TCEA1

TCEA1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1TFI, 3NDQ, 5IY7, 5IYA, 5IY6, 5IYB, 5IY8, 5IYC
Ідентифікатори
Символи	TCEA1, GTF2S, SII, TCEA, TF2S, TFIIS, transcription elongation factor A1
Зовнішні ІД	OMIM: 601425 MGI: 1196624 HomoloGene: 55984 GeneCards: TCEA1
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • zinc ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding Клітинна компонента • ядерце • клітинне ядро • Нуклеоплазма • transcription factor TFIID complex Біологічний процес • transcription elongation from RNA polymerase II promoter • transcription-coupled nucleotide-excision repair • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • positive regulation of exoribonuclease activity • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6917	21399
Ensembl	ENSG00000187735	ENSMUSG00000033813
UniProt	P23193	P10711
RefSeq (мРНК)	NM_006756 NM_201437	NM_001159750 NM_001159751 NM_011541
RefSeq (білок)	NP_006747 NP_958845	NP_001153222 NP_001153223 NP_035671
Локус (UCSC)	Хр. 8: 53.97 – 54.02 Mb	Хр. 1: 4.93 – 4.97 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TCEA1 (англ. Transcription elongation factor A1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 301 амінокислот, а молекулярна маса — 33 970.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEDEVVRFAK		KMDKMVQKKN		AAGALDLLKE		LKNIPMTLEL		LQSTRIGMSV
NAIRKQSTDE		EVTSLAKSLI		KSWKKLLDGP		STEKDLDEKK		KEPAITSQNS
PEAREESTSS		GNVSNRKDET		NARDTYVSSF		PRAPSTSDSV		RLKCREMLAA
ALRTGDDYIA		IGADEEELGS		QIEEAIYQEI		RNTDMKYKNR		VRSRISNLKD
AKNPNLRKNV		LCGNIPPDLF		ARMTAEEMAS		DELKEMRKNL		TKEAIREHQM
AKTGGTQTDL		FTCGKCKKKN		CTYTQVQTRS		ADEPMTTFVV		CNECGNRWKF
C

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Chen H.C., England L., Kane C.M. (1992). Characterization of a HeLa cDNA clone encoding the human SII protein, an elongation factor for RNA polymerase II. Gene. 116: 253—258. PMID 1378807 DOI:10.1016/0378-1119(92)90522-Q
• Park H.R., Baek K.H., Jeon C.J., Agarwal K., Yoo O. (1994). Characterization of the gene encoding the human transcriptional elongation factor TFIIS. Gene. 139: 263—267. PMID 8112616 DOI:10.1016/0378-1119(94)90767-6
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment. J. Proteome Res. 7: 5167—5176. PMID 19367720 DOI:10.1021/pr800500r
• Qian X., Jeon C., Yoon H., Agarwal K., Weiss M.A. (1993). Structure of a new nucleic-acid-binding motif in eukaryotic transcriptional elongation factor TFIIS. Nature. 365: 277—279. PMID 7626141 DOI:10.1038/365277a0

Див. також

• Хромосома 8