UBE2D3

UBE2D3
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1X23, 2FUH, 3L1Z, 3RPG, 3UGB, 4BVU, 4R8P, 4S3O, 5IFR
Ідентифікатори
Символи	UBE2D3, E2(17)KB3, UBC4/5, UBCH5C, ubiquitin conjugating enzyme E2 D3
Зовнішні ІД	OMIM: 602963 MGI: 1913355 HomoloGene: 123914 GeneCards: UBE2D3
шифр КФ	2.3.2.24
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • nucleotide binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • ubiquitin conjugating enzyme activity • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity Клітинна компонента • гіалоплазма • ендосома • мембрана • клітинна мембрана • Нуклеоплазма • endosome membrane • екзосома Біологічний процес • positive regulation of protein targeting to mitochondrion • protein polyubiquitination • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • protein monoubiquitination • BMP signaling pathway • cellular response to DNA damage stimulus • protein K11-linked ubiquitination • TRIF-dependent toll-like receptor signaling pathway • protein K48-linked ubiquitination • regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia • GO:0100026 Репарація ДНК • protein autoubiquitination • GO:0097285 апоптоз • Убіквітин-залежний протеоліз • ubiquitin-dependent protein catabolic process • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • MyD88-independent toll-like receptor signaling pathway Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7323	66105
Ensembl	ENSG00000109332	ENSMUSG00000078578
UniProt	P61077	P61079
RefSeq (мРНК)	NM_001300795 NM_003340 NM_181886 NM_181887 NM_181888 NM_181889 NM_181890 NM_181891 NM_181892 NM_181893	NM_025356
RefSeq (білок)	NP_001287724 NP_003331 NP_871615 NP_871616 NP_871617 NP_871618 NP_871619 NP_871620 NP_871621 NP_871622	NP_079632 NP_001343523 NP_001343524 NP_001343525 NP_001343526 NP_001343527
Локус (UCSC)	Хр. 4: 102.79 – 102.87 Mb	Хр. 3: 135.44 – 135.47 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

UBE2D3 (англ. Ubiquitin conjugating enzyme E2 D3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 147 амінокислот, а молекулярна маса — 16 687.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MALKRINKEL		SDLARDPPAQ		CSAGPVGDDM		FHWQATIMGP		NDSPYQGGVF
FLTIHFPTDY		PFKPPKVAFT		TRIYHPNINS		NGSICLDILR		SQWSPALTIS
KVLLSICSLL		CDPNPDDPLV		PEIARIYKTD		RDKYNRISRE		WTQKYAM

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, пошкодження ДНК, репарація ДНК, убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, ендосомах.

Література

• Jensen J.P., Bates P.W., Yang M., Vierstra R.D., Weissman A.M. (1995). Identification of a family of closely related human ubiquitin conjugating enzymes. J. Biol. Chem. 270: 30408—30414. PMID 8530467 DOI:10.1074/jbc.270.51.30408
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Murata S., Minami Y., Minami M., Chiba T., Tanaka K. (2001). CHIP is a chaperone-dependent E3 ligase that ubiquitylates unfolded protein. EMBO Rep. 2: 1133—1138. PMID 11743028 DOI:10.1093/embo-reports/kve246
• Yogosawa S., Miyauchi Y., Honda R., Tanaka H., Yasuda H. (2003). Mammalian Numb is a target protein of Mdm2, ubiquitin ligase. Biochem. Biophys. Res. Commun. 302: 869—872. PMID 12646252 DOI:10.1016/S0006-291X(03)00282-1
• Polanowska J., Martin J.S., Garcia-Muse T., Petalcorin M.I.R., Boulton S.J. (2006). A conserved pathway to activate BRCA1-dependent ubiquitylation at DNA damage sites. EMBO J. 25: 2178—2188. PMID 16628214 DOI:10.1038/sj.emboj.7601102
• Umebayashi K., Stenmark H., Yoshimori T. (2008). Ubc4/5 and c-Cbl continue to ubiquitinate EGF receptor after internalization to facilitate polyubiquitination and degradation. Mol. Biol. Cell. 19: 3454—3462. PMID 18508924 DOI:10.1091/mbc.E07-10-0988

Див. також

• Хромосома 4