VTA1

VTA1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2LXL, 2LXM, 4TXP, 4TXQ, 4TXR, 4U7E
Ідентифікатори
Символи	VTA1, C6orf55, DRG-1, DRG1, LIP5, My012, SBP1, HSPC228, vesicle trafficking 1, 6orf55
Зовнішні ІД	OMIM: 610902 MGI: 1913451 HomoloGene: 6473 GeneCards: VTA1
Онтологія гена Молекулярна функція • protein C-terminus binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • ендосома • endosome membrane • екзосома • мембрана • Нуклеоплазма • внутрішньоклітинна мембранна органела Біологічний процес • protein transport • endosomal transport • multivesicular body assembly • GO:0019067 viral life cycle • multivesicular body sorting pathway • ESCRT III complex disassembly • macroautophagy • GO:0015915 транспорт Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	51534	66201
Ensembl	ENSG00000009844	ENSMUSG00000019868
UniProt	Q9NP79	Q9CR26
RefSeq (мРНК)	NM_016485 NM_001286371 NM_001286372	NM_025418
RefSeq (білок)	NP_001273300 NP_001273301 NP_057569	NP_079694
Локус (UCSC)	Хр. 6: 142.15 – 142.22 Mb	Хр. 10: 14.53 – 14.58 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

VTA1 (англ. Vesicle trafficking 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 307 амінокислот, а молекулярна маса — 33 879.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAALAPLPPL		PAQFKSIQHH		LRTAQEHDKR		DPVVAYYCRL		YAMQTGMKID
SKTPECRKFL		SKLMDQLEAL		KKQLGDNEAI		TQEIVGCAHL		ENYALKMFLY
ADNEDRAGRF		HKNMIKSFYT		ASLLIDVITV		FGELTDENVK		HRKYARWKAT
YIHNCLKNGE		TPQAGPVGIE		EDNDIEENED		AGAASLPTQP		TQPSSSSTYD
PSNMPSGNYT		GIQIPPGAHA		PANTPAEVPH		STGVASNTIQ		PTPQTIPAID
PALFNTISQG		DVRLTPEDFA		RAQKYCKYAG		SALQYEDVST		AVQNLQKALK
LLTTGRE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, ендосомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Shim S., Merrill S.A., Hanson P.I. (2008). Novel interactions of ESCRT-III with LIP5 and VPS4 and their implications for ESCRT-III disassembly. Mol. Biol. Cell. 19: 2661—2672. PMID 18385515 DOI:10.1091/mbc.E07-12-1263
• Kuang Z., Seo E.J., Leis J. (2011). Mechanism of inhibition of retrovirus release from cells by interferon-induced gene ISG15. J. Virol. 85: 7153—7161. PMID 21543490 DOI:10.1128/JVI.02610-10

Див. також

• Хромосома 6