UCHL1

UCHL1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4JKJ, 2ETL, 2LEN, 3IFW, 3IRT, 3KVF, 3KW5, 4DM9
Ідентифікатори
Символи	UCHL1, HEL-117, NDGOA, PARK5, PGP 9.5, PGP9.5, PGP95, Uch-L1, HEL-S-53, ubiquitin C-terminal hydrolase L1, SPG79, UCHL-1
Зовнішні ІД	OMIM: 191342 MGI: 103149 HomoloGene: 37894 GeneCards: UCHL1
Онтологія гена Молекулярна функція • cysteine-type peptidase activity • GO:0070122 peptidase activity • ligase activity • ubiquitin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • alpha-2A adrenergic receptor binding • omega peptidase activity • cysteine-type endopeptidase activity • hydrolase activity • ubiquitin protein ligase binding • thiol-dependent deubiquitinase Клітинна компонента • цитоплазма • мембрана • endoplasmic reticulum membrane • myelin sheath • клітинна мембрана • внутрішньоклітинний • Нуклеоплазма • аксон • neuronal cell body • ендоплазматичний ретикулум • neuron projection terminus • axon cytoplasm • гіалоплазма Біологічний процес • axon target recognition • харчова поведінка • аксоноґенеза • ubiquitin-dependent protein catabolic process • протеоліз • axonal transport of mitochondrion • response to ischemia • neuromuscular process • negative regulation of MAP kinase activity • sensory perception of pain • проліферація • regulation of macroautophagy • adult walking behavior • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • protein deubiquitination Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7345	22223
Ensembl	ENSG00000154277	ENSMUSG00000029223
UniProt	P09936	Q9R0P9
RefSeq (мРНК)	NM_004181	NM_011670
RefSeq (білок)	NP_004172	NP_035800
Локус (UCSC)	Хр. 4: 41.26 – 41.27 Mb	Хр. 5: 66.83 – 66.84 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

UCHL1 (англ. Ubiquitin C-terminal hydrolase L1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 223 амінокислот, а молекулярна маса — 24 824.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MQLKPMEINP		EMLNKVLSRL		GVAGQWRFVD		VLGLEEESLG		SVPAPACALL
LLFPLTAQHE		NFRKKQIEEL		KGQEVSPKVY		FMKQTIGNSC		GTIGLIHAVA
NNQDKLGFED		GSVLKQFLSE		TEKMSPEDRA		KCFEKNEAIQ		AAHDAVAQEG
QCRVDDKVNF		HFILFNNVDG		HLYELDGRMP		FPVNHGASSE		DTLLKDAAKV
CREFTEREQG		EVRFSAVALC		KAA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, лігаз, тіолових протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як убіквітинування білків, поліморфізм. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Day I.N.M., Hinks L.J., Thompson R.J. (1990). The structure of the human gene encoding protein gene product 9.5 (PGP9.5), a neuron-specific ubiquitin C-terminal hydrolase. Biochem. J. 268: 521—524. PMID 2163617 DOI:10.1042/bj2680521
• Day I.N.M., Thompson R.J. (1987). Molecular cloning of cDNA coding for human PGP 9.5 protein. A novel cytoplasmic marker for neurones and neuroendocrine cells. FEBS Lett. 210: 157—160. PMID 2947814 DOI:10.1016/0014-5793(87)81327-3
• Honore B., Rasmussen H.H., Vandekerckhove J., Celis J.E. (1991). Neuronal protein gene product 9.5 (IEF SSP 6104) is expressed in cultured human MRC-5 fibroblasts of normal origin and is strongly down-regulated in their SV40 transformed counterparts. FEBS Lett. 280: 235—240. PMID 1849484 DOI:10.1016/0014-5793(91)80300-R
• Larsen C.N., Price J.S., Wilkinson K.D. (1996). Substrate binding and catalysis by ubiquitin C-terminal hydrolases: identification of two active site residues. Biochemistry. 35: 6735—6744. PMID 8639624 DOI:10.1021/bi960099f
• Wada H., Kito K., Caskey L.S., Yeh E.T.H., Kamitani T. (1998). Cleavage of the C-terminus of NEDD8 by UCH-L3. Biochem. Biophys. Res. Commun. 251: 688—692. PMID 9790970 DOI:10.1006/bbrc.1998.9532

Див. також

• Хромосома 4