TTC3

TTC3
Ідентифікатори
Символи	TTC3, DCRR1, RNF105, TPRDIII, tetratricopeptide repeat domain 3
Зовнішні ІД	OMIM: 602259 MGI: 1276539 HomoloGene: 2487 GeneCards: TTC3
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • transferase activity Клітинна компонента • ядерце • клітинне ядро • гіалоплазма Біологічний процес • protein K48-linked ubiquitination • Убіквітин-залежний протеоліз • ubiquitin-dependent protein catabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7267	22129
Ensembl	ENSG00000182670	ENSMUSG00000040785
UniProt	P53804	O88196
RefSeq (мРНК)	NM_001001894 NM_003316 NM_001320703 NM_001320704 NM_001330681 NM_001330682 NM_001330683 NM_001353936 NM_001353937 NM_001353938	NM_009441
RefSeq (білок)	NP_001001894 NP_001307632 NP_001307633 NP_001317610 NP_001317611 NP_001317612 NP_003307 NP_001340865 NP_001340866 NP_001340867	XP_011249721.1 XP_011249722.1 XP_011249724.1 XP_011249725.1 XP_011249730.1 XP_011249731.1 XP_011249732.1 XP_011249733.1
Локус (UCSC)	Хр. 21: 37.07 – 37.2 Mb	Хр. 16: 94.37 – 94.47 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TTC3 (англ. Tetratricopeptide repeat domain 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 21-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 025 амінокислот, а молекулярна маса — 229 869.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDNFAEGDFT		VADYALLEDC		PHVDDCVFAA		EFMSNDYVRV		TQLYCDGVGV
QYKDYIQSER		NLEFDICSIW		CSKPISVLQD		YCDAIKINIF		WPLLFQHQNS
SVISRLHPCV		DANNSRASEI		NLKKLQHLEL		MEDIVDLAKK		VANDSFLIGG
LLRIGCKIEN		KILAMEEALN		WIKYAGDVTI		LTKLGSIDNC		WPMLSIFFTE
YKYHITKIVM		EDCNLLEELK		TQSCMDCIEE		GELMKMKGNE		EFSKERFDIA
IIYYTRAIEY		RPENYLLYGN		RALCFLRTGQ		FRNALGDGKR		ATILKNTWPK
GHYRYCDALS		MLGEYDWALQ		ANIKAQKLCK		NDPEGIKDLI		QQHVKLQKQI
EDLQGRTANK		DPIKAFYENR		AYTPRSLSAP		IFTTSLNFVE		KERDFRKINH
EMANGGNQNL		KVADEALKVD		DCDCHPEFSP		PSSQPPKHKG		KQKSRNNESE
KFSSSSPLTL		PADLKNILEK		QFSKSSRAAH		QDFANIMKML		RSLIQDGYMA
LLEQRCRSAA		QAFTELLNGL		DPQKIKQLNL		AMINYVLVVY		GLAISLLGIG
QPEELSEAEN		QFKRIIEHYP		SEGLDCLAYC		GIGKVYLKKN		RFLEALNHFE
KARTLIYRLP		GVLTWPTSNV		IIEESQPQKI		KMLLEKFVEE		CKFPPVPDAI
CCYQKCHGYS		KIQIYITDPD		FKGFIRISCC		QYCKIEFHMN		CWKKLKTTTF
NDKIDKDFLQ		GICLTPDCEG		VISKIIIFSS		GGEVKCEFEH		KVIKEKVPPR
PILKQKCSSL		EKLRLKEDKK		LKRKIQKKEA		KKLAQERMEE		DLRESNPPKN
EEQKETVDNV		QRCQFLDDRI		LQCIKQYADK		IKSGIQNTAM		LLKELLSWKV
LSTEDYTTCF		SSRNFLNEAV		DYVIRHLIQE		NNRVKTRIFL		HVLSELKEVE
PKLAAWIQKL		NSFGLDATGT		FFSRYGASLK		LLDFSIMTFL		WNEKYGHKLD
SIEGKQLDYF		SEPASLKEAR		CLIWLLEEHR		DKFPALHSAL		DEFFDIMDSR
CTVLRKQDSG		EAPFSSTKVK		NKSKKKKPKD		SKPMLVGSGT		TSVTSNNEII
TSSEDHSNRN		SDSAGPFAVP		DHLRQDVEEF		EALYDQHSNE		YVVRNKKLWD
MNPKQKCSTL		YDYFSQFLEE		HGPLDMSNKM		FSAEYEFFPE		ETRQILEKAG
GLKPFLLGCP		RFVVIDNCIA		LKKVASRLKK		KRKKKNIKTK		VEEISKAGEY
VRVKLQLNPA		AREFKPDVKS		KPVSDSSSAP		AFENVKPKPV		SANSPKPACE
DVKAKPVSDN		SSRQVSEDGQ		PKGVSSNSPK		PGSEDANYKR		VSCNSPKPVL
EDVKPTYWAQ		SHLVTGYCTY		LPFQRFDITQ		TPPAYINVLP		GLPQYTSIYT
PLASLSPEYQ		LPRSVPVVPS		FVANDRADKN		AAAYFEGHHL		NAENVAGHQI
ASETQILEGS		LGISVKSHCS		TGDAHTVLSE		SNRNDEHCGN		SNNKCEVIPE
STSAVTNIPH		VQMVAIQVSW		NIIHQEVNTE		PYNPFEERQG		EISRIEKEHQ
VLQDQLQEVY		ENYEQIKLKG		LEETRDLEEK		LKRHLEENKI		SKTELDWFLQ
DLEREIKKWQ		QEKKEIQERL		KSLKKKIKKV		SNASEMYTQK		NDGKEKEHEL
HLDQSLEISN		TLTNEKMKIE		EYIKKGKEDY		EESHQRAVAA		EVSVLENWKE
SEVYKLQIME		SQAEAFLKKL		GLISRDPAAY		PDMESDIRSW		ELFLSNVTKE
IEKAKSQFEE		QIKAIKNGSR		LSELSKVQIS		ELSFPACNTV		HPELLPESSG
DDGQGLVTSA		SDVTGNHAAL		HRDPSVFSAG		DSPGEAPSAL		LPGPPPGQPE
ATQLTGPKRA		GQAALSERSP		VADRKQPVPP		GRAARSSQSP		KKPFNSIIEH
LSVVFPCYNS		TELAGFIKKV		RSKNKNSLSG		LSIDEIVQRV		TEHILDEQKK
KKPNPGKDKR		TYEPSSATPV		TRSSQGSPSV		VVAPSPKTKG		QKAEDVPVRI
ALGASSCEIC		HEVFKSKNVR		VLKCGHKYHK		GCFKQWLKGQ		SACPACQGRD
LLTEESPSGR		GWPSQNQELP		SCSSR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

• Tsukahara F., Hattori M., Muraki T., Sakaki Y. (1996). Identification and cloning of a novel cDNA belonging to tetratricopeptide repeat gene family from Down syndrome-critical region 21q22.2. J. Biochem. 120: 820—827. PMID 8947847 DOI:10.1093/oxfordjournals.jbchem.a021485
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 21