TLR6

TLR6
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4OM7
Ідентифікатори
Символи	TLR6, CD286, toll like receptor 6
Зовнішні ІД	OMIM: 605403 MGI: 1341296 HomoloGene: 21223 GeneCards: TLR6
Онтологія гена Молекулярна функція • Toll-like receptor 2 binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • transmembrane signaling receptor activity • ліпопептидний зв'язок • amyloid-beta binding • signaling receptor binding • signaling receptor activity • identical protein binding • protein heterodimerization activity Клітинна компонента • integral component of membrane • phagocytic vesicle membrane • мембрана • integral component of plasma membrane • GO:0016023 цитоплазматичний міхур • комплекс Ґольджі • membrane raft • Toll-like receptor 2-Toll-like receptor 6 protein complex • клітинна мембрана • внутрішньоклітинний • receptor complex Біологічний процес • positive regulation of NLRP3 inflammasome complex assembly • процес імунної системи • positive regulation of JUN kinase activity • cellular response to diacyl bacterial lipopeptide • activation of NF-kappaB-inducing kinase activity • toll-like receptor 6 signaling pathway • defense response to bacterium • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • inflammatory response • toll-like receptor TLR6:TLR2 signaling pathway • detection of diacyl bacterial lipopeptide • GO:0072468 сигнальна трансдукція • вроджений імунітет • T-helper 1 type immune response • MyD88-dependent toll-like receptor signaling pathway • nitric oxide metabolic process • response to bacterial lipoprotein • microglial cell activation • toll-like receptor signaling pathway • cell activation • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • GO:1901313 positive regulation of gene expression • negative regulation of toll-like receptor 2 signaling pathway • TRIF-dependent toll-like receptor signaling pathway • positive regulation of macrophage activation • positive regulation of nitric oxide biosynthetic process • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • cellular response to oxidised low-density lipoprotein particle stimulus • positive regulation of cytokine production involved in inflammatory response • positive regulation of oxidative stress-induced neuron death • positive regulation of reactive oxygen species biosynthetic process • cellular response to amyloid-beta Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10333	21899
Ensembl	ENSG00000174130	ENSMUSG00000051498
UniProt	Q9Y2C9	Q9EPW9
RefSeq (мРНК)	NM_006068 NM_001394553	NM_011604 NM_001359180 NM_001384171
RefSeq (білок)	NP_006059	NP_035734 NP_001346109 NP_001371100
Локус (UCSC)	Хр. 4: 38.82 – 38.86 Mb	Хр. 5: 65.11 – 65.12 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TLR6 (англ. Toll like receptor 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 796 амінокислот, а молекулярна маса — 91 880.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTKDKEPIVK		SFHFVCLMII		IVGTRIQFSD		GNEFAVDKSK		RGLIHVPKDL
PLKTKVLDMS		QNYIAELQVS		DMSFLSELTV		LRLSHNRIQL		LDLSVFKFNQ
DLEYLDLSHN		QLQKISCHPI		VSFRHLDLSF		NDFKALPICK		EFGNLSQLNF
LGLSAMKLQK		LDLLPIAHLH		LSYILLDLRN		YYIKENETES		LQILNAKTLH
LVFHPTSLFA		IQVNISVNTL		GCLQLTNIKL		NDDNCQVFIK		FLSELTRGST
LLNFTLNHIE		TTWKCLVRVF		QFLWPKPVEY		LNIYNLTIIE		SIREEDFTYS
KTTLKALTIE		HITNQVFLFS		QTALYTVFSE		MNIMMLTISD		TPFIHMLCPH
APSTFKFLNF		TQNVFTDSIF		EKCSTLVKLE		TLILQKNGLK		DLFKVGLMTK
DMPSLEILDV		SWNSLESGRH		KENCTWVESI		VVLNLSSNML		TDSVFRCLPP
RIKVLDLHSN		KIKSVPKQVV		KLEALQELNV		AFNSLTDLPG		CGSFSSLSVL
IIDHNSVSHP		SADFFQSCQK		MRSIKAGDNP		FQCTCELREF		VKNIDQVSSE
VLEGWPDSYK		CDYPESYRGS		PLKDFHMSEL		SCNITLLIVT		IGATMLVLAV
TVTSLCIYLD		LPWYLRMVCQ		WTQTRRRARN		IPLEELQRNL		QFHAFISYSE
HDSAWVKSEL		VPYLEKEDIQ		ICLHERNFVP		GKSIVENIIN		CIEKSYKSIF
VLSPNFVQSE		WCHYELYFAH		HNLFHEGSNN		LILILLEPIP		QNSIPNKYHK
LKALMTQRTY		LQWPKEKSKR		GLFWANIRAA		FNMKLTLVTE		NNDVKS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до рецепторів. Задіяний у таких біологічних процесах як імунітет, вроджений імунітет, запальна відповідь, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, цитоплазматичних везикулах, апараті гольджі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Bulut Y., Faure E., Thomas L., Equils O., Arditi M. (2001). Cooperation of Toll-like receptor 2 and 6 for cellular activation by soluble tuberculosis factor and Borrelia burgdorferi outer surface protein A lipoprotein: role of Toll-interacting protein and IL-1 receptor signaling molecules in Toll-like receptor 2 signaling. J. Immunol. 167: 987—994. PMID 11441107 doi:10.4049/jimmunol.167.2.987
• Jang T.H., Park H.H. (2014). Crystal structure of TIR domain of TLR6 reveals novel dimeric interface of TIR-TIR interaction for toll-like receptor signaling pathway. J. Mol. Biol. 426: 3305—3313. PMID 25088687 doi:10.1016/j.jmb.2014.07.024

Див. також

• Хромосома 4