WIPI2

WIPI2
Ідентифікатори
Символи	WIPI2, ATG18B, Atg21, WIPI-2, CGI-50, WD repeat domain, phosphoinositide interacting 2, IDDSSA
Зовнішні ІД	OMIM: 609225 MGI: 1923831 HomoloGene: 90887 GeneCards: WIPI2
Онтологія гена Молекулярна функція • phosphatidylinositol-5-phosphate binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • phosphatidylinositol-3-phosphate binding • phosphatidylinositol-3,5-bisphosphate binding • lipid binding Клітинна компонента • autophagosome • гіалоплазма • phagophore assembly site membrane • мембрана • phagophore assembly site • extrinsic component of membrane • Нуклеоплазма • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • Автофагія • GO:0000046 autophagosome maturation • macroautophagy • autophagosome assembly • autophagy of mitochondrion • protein lipidation • autophagy of nucleus • protein localization to phagophore assembly site • protein lipidation involved in autophagosome assembly • xenophagy • cellular response to starvation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	26100	74781
Ensembl	ENSG00000157954	ENSMUSG00000029578
UniProt	Q9Y4P8	Q80W47
RefSeq (мРНК)	NM_001033518 NM_001033519 NM_001033520 NM_001278299 NM_015610 NM_016003	NM_178398
RefSeq (білок)	NP_001028690 NP_001028691 NP_001028692 NP_001265228 NP_056425 NP_057087 NP_056425.1	NP_848485
Локус (UCSC)	Хр. 7: 5.19 – 5.23 Mb	Хр. 5: 142.61 – 142.66 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

WIPI2 (англ. WD repeat domain, phosphoinositide interacting 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 454 амінокислот, а молекулярна маса — 49 408.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MNLASQSGEA		GAGQLLFANF		NQDNTEVKGA		SRAAGLGRRA		VVWSLAVGSK
SGYKFFSLSS		VDKLEQIYEC		TDTEDVCIVE		RLFSSSLVAI		VSLKAPRKLK
VCHFKKGTEI		CNYSYSNTIL		AVKLNRQRLI		VCLEESLYIH		NIRDMKVLHT
IRETPPNPAG		LCALSINNDN		CYLAYPGSAT		IGEVQVFDTI		NLRAANMIPA
HDSPLAALAF		DASGTKLATA		SEKGTVIRVF		SIPEGQKLFE		FRRGVKRCVS
ICSLAFSMDG		MFLSASSNTE		TVHIFKLETV		KEKPPEEPTT		WTGYFGKVLM
ASTSYLPSQV		TEMFNQGRAF		ATVRLPFCGH		KNICSLATIQ		KIPRLLVGAA
DGYLYMYNLD		PQEGGECALM		KQHRLDGSLE		TTNEILDSAS		HDCPLVTQTY
GAAAGKGTYV		PSSPTRLAYT		DDLGAVGGAC		LEDEASALRL		DEDSEHPPMI
LRTD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як автофагія, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані.

Література

• Lai C.-H., Chou C.-Y., Ch'ang L.-Y., Liu C.-S., Lin W.-C. (2000). Identification of novel human genes evolutionarily conserved in Caenorhabditis elegans by comparative proteomics. Genome Res. 10: 703—713. PMID 10810093 DOI:10.1101/gr.10.5.703
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Proikas-Cezanne T., Robenek H. (2011). Freeze-fracture replica immunolabelling reveals human WIPI-1 and WIPI-2 as membrane proteins of autophagosomes. J. Cell. Mol. Med. 15: 2007—2010. PMID 21564513 DOI:10.1111/j.1582-4934.2011.01339.x

Див. також

• Хромосома 7