TLR5

TLR5
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3J0A
Ідентифікатори
Символи	TLR5, MELIOS, SLE1, SLEB1, TIL3, toll like receptor 5
Зовнішні ІД	OMIM: 603031 MGI: 1858171 HomoloGene: 20698 GeneCards: TLR5
Онтологія гена Молекулярна функція • transmembrane signaling receptor activity • interleukin-1 receptor binding Клітинна компонента • integral component of membrane • мембрана • клітинна мембрана Біологічний процес • GO:0032737 positive regulation of cytokine production • GO:0072468 сигнальна трансдукція • positive regulation of toll-like receptor signaling pathway • defense response to bacterium • MyD88-dependent toll-like receptor signaling pathway • toll-like receptor 5 signaling pathway • процес імунної системи • positive regulation of interleukin-8 production • cellular response to mechanical stimulus • вроджений імунітет • inflammatory response Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7100	53791
Ensembl	ENSG00000187554	ENSMUSG00000079164
UniProt	O60602	Q9JLF7
RefSeq (мРНК)	NM_003268	NM_016928
RefSeq (білок)	NP_003259	NP_058624
Локус (UCSC)	Хр. 1: 223.11 – 223.14 Mb	Хр. 1: 182.78 – 182.8 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TLR5 (англ. Toll like receptor 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 858 амінокислот, а молекулярна маса — 97 834.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGDHLDLLLG		VVLMAGPVFG		IPSCSFDGRI		AFYRFCNLTQ		VPQVLNTTER
LLLSFNYIRT		VTASSFPFLE		QLQLLELGSQ		YTPLTIDKEA		FRNLPNLRIL
DLGSSKIYFL		HPDAFQGLFH		LFELRLYFCG		LSDAVLKDGY		FRNLKALTRL
DLSKNQIRSL		YLHPSFGKLN		SLKSIDFSSN		QIFLVCEHEL		EPLQGKTLSF
FSLAANSLYS		RVSVDWGKCM		NPFRNMVLEI		LDVSGNGWTV		DITGNFSNAI
SKSQAFSLIL		AHHIMGAGFG		FHNIKDPDQN		TFAGLARSSV		RHLDLSHGFV
FSLNSRVFET		LKDLKVLNLA		YNKINKIADE		AFYGLDNLQV		LNLSYNLLGE
LYSSNFYGLP		KVAYIDLQKN		HIAIIQDQTF		KFLEKLQTLD		LRDNALTTIH
FIPSIPDIFL		SGNKLVTLPK		INLTANLIHL		SENRLENLDI		LYFLLRVPHL
QILILNQNRF		SSCSGDQTPS		ENPSLEQLFL		GENMLQLAWE		TELCWDVFEG
LSHLQVLYLN		HNYLNSLPPG		VFSHLTALRG		LSLNSNRLTV		LSHNDLPANL
EILDISRNQL		LAPNPDVFVS		LSVLDITHNK		FICECELSTF		INWLNHTNVT
IAGPPADIYC		VYPDSFSGVS		LFSLSTEGCD		EEEVLKSLKF		SLFIVCTVTL
TLFLMTILTV		TKFRGFCFIC		YKTAQRLVFK		DHPQGTEPDM		YKYDAYLCFS
SKDFTWVQNA		LLKHLDTQYS		DQNRFNLCFE		ERDFVPGENR		IANIQDAIWN
SRKIVCLVSR		HFLRDGWCLE		AFSYAQGRCL		SDLNSALIMV		VVGSLSQYQL
MKHQSIRGFV		QKQQYLRWPE		DFQDVGWFLH		KLSQQILKKE		KEKKKDNNIP
LQTVATIS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до рецепторів. Задіяний у таких біологічних процесах як імунітет, вроджений імунітет, запальна відповідь. Локалізований у мембрані.

Література

• Wlasiuk G., Khan S., Switzer W.M., Nachman M.W. (2009). A history of recurrent positive selection at the toll-like receptor 5 in primates. Mol. Biol. Evol. 26: 937—949. PMID 19179655 doi:10.1093/molbev/msp018
• Georgel P., Macquin C., Bahram S. (2009). The heterogeneous allelic repertoire of human Toll-Like receptor (TLR) genes. PLoS ONE. 4: E7803—E7803. PMID 19924287 doi:10.1371/journal.pone.0007803
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Rock F.L., Hardiman G., Timans J.C., Kastelein R.A., Bazan J.F. (1998). A family of human receptors structurally related to Drosophila Toll. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95: 588—593. PMID 9435236 doi:10.1073/pnas.95.2.588
• Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 doi:10.1110/ps.04682504
• Zhou K., Kanai R., Lee P., Wang H.W., Modis Y. (2012). Toll-like receptor 5 forms asymmetric dimers in the absence of flagellin. J. Struct. Biol. 177: 402—409. PMID 22173220 doi:10.1016/j.jsb.2011.12.002

Див. також

• Хромосома 1