TRNT1

TRNT1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1OU5, 4X4W
Ідентифікатори
Символи	TRNT1, CCA1, MtCCA, CGI-47, SIFD, tRNA nucleotidyl transferase 1, RPEM
Зовнішні ІД	OMIM: 612907 MGI: 1917297 HomoloGene: 9333 GeneCards: TRNT1
Пов'язані генетичні захворювання
sideroblastic anemia with B-cell immunodeficiency, periodic fevers, and developmental delay, retinitis pigmentosa and Erythrocytic Microcytosis; RPEM
Онтологія гена Молекулярна функція • CTP:3'-cytidine-tRNA cytidylyltransferase activity • transferase activity • nucleotide binding • tRNA binding • nucleotidyltransferase activity • ATP binding • CTP:tRNA cytidylyltransferase activity • RNA binding • 5'-3' RNA polymerase activity • ATP:3'-cytidine-cytidine-tRNA adenylyltransferase activity Клітинна компонента • мітохондріальний матрикс • внутрішньоклітинний • мітохондрія • Нуклеоплазма Біологічний процес • GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing • tRNA 3'-terminal CCA addition • tRNA processing • tRNA 3'-end processing • mitochondrial tRNA 3'-end processing Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	51095	70047
Ensembl	ENSG00000072756	ENSMUSG00000013736
UniProt	Q96Q11	Q8K1J6
RefSeq (мРНК)	NM_001302946 NM_016000 NM_182916	NM_001242358 NM_001242360 NM_027296
RefSeq (білок)	NP_001289875 NP_886552 NP_001354250 NP_001354251 NP_001354252	NP_001229287 NP_001229289 NP_081572
Локус (UCSC)	Хр. 3: 3.13 – 3.15 Mb	Хр. 6: 106.75 – 106.76 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TRNT1 (англ. TRNA nucleotidyl transferase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 434 амінокислот, а молекулярна маса — 50 128.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLRCLYHWHR		PVLNRRWSRL		CLPKQYLFTM		KLQSPEFQSL		FTEGLKSLTE
LFVKENHELR		IAGGAVRDLL		NGVKPQDIDF		ATTATPTQMK		EMFQSAGIRM
INNRGEKHGT		ITARLHEENF		EITTLRIDVT		TDGRHAEVEF		TTDWQKDAER
RDLTINSMFL		GFDGTLFDYF		NGYEDLKNKK		VRFVGHAKQR		IQEDYLRILR
YFRFYGRIVD		KPGDHDPETL		EAIAENAKGL		AGISGERIWV		ELKKILVGNH
VNHLIHLIYD		LDVAPYIGLP		ANASLEEFDK		VSKNVDGFSP		KPVTLLASLF
KVQDDVTKLD		LRLKIAKEEK		NLGLFIVKNR		KDLIKATDSS		DPLKPYQDFI
IDSREPDATT		RVCELLKYQG		EHCLLKEMQQ		WSIPPFPVSG		HDIRKVGISS
GKEIGALLQQ		LREQWKKSGY		QMEKDELLSY		IKKT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесинг тРНК, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іоном магнію, РНК. Локалізований у мітохондрії.

Література

• Lai C.-H., Chou C.-Y., Ch'ang L.-Y., Liu C.-S., Lin W.-C. (2000). Identification of novel human genes evolutionarily conserved in Caenorhabditis elegans by comparative proteomics. Genome Res. 10: 703—713. PMID 10810093 DOI:10.1101/gr.10.5.703
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Simpson J.C., Wellenreuther R., Poustka A., Pepperkok R., Wiemann S. (2000). Systematic subcellular localization of novel proteins identified by large-scale cDNA sequencing. EMBO Rep. 1: 287—292. PMID 11256614 DOI:10.1093/embo-reports/kvd058
• Lizano E., Schuster J., Muller M., Kelso J., Morl M. (2007). A splice variant of the human CCA-adding enzyme with modified activity. J. Mol. Biol. 366: 1258—1265. PMID 17204286 DOI:10.1016/j.jmb.2006.12.016

Див. також

• Хромосома 3