USP6NL

USP6NL
Ідентифікатори
Символи	USP6NL, RNTRE, TRE2NL, USP6NL-IT1, USP6 N-terminal like
Зовнішні ІД	OMIM: 605405 MGI: 2138893 HomoloGene: 6879 GeneCards: USP6NL
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity Клітинна компонента • клітинна мембрана • комплекс Ґольджі • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • гіалоплазма • система ендомембран • trans-Golgi network membrane Біологічний процес • regulation of cilium assembly • retrograde transport, plasma membrane to Golgi • regulation of Golgi organization • Golgi organization • plasma membrane to endosome transport • GO:0032861, GO:0032862, GO:0032856 activation of GTPase activity • regulation of vesicle fusion • intracellular protein transport • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9712	98910
Ensembl	ENSG00000148429	ENSMUSG00000039046
UniProt	Q92738	Q80XC3
RefSeq (мРНК)	NM_001080491 NM_014688 NM_001391959 NM_001391960 NM_001391961	NM_001080548 NM_181399
RefSeq (білок)	NP_001073960 NP_055503	NP_001074017 NP_852064
Локус (UCSC)	Хр. 10: 11.46 – 11.61 Mb	Хр. 2: 6.33 – 6.45 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

USP6NL (англ. USP6 N-terminal like) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 828 амінокислот, а молекулярна маса — 94 104.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MNSDQDVALK		LAQERAEIVA		KYDRGREGAE		IEPWEDADYL		VYKVTDRFGF
LHEEELPDHN		VAVERQKHLE		IERTTKWLKM		LKGWEKYKNT		EKFHRRIYKG
IPLQLRGEVW		ALLLEIPKMK		EETRDLYSKL		KHRARGCSPD		IRQIDLDVNR
TFRDHIMFRD		RYGVKQQSLF		HVLAAYSIYN		TEVGYCQGMS		QITALLLMYM
NEEDAFWALV		KLFSGPKHAM		HGFFVQGFPK		LLRFQEHHEK		ILNKFLSKLK
QHLDSQEIYT		SFYTMKWFFQ		CFLDRTPFTL		NLRIWDIYIF		EGERVLTAMS
YTILKLHKKH		LMKLSMEELV		EFFQETLAKD		FFFEDDFVIE		QLQISMTELK
RAKLDLPEPG		KEDEYPKKPL		GQLPPELQSW		GVHHLSNGQR		SVGRPSPLAS
GRRESGAPHR		RHEHSPHPQS		RTGTPERAQP		PRRKSVEEES		KKLKDEADFQ
RKLPSGPQDS		SRQYNHAAAN		QNSNATSNIR		KEFVPKWNKP		SDVSATERTA
KYTMEGKGRA		AHPALAVTVP		GPAEVRVSNV		RPKMKALDAE		DGKRGSTASQ
YDNVPGPELD		SGASVEEALE		RAYSQSPRHA		LYPPSPRKHA		EPSSSPSKVS
NKFTFKVQPP		SHARYPSQLD		GEARGLAHPP		SYSNPPVYHG		NSPKHFPTAN
SSFASPQFSP		GTQLNPSRRP		HGSTLSVSAS		PEKSYSRPSP		LVLPSSRIEV
LPVDTGAGGY		SGNSGSPKNG		KLIIPPVDYL		PDNRTWSEVS		YTYRPETQGQ
SWTRDASRGN		LPKYSAFQLA		PFQDHGLPAV		SVDSPVRYKA		SPAAEDASPS
GYPYSGPPPP		AYHYRNRDGL		SIQESVLL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів гтфаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазматичних везикулах, апараті гольджі.

Література

• Ishibashi K., Kanno E., Itoh T., Fukuda M. (2009). Identification and characterization of a novel Tre-2/Bub2/Cdc16 (TBC) protein that possesses Rab3A-GAP activity. Genes Cells. 14: 41—52. PMID 19077034 DOI:10.1111/j.1365-2443.2008.01251.x
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Bonaldo M.F., Lennon G., Soares M.B. (1996). Normalization and subtraction: two approaches to facilitate gene discovery. Genome Res. 6: 791—806. PMID 8889548 DOI:10.1101/gr.6.9.791

Див. також

• Хромосома 10