TLR4

TLR4
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4G8A, 2Z62, 2Z63, 2Z65, 2Z66, 3FXI, 3UL7, 3UL8, 3UL9, 3ULA
Ідентифікатори
Символи	TLR4, ARMD10, CD284, TLR-4, TOLL, toll like receptor 4
Зовнішні ІД	OMIM: 603030 MGI: 96824 HomoloGene: 41317 GeneCards: TLR4
Реагує на сполуку
resatorvid
Онтологія гена Молекулярна функція • lipopolysaccharide immune receptor activity • lipopolysaccharide binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • transmembrane signaling receptor activity Клітинна компонента • цитоплазма • мембрана • perinuclear region of cytoplasm • cell surface • integral component of membrane • клітинна мембрана • endosome membrane • intrinsic component of plasma membrane • integral component of plasma membrane • lipopolysaccharide receptor complex • external side of plasma membrane Біологічний процес • positive regulation of MHC class II biosynthetic process • positive regulation of JNK cascade • TRIF-dependent toll-like receptor signaling pathway • cellular response to mechanical stimulus • positive regulation of interleukin-8 production • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade • T-helper 1 type immune response • positive regulation of platelet activation • positive regulation of interleukin-1 production • positive regulation of stress-activated MAPK cascade • positive regulation of NLRP3 inflammasome complex assembly • positive regulation of interleukin-12 production • positive regulation of interferon-alpha production • I-kappaB phosphorylation • positive regulation of nitric-oxide synthase biosynthetic process • positive regulation of B cell proliferation • defense response to bacterium • positive regulation of interleukin-6 production • activation of innate immune response • positive regulation of tumor necrosis factor production • negative regulation of tumor necrosis factor production • вроджений імунітет • negative regulation of interleukin-17 production • I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • positive regulation of interferon-beta production • positive regulation of inflammatory response • toll-like receptor 4 signaling pathway • positive regulation of macrophage cytokine production • positive regulation of interleukin-10 production • процес імунної системи • astrocyte development • intestinal epithelial structure maintenance • positive regulation of nucleotide-binding oligomerization domain containing 1 signaling pathway • response to lipopolysaccharide • cellular response to lipoteichoic acid • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • negative regulation of interleukin-23 production • regulation of inflammatory response • positive regulation of chemokine production • lipopolysaccharide-mediated signaling pathway • detection of fungus • positive regulation of nucleotide-binding oligomerization domain containing 2 signaling pathway • negative regulation of interferon-gamma production • response to bacterium • negative regulation of osteoclast differentiation • B cell proliferation involved in immune response • positive regulation of nitric oxide biosynthetic process • negative regulation of interleukin-6 production • positive regulation of interferon-gamma production • nitric oxide production involved in inflammatory response • MyD88-dependent toll-like receptor signaling pathway • regulation of dendritic cell cytokine production • GO:1901313 positive regulation of gene expression • negative regulation of ERK1 and ERK2 cascade • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • macrophage activation • detection of lipopolysaccharide • cellular response to lipopolysaccharide • positive regulation of lymphocyte proliferation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • MyD88-independent toll-like receptor signaling pathway • GO:0072468 сигнальна трансдукція • inflammatory response • GO:0051636 defense response to Gram-negative bacterium • toll-like receptor signaling pathway • GO:0060554, GO:0060555 Некроптоз • apoptotic signaling pathway • negative regulation of MyD88-independent toll-like receptor signaling pathway Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7099	21898
Ensembl	ENSG00000136869	ENSMUSG00000039005
UniProt	O00206	Q9QUK6
RefSeq (мРНК)	NM_138557 NM_003266 NM_138554 NM_138556	NM_021297
RefSeq (білок)	NP_003257 NP_612564 NP_612567	NP_067272
Локус (UCSC)	Хр. 9: 117.7 – 117.72 Mb	Хр. 4: 66.75 – 66.85 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TLR4 (англ. Toll like receptor 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 839 амінокислот, а молекулярна маса — 95 680.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MMSASRLAGT		LIPAMAFLSC		VRPESWEPCV		EVVPNITYQC		MELNFYKIPD
NLPFSTKNLD		LSFNPLRHLG		SYSFFSFPEL		QVLDLSRCEI		QTIEDGAYQS
LSHLSTLILT		GNPIQSLALG		AFSGLSSLQK		LVAVETNLAS		LENFPIGHLK
TLKELNVAHN		LIQSFKLPEY		FSNLTNLEHL		DLSSNKIQSI		YCTDLRVLHQ
MPLLNLSLDL		SLNPMNFIQP		GAFKEIRLHK		LTLRNNFDSL		NVMKTCIQGL
AGLEVHRLVL		GEFRNEGNLE		KFDKSALEGL		CNLTIEEFRL		AYLDYYLDDI
IDLFNCLTNV		SSFSLVSVTI		ERVKDFSYNF		GWQHLELVNC		KFGQFPTLKL
KSLKRLTFTS		NKGGNAFSEV		DLPSLEFLDL		SRNGLSFKGC		CSQSDFGTTS
LKYLDLSFNG		VITMSSNFLG		LEQLEHLDFQ		HSNLKQMSEF		SVFLSLRNLI
YLDISHTHTR		VAFNGIFNGL		SSLEVLKMAG		NSFQENFLPD		IFTELRNLTF
LDLSQCQLEQ		LSPTAFNSLS		SLQVLNMSHN		NFFSLDTFPY		KCLNSLQVLD
YSLNHIMTSK		KQELQHFPSS		LAFLNLTQND		FACTCEHQSF		LQWIKDQRQL
LVEVERMECA		TPSDKQGMPV		LSLNITCQMN		KTIIGVSVLS		VLVVSVVAVL
VYKFYFHLML		LAGCIKYGRG		ENIYDAFVIY		SSQDEDWVRN		ELVKNLEEGV
PPFQLCLHYR		DFIPGVAIAA		NIIHEGFHKS		RKVIVVVSQH		FIQSRWCIFE
YEIAQTWQFL		SSRAGIIFIV		LQKVEKTLLR		QQVELYRLLS		RNTYLEWEDS
VLGRHIFWRR		LRKALLDGKS		WNPEGTVGTG		CNWQEATSI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до рецепторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, запальна відповідь, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

TLR4 здатний активувати NF-κB.

Література

• Medzhitov R., Preston-Hurlburt P., Janeway C.A. Jr. (1997). A human homologue of the Drosophila Toll protein signals activation of adaptive immunity. Nature. 388: 394—397. PMID 9237759 doi:10.1038/41131
• Rock F.L., Hardiman G., Timans J.C., Kastelein R.A., Bazan J.F. (1998). A family of human receptors structurally related to Drosophila Toll. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95: 588—593. PMID 9435236 doi:10.1073/pnas.95.2.588
• Smirnova I., Poltorak A., Chan E.K.L., McBride C., Beutler B. (2000). Phylogenetic variation and polymorphism at the Toll-like receptor 4 locus (TLR4). Genome Biol. 1: RESEARCH002.1—RESEARCH002.10. PMID 11104518 doi:10.1186/gb-2000-1-1-research002
• Georgel P., Macquin C., Bahram S. (2009). The heterogeneous allelic repertoire of human Toll-Like receptor (TLR) genes. PLoS ONE. 4: E7803—E7803. PMID 19924287 doi:10.1371/journal.pone.0007803
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 doi:10.1110/ps.04682504

Див. також

• Хромосома 9