPIY		ECNSRCRCGY		DCPNRVVQKG		IRYDLCIFRT
DDGRGWGVRT		LEKIRKNSFV		MEYVGEIITS		EEAERRGQIY		DRQGATYLFD
LDYVEDVYTV		DAAYYGNISH		FVNHSCDPNL		QVYNVFIDNL		DERLPRIAFF
ATRTIRAGEE		LTFDYNMQVD		PVDMESTRMD		SNFGLAGLPG		SPKKRVRIEC
KCGTESCRKY		LF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, репресорів, регуляторів хроматину, метилтрансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції, клітинний цикл, біологічні ритми, процесинг рРНК, диференціація клітин, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, S-аденозил-L-метіоніном. Локалізований у ядрі, хромосомах, центромерах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Firestein R., Cui X., Huie P., Cleary M.L. (2000). Set domain-dependent regulation of transcriptional silencing and growth control by SUV39H1, a mammalian ortholog of Drosophila Su(var)3-9. Mol. Cell. Biol. 20: 4900—4909. PMID 10848615 DOI:10.1128/MCB.20.13.4900-4909.2000
• Lachner M., O'Carroll D., Rea S., Mechtler K., Jenuwein T. (2001). Methylation of histone H3 lysine 9 creates a binding site for HP1 proteins. Nature. 410: 116—120. PMID 11242053 DOI:10.1038/35065132
• Chakraborty S., Sinha K.K., Senyuk V., Nucifora G. (2003). SUV39H1 interacts with AML1 and abrogates AML1 transactivity. AML1 is methylated in vivo. Oncogene. 22: 5229—5237. PMID 12917624 DOI:10.1038/sj.onc.1206600
• Macaluso M., Cinti C., Russo G., Russo A., Giordano A. (2003). pRb2/p130-E2F4/5-HDAC1-SUV39H1-p300 and pRb2/p130-E2F4/5-HDAC1-SUV39H1-DNMT1 multimolecular complexes mediate the transcription of estrogen receptor-alpha in breast cancer. Oncogene. 22: 3511—3517. PMID 12789259 DOI:10.1038/sj.onc.1206578
• Vassen L., Fiolka K., Moeroey T. (2006). Gfi1b alters histone methylation at target gene promoters and sites of gamma-satellite containing heterochromatin. EMBO J. 25: 2409—2419. PMID 16688220 DOI:10.1038/sj.emboj.7601124

Див. також

• Хромосома X