TSC22D1

TSC22D1
Ідентифікатори
Символи	TSC22D1, Ptg-2, TGFB1I4, TSC22, TSC22 domain family member 1
Зовнішні ІД	OMIM: 607715 MGI: 109127 HomoloGene: 7573 GeneCards: TSC22D1
Пов'язані генетичні захворювання
Васкуліт
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • цитоплазма • клітинне ядро Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8848	21807
Ensembl	ENSG00000102804	ENSMUSG00000022010
UniProt	Q15714	P62500
RefSeq (мРНК)	NM_001243797 NM_001243798 NM_001243799 NM_006022 NM_183422	NM_001177751 NM_009366 NM_207652 NM_001310646 NM_001310647
RefSeq (білок)	NP_001230726 NP_001230727 NP_001230728 NP_006013 NP_904358	NP_001171222 NP_001297575 NP_001297576 NP_033392 NP_997535
Локус (UCSC)	Хр. 13: 44.43 – 44.58 Mb	Хр. 14: 76.65 – 76.75 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TSC22D1 (англ. TSC22 domain family member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 073 амінокислот, а молекулярна маса — 109 677.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MHQPPESTAA		AAAAADISAR		KMAHPAMFPR		RGSGSGSASA		LNAAGTGVGS
NATSSEDFPP		PSLLQPPPPA		ASSTSGPQPP		PPQSLNLLSQ		AQLQAQPLAP
GGTQMKKKSG		FQITSVTPAQ		ISASISSNNS		IAEDTESYDD		LDESHTEDLS
SSEILDVSLS		RATDLGEPER		SSSEETLNNF		QEAETPGAVS		PNQPHLPQPH
LPHLPQQNVV		INGNAHPHHL		HHHHQIHHGH		HLQHGHHHPS		HVAVASASIT
GGPPSSPVSR		KLSTTGSSDS		ITPVAPTSAV		SSSGSPASVM		TNMRAPSTTG
GIGINSVTGT		STVNNVNITA		VGSFNPNVTS		SMLGNVNIST		SNIPSAAGVS
VGPGVTSGVN		VNILSGMGNG		TISSSAAVSS		VPNAAAGMTG		GSVSSQQQQP
TVNTSRFRVV		KLDSSSEPFK		KGRWTCTEFY		EKENAVPATE		GVLINKVVET
VKQNPIEVTS		ERESTSGSSV		SSSVSTLSHY		TESVGSGEMG		APTVVVQQQQ
QQQQQQQQQP		ALQGVTLQQM		DFGSTGPQSI		PAVSIPQSIS		QSQISQVQLQ
SQELSYQQKQ		GLQPVPLQAT		MSAATGIQPS		PVNVVGVTSA		LGQQPSISSL
AQPQLPYSQA		APPVQTPLPG		APPPQQLQYG		QQQPMVSTQM		APGHVKSVTQ
NPASEYVQQQ		PILQTAMSSG		QPSSAGVGAG		TTVIPVAQPQ		GIQLPVQPTA
VPAQPAGASV		QPVGQAPAAV		SAVPTGSQIA		NIGQQANIPT		AVQQPSTQVP
PSVIQQGAPP		SSQVVPPAQT		GIIHQGVQTS		APSLPQQLVI		ASQSSLLTVP
PQPQGVEPVA		QGIVSQQLPA		VSSLPSASSI		SVTSQVSSTG		PSGMPSAPTN
LVPPQNIAQT		PATQNGNLVQ		SVSQPPLIAT		NTNLPLAQQI		PLSSTQFSAQ
SLAQAIGSQI		EDARRAAEPS		LVGLPQTISG		DSGGMSAVSD		GSSSSLAASA
SLFPLKVLPL		TTPLVDGEDE		SSSGASVVAI		DNKIEQAMDL		VKSHLMYAVR
EEVEVLKEQI		KELIEKNSQL		EQENNLLKTL		ASPEQLAQFQ		AQLQTGSPPA
TTQPQGTTQP		PAQPASQGSG		PTA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Ohta S., Shimekake Y., Nagata K. (1996). Molecular cloning and characterization of a transcription factor for the C-type natriuretic peptide gene promoter. Eur. J. Biochem. 242: 460—466. PMID 9022669 DOI:10.1111/j.1432-1033.1996.460rr.x
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Kester H.A., Blanchetot C., den Hertog J., van der Saag P.T., van der Burg B. (1999). Transforming growth factor-beta-stimulated clone-22 is a member of a family of leucine zipper proteins that can homo- and heterodimerize and has transcriptional repressor activity. J. Biol. Chem. 274: 27439—27447. PMID 10488076 DOI:10.1074/jbc.274.39.27439
• Dmitrenko V.V., Garifulin O.M., Shostak E.A., Smikodub A.I., Kavsan V.M. (1996). The characteristics of different types of mRNA expressed in the human brain. Cyt. Genet. 30: 41—47. PMID 9026990

Див. також

• Хромосома 13