TDO2

TDO2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4PW8
Ідентифікатори
Символи	TDO2, TDO, TO, TPH2, TRPO, tryptophan 2,3-dioxygenase, HYPTRP
Зовнішні ІД	OMIM: 191070 MGI: 1928486 HomoloGene: 4132 GeneCards: TDO2
Онтологія гена Молекулярна функція • oxygen binding • oxidoreductase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • dioxygenase activity • amino acid binding • зв'язування з іоном металу • identical protein binding • tryptophan 2,3-dioxygenase activity • heme binding Клітинна компонента • гіалоплазма Біологічний процес • tryptophan catabolic process • tryptophan catabolic process to acetyl-CoA • tryptophan metabolic process • tryptophan catabolic process to kynurenine • protein homotetramerization • response to nitroglycerin Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6999	56720
Ensembl	ENSG00000262635 ENSG00000151790	ENSMUSG00000028011
UniProt	P48775	P48776
RefSeq (мРНК)	NM_005651	NM_019911
RefSeq (білок)	NP_005642	NP_064295
Локус (UCSC)	Хр. 4: 155.85 – 155.92 Mb	Хр. 3: 81.86 – 81.88 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TDO2 (англ. Tryptophan 2,3-dioxygenase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 406 амінокислот, а молекулярна маса — 47 872.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSGCPFLGNN		FGYTFKKLPV		EGSEEDKSQT		GVNRASKGGL		IYGNYLHLEK
VLNAQELQSE		TKGNKIHDEH		LFIITHQAYE		LWFKQILWEL		DSVREIFQNG
HVRDERNMLK		VVSRMHRVSV		ILKLLVQQFS		ILETMTALDF		NDFREYLSPA
SGFQSLQFRL		LENKIGVLQN		MRVPYNRRHY		RDNFKGEENE		LLLKSEQEKT
LLELVEAWLE		RTPGLEPHGF		NFWGKLEKNI		TRGLEEEFIR		IQAKEESEEK
EEQVAEFQKQ		KEVLLSLFDE		KRHEHLLSKG		ERRLSYRALQ		GALMIYFYRE
EPRFQVPFQL		LTSLMDIDSL		MTKWRYNHVC		MVHRMLGSKA		GTGGSSGYHY
LRSTVSDRYK		VFVDLFNLST		YLIPRHWIPK		MNPTIHKFLY		TAEYCDSSYF
SSDESD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до оксидоредуктаз. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном заліза, гемом.

Література

• Comings D.E., Muhleman D., Dietz G., Sherman M., Forest G.L. (1995). Sequence of human tryptophan 2,3-dioxygenase (TDO2): presence of a glucocorticoid response-like element composed of a GTT repeat and an intronic CCCCT repeat. Genomics. 29: 390—396. PMID 8666386 DOI:10.1006/geno.1995.9990
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 4