UTP20

UTP20
Ідентифікатори
Символи	UTP20, DRIM, 1A6/DRIM, small subunit processome component, UTP20 small subunit processome component
Зовнішні ІД	OMIM: 612822 MGI: 1917933 HomoloGene: 38373 GeneCards: UTP20
Пов'язані генетичні захворювання
alcohol dependence
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • preribosome, small subunit precursor • small-subunit processome • ядерце • клітинне ядро • 90S preribosome • Нуклеоплазма • клітинна мембрана Біологічний процес • endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) • endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) • endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) • negative regulation of cell population proliferation • maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) • rRNA processing Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	27340	70683
Ensembl	ENSG00000120800	ENSMUSG00000004356
UniProt	O75691	Q5XG71
RefSeq (мРНК)	NM_014503	NM_175158
RefSeq (білок)	NP_055318	NP_780367
Локус (UCSC)	Хр. 12: 101.28 – 101.39 Mb	Хр. 10: 88.58 – 88.66 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

UTP20 (англ. UTP20, small subunit processome component) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 785 амінокислот, а молекулярна маса — 318 385.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKTKPVSHKT		ENTYRFLTFA		ERLGNVNIDI		IHRIDRTASY		EEEVETYFFE
GLLKWRELNL		TEHFGKFYKE		VIDKCQSFNQ		LVYHQNEIVQ		SLKTHLQVKN
SFAYQPLLDL		VVQLARDLQM		DFYPHFPEFF		LTITSILETQ		DTELLEWAFT
SLSYLYKYLW		RLMVKDMSSI		YSMYSTLLAH		KKLHIRNFAA		ESFTFLMRKV
SDKNALFNLM		FLDLDKHPEK		VEGVGQLLFE		MCKGVRNMFH		SCTGQAVKLI
LRKLGPVTET		ETQLPWMLIG		ETLKNMVKST		VSYISKEHFG		TFFECLQESL
LDLHTKVTKT		NCCESSEQIK		RLLETYLILV		KHGSGTKIPT		PADVCKVLSQ
TLQVASLSTS		CWETLLDVIS		ALILGENVSL		PETLIKETIE		KIFESRFEKR
LIFSFSEVMF		AMKQFEQLFL		PSFLSYIVNC		FLIDDAVVKD		EALAILAKLI
LNKAAPPTAG		SMAIEKYPLV		FSPQMVGFYI		KQKKTRSKGR		NEQFPVLDHL
LSIIKLPPNK		DTTYLSQSWA		ALVVLPHIRP		LEKEKVIPLV		TGFIEALFMT
VDKGSFGKGN		LFVLCQAVNT		LLSLEESSEL		LHLVPVERVK		NLVLTFPLEP
SVLLLTDLYY		QRLALCGCKG		PLSQEALMEL		FPKLQANIST		GVSKIRLLTI
RILNHFDVQL		PESMEDDGLS		ERQSVFAILR		QAELVPATVN		DYREKLLHLR
KLRHDVVQTA		VPDGPLQEVP		LRYLLGMLYI		NFSALWDPVI		ELISSHAHEM
ENKQFWKVYY		EHLEKAATHA		EKELQNDMTD		EKSVGDESWE		QTQEGDVGAL
YHEQLALKTD		CQERLDHTNF		RFLLWRALTK		FPERVEPRSR		ELSPLFLRFI
NNEYYPADLQ		VAPTQDLRRK		GKGMVAEEIE		EEPAAGDDEE		LEEEAVPQDE
SSQKKKTRRA		AAKQLIAHLQ		VFSKFSNPRA		LYLESKLYEL		YLQLLLHQDQ
MVQKITLDCI		MTYKHPHVLP		YRENLQRLLE		DRSFKEEIVH		FSISEDNAVV
KTAHRADLFP		ILMRILYGRM		KNKTGSKTQG		KSASGTRMAI		VLRFLAGTQP
EEIQIFLDLL		FEPVRHFKNG		ECHSAVIQAV		EDLDLSKVLP		LGRQHGILNS
LEIVLKNISH		LISAYLPKIL		QILLCMTATV		SHILDQREKI		QLRFINPLKN
LRRLGIKMVT		DIFLDWESYQ		FRTEEIDAVF		HGAVWPQISR		LGSESQYSPT
PLLKLISIWS		RNARYFPLLA		KQKPGHPECD		ILTNVFAILS		AKNLSDATAS
IVMDIVDDLL		NLPDFEPTET		VLNLLVTGCV		YPGIAENIGE		SITIGGRLIL
PHVPAILQYL		SKTTISAEKV		KKKKNRAQVS		KELGILSKIS		KFMKDKEQSS
VLITLLLPFL		HRGNIAEDTE		VDILVTVQNL		LKHCVDPTSF		LKPIAKLFSV
IKNKLSRKLL		CTVFETLSDF		ESGLKYITDV		VKLNAFDQRH		LDDINFDVRF
ETFQTITSYI		KEMQIVDVNY		LIPVMHNCFY		NLELGDMSLS		DNASMCLMSI
IKKLAALNVT		EKDYREIIHR		SLLEKLRKGL		KSQTESIQQD		YTTILSCLIQ
TFPNQLEFKD		LVQLTHYHDP		EMDFFENMKH		IQIHRRARAL		KKLAKQLMEG
KVVLSSKSLQ		NYIMPYAMTP		IFDEKMLKHE		NITTAATEII		GAICKHLSWS
AYMYYLKHFI		HVLQTGQINQ		KLGVSLLVIV		LEAFHFDHKT		LEEQMGKIEN
EENAIEAIEL		PEPEAMELER		VDEEEKEYTC		KSLSDNGQPG		TPDPADSGGT
SAKESECITK		PVSFLPQNKE		EIERTIKNIQ		GTITGDILPR		LHKCLASTTK
REEEHKLVKS		KVVNDEEVVR		VPLAFAMVKL		MQSLPQEVME		ANLPSILLKV
CALLKNRAQE		IRDIARSTLA		KIIEDLGVHF		LLYVLKELQT		TLVRGYQVHV
LTFTVHMLLQ		GLTNKLQVGD		LDSCLDIMIE		IFNHELFGAV		AEEKEVKQIL
SKVMEARRSK		SYDSYEILGK		FVGKDQVTKL		ILPLKEILQN		TTSLKLARKV
HETLRRITVG		LIVNQEMTAE		SILLLSYGLI		SENLPLLTEK		EKNPVAPAPD
PRLPPQSCLL		LPPTPVRGGQ		KAVVSRKTNM		HIFIESGLRL		LHLSLKTSKI
KSSGECVLEM		LDPFVSLLID		CLGSMDVKVI		TGALQCLIWV		LRFPLPSIET
KAEQLTKHLF		LLLKDYAKLG		AARGQNFHLV		VNCFKCVTIL		VKKVKSYQIT
EKQLQVLLAY		AEEDIYDTSR		QATAFGLLKA		ILSRKLLVPE		IDEVMRKVSK
LAVSAQSEPA		RVQCRQVFLK		YILDYPLGDK		LRPNLEFMLA		QLNYEHETGR
ESTLEMIAYL		FDTFPQGLLH		ENCGMFFIPL		CLMTINDDSA		TCKKMASMTI
KSLLGKISLE		KKDWLFDMVT		TWFGAKKRLN		RQLAALICGL		FVESEGVDFE
KRLGTVLPVI		EKEIDPENFK		DIMEETEEKA		ADRLLFSFLT		LITKLIKECN
IIQFTKPAET		LSKIWSHVHS		HLRHPHNWVW		LTAAQIFGLL		FASCQPEELI
QKWNTKKTKK		HLPEPVAIKF		LASDLDQKMK		SISLASCHQL		HSKFLDQSLG
EQVVKNLLFA		AKVLYLLELY		CEDKQSKIKE		DLEEQEALED		GVACADEKAE
SDGEEKEEVK		EELGRPATLL		WLIQKLSRIA		KLEAAYSPRN		PLKRTCIFKF
LGAVAMDLGI		DKVKPYLPMI		IAPLFRELNS		TYSEQDPLLK		NLSQEIIELL
KKLVGLESFS		LAFASVQKQA		NEKRALRKKR		KALEFVTNPD		IAAKKKMKKH
KNKSEAKKRK		IEFLRPGYKA		KRQKSHSLKD		LAMVE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як процесмнг рРНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Liu J., Du X., Ke Y. (2006). Mapping nucleolar localization sequences of 1A6/DRIM. FEBS Lett. 580: 1405—1410. PMID 16458307 DOI:10.1016/j.febslet.2006.01.064
• Schwirzke M., Gnirke A., Bork P., Tarin D., Weidle U.H. (1998). Differential gene expression in mammary carcinoma cell lines: identification of DRIM, a new gene down-regulated in metastasis. Anticancer Res. 18: 1409—1421. PMID 9673349

Див. також

• Хромосома 12