VPS8

VPS8
Ідентифікатори
Символи	VPS8, KIAA0804, CORVET complex subunit
Зовнішні ІД	OMIM: 618366 MGI: 2146407 HomoloGene: 44592 GeneCards: VPS8
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу Клітинна компонента • CORVET complex • early endosome • ендосома Біологічний процес • endosomal vesicle fusion • protein transport Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23355	209018
Ensembl	ENSG00000156931	ENSMUSG00000033653
UniProt	Q8N3P4	Q0P5W1
RefSeq (мРНК)	NM_001009921 NM_015303	NM_001081366 NM_001285893 NM_001285894 NM_145948
RefSeq (білок)	NP_001009921 NP_056118 NP_001336221 NP_001336222 NP_001336223 NP_001336224 NP_001336225 NP_001336226 NP_001336227	NP_001272822 NP_001272823 NP_001074835
Локус (UCSC)	н/д	Хр. 16: 21.24 – 21.46 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

VPS8 (англ. VPS8, CORVET complex subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 3-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 428 амінокислот, а молекулярна маса — 161 754.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MENEPDHENV		EQSLCAKTSE		EELNKSFNLE		ASLSKFSYID		MDKELEFKND
LIDDKEFDIP		QVDTPPTLES		ILNETDDEDE		SFILEDPTLL		NIDTIDSHSY
DTSSVASSDS		GDRTNLKRKK		KLPDSFSLHG		SVMRHSLLKG		ISAQIVSAAD
KVDAGLPTAI		AVSSLIAVGT		SHGLALIFGK		DQNQALRLCL		GSTSVGGQYG
AISALSINND		CSRLLCGFAK		GQITMWDLAS		GKLLRSITDA		HPPGTAILHI
KFTDDPTLAI		CNDSGGSVFE		LTFKRVMGVR		TCESRCLFSG		SKGEVCCIEP
LHSKPELKDH		PITQFSLLAM		ASLTKILVIG		LKPSLKVWMT		FPYGRMDPSS
VPLLAWHFVA		VQNYVNPMLA		FCRGDVVHFL		LVKRDESGAI		HVTKQKHLHL
YYDLINFTWI		NSRTVVLLDS		VEKLHVIDRQ		TQEELETVEI		SEVQLVYNSS
HFKSLATGGN		VSQALALVGE		KACYQSISSY		GGQIFYLGTK		SVYVMMLRSW
RERVDHLLKQ		DCLTEALALA		WSFHEGKAKA		VVGLSGDASK		RKAIVADRMV
EILFHYADRA		LKKCPDQGKI		QVMEQHFQDM		VPVIVDYCLL		LQRKDLLFSQ
MYDKLSENSV		AKGVFLECLE		PYILSDKLVG		ITPQVMKDLI		VHFQDKKLME
NVEALIVHMD		ITSLDIQQVV		LMCWENRLYD		AMIYVYNRGM		NEFISPMEKL
FRVIAPPLNA		GKTLTDEQVV		MGNKLLVYIS		CCLAGRAYPL		GDIPEDLVPL
VKNQVFEFLI		RLHSAEASPE		EEIYPYIRTL		LHFDTREFLN		VLALTFEDFK
NDKQAVEYQQ		RIVDILLKVM		VENSDFTPSQ		VGCLFTFLAR		QLAKPDNTLF
VNRTLFDQVL		EFLCSPDDDS		RHSERQQVLL		ELLQAGGIVQ		FEESRLIRMA
EKAEFYQICE		FMYEREHQYD		KIIDCYLRDP		LREEEVFNYI		HNILSIPGHS
AEEKQSVWQK		AMDHIEELVS		LKPCKAAELV		ATHFSGHIET		VIKKLQNQVL
LFKFLRSLLD		PREGIHVNQE		LLQISPCITE		QFIELLCQFN		PTQVIETLQV
LECYRLEETI		QITQKYQLHE		VTAYLLEKKG		DIHGAFLIML		ERLQSKLQEV
THQGENTKED		PSLKDVEDTM		VETIALCQRN		SHNLNQQQRE		ALWFPLLEAM
MAPQKLSSSA		IPHLHSEALK		SLTMQVLNSM		AAFIALPSIL		QRILQDPVYG
KGKLGEIQGL		ILGMLDTFNY		EQTLLETTTS		LLNQDLHWSL		CNLRASVTRG
LNPKQDYCSI		CLQQYKRRQE		MADEIIVFSC		GHLYHSFCLQ		NKECTVEFEG
QTRWTCYKCS		SSNKVGKLSE		NSSEIKKGRI		TPSQVKMSPS		YHQSKGDPTA
KKGTSEPVLD		PQQIQAFDQL		CRLYRGSSRL		ALLTELSQNR		SSESYRPFSG
SQSAPAFNSI		FQNENFQLQL		IPPPVTED

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ендосомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Perini E.D., Schaefer R., Stoeter M., Kalaidzidis Y., Zerial M. (2014). Mammalian CORVET is required for fusion and conversion of distinct early endosome subpopulations. Traffic. 15: 1366—1389. PMID 25266290 DOI:10.1111/tra.12232

Див. також

• Хромосома 3