TRAK1

TRAK1
Ідентифікатори
Символи	TRAK1, MILT1, OIP106, trafficking kinesin protein 1, EIEE68, DEE68
Зовнішні ІД	OMIM: 608112 MGI: 1914345 HomoloGene: 25103 GeneCards: TRAK1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GABA receptor binding • TPR domain binding • signaling receptor binding • myosin binding Клітинна компонента • цитоплазма • ендосома • early endosome • мітохондрія • клітинне ядро • axon cytoplasm • дендрит (нейробіологія) • axonal growth cone • perinuclear region of cytoplasm • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • dendrite cytoplasm • cell cortex • мембрана • мітохондріальна мембрана Біологічний процес • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • сортування білків • protein O-linked glycosylation • endosome to lysosome transport • anterograde axonal transport of mitochondrion • axonal transport of mitochondrion • dendrite morphogenesis • positive regulation of axonogenesis • anterograde axonal transport • GO:0034613 protein localization • Нейрогенез • vesicle transport along microtubule • mitochondrion distribution Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	22906	67095
Ensembl	ENSG00000182606	ENSMUSG00000032536
UniProt	Q9UPV9	Q6PD31
RefSeq (мРНК)	NM_001042646 NM_001265608 NM_001265609 NM_001265610 NM_014965 NM_001349245 NM_001349246 NM_001349247 NM_001349248 NM_001349249	NM_175114 NM_001357968 NM_001357969 NM_001357970 NM_001357972 NM_001357973
RefSeq (білок)	NP_001036111 NP_001252537 NP_001252538 NP_001252539 NP_055780 NP_001336174 NP_001336175 NP_001336176 NP_001336177 NP_001336178	NP_780323 NP_001344897 NP_001344898 NP_001344899 NP_001344901 NP_001344902
Локус (UCSC)	Хр. 3: 42.01 – 42.23 Mb	Хр. 9: 121.13 – 121.3 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TRAK1 (англ. Trafficking kinesin protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 953 амінокислот, а молекулярна маса — 106 040.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MALVFQFGQP		VRAQPLPGLC		HGKLIRTNAC		DVCNSTDLPE		VEIISLLEEQ
LPHYKLRADT		IYGYDHDDWL		HTPLISPDAN		IDLTTEQIEE		TLKYFLLCAE
RVGQMTKTYN		DIDAVTRLLE		EKERDLELAA		RIGQSLLKKN		KTLTERNELL
EEQVEHIREE		VSQLRHELSM		KDELLQFYTS		AAEESEPESV		CSTPLKRNES
SSSVQNYFHL		DSLQKKLKDL		EEENVVLRSE		ASQLKTETIT		YEEKEQQLVN
DCVKELRDAN		VQIASISEEL		AKKTEDAARQ		QEEITHLLSQ		IVDLQKKAKA
CAVENEELVQ		HLGAAKDAQR		QLTAELRELE		DKYAECMEML		HEAQEELKNL
RNKTMPNTTS		RRYHSLGLFP		MDSLAAEIEG		TMRKELQLEE		AESPDITHQK
RVFETVRNIN		QVVKQRSLTP		SPMNIPGSNQ		SSAMNSLLSS		CVSTPRSSFY
GSDIGNVVLD		NKTNSIILET		EAADLGNDER		SKKPGTPGTP		GSHDLETALR
RLSLRRENYL		SERRFFEEEQ		ERKLQELAEK		GELRSGSLTP		TESIMSLGTH
SRFSEFTGFS		GMSFSSRSYL		PEKLQIVKPL		EGSATLHHWQ		QLAQPHLGGI
LDPRPGVVTK		GFRTLDVDLD		EVYCLNDFEE		DDTGDHISLP		RLATSTPVQH
PETSAHHPGK		CMSQTNSTFT		FTTCRILHPS		DELTRVTPSL		NSAPTPACGS
TSHLKSTPVA		TPCTPRRLSL		AESFTNTRES		TTTMSTSLGL		VWLLKERGIS
AAVYDPQSWD		RAGRGSLLHS		YTPKMAVIPS		TPPNSPMQTP		TSSPPSFEFK
CTSPPYDNFL		ASKPASSILR		EVREKNVRSS		ESQTDVSVSN		LNLVDKVRRF
GVAKVVNSGR		AHVPTLTEEQ		GPLLCGPPGP		APALVPRGLV		PEGLPLRCPT
VTSAIGGLQL		NSGIRRNRSF		PTMVGSSMQM		KAPVTLTSGI		LMGAKLSKQT
SLR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, мітохондрії, ендосомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Iyer S.P.N., Akimoto Y., Hart G.W. (2003). Identification and cloning of a novel family of coiled-coil domain proteins that interact with O-GlcNAc transferase. J. Biol. Chem. 278: 5399—5409. PMID 12435728 DOI:10.1074/jbc.M209384200
• Brickley K., Smith M.J., Beck M., Stephenson F.A. (2005). GRIF-1 and OIP106, members of a novel gene family of coiled-coil domain proteins: association in vivo and in vitro with kinesin. J. Biol. Chem. 280: 14723—14732. PMID 15644324 DOI:10.1074/jbc.M409095200
• Fransson S., Ruusala A., Aspenstroem P. (2006). The atypical Rho GTPases Miro-1 and Miro-2 have essential roles in mitochondrial trafficking. Biochem. Biophys. Res. Commun. 344: 500—510. PMID 16630562 DOI:10.1016/j.bbrc.2006.03.163
• Webber E., Li L., Chin L.S. (2008). Hypertonia-associated protein Trak1 is a novel regulator of endosome-to-lysosome trafficking. J. Mol. Biol. 382: 638—651. PMID 18675823 DOI:10.1016/j.jmb.2008.07.045

Див. також

• Хромосома 3