XYLB

XYLB
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4BC2, 4BC3, 4BC4, 4BC5
Ідентифікатори
Символи	XYLB, xylulokinase
Зовнішні ІД	OMIM: 604049 MGI: 2142985 HomoloGene: 3746 GeneCards: XYLB
Онтологія гена Молекулярна функція • phosphotransferase activity, alcohol group as acceptor • transferase activity • nucleotide binding • ATP binding • kinase activity • xylulokinase activity Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • xylulose metabolic process • generation of precursor metabolites and energy • фосфорилювання • xylulose catabolic process • D-xylose metabolic process • glucuronate catabolic process to xylulose 5-phosphate • carbohydrate phosphorylation • carbohydrate metabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9942	102448
Ensembl	ENSG00000093217	ENSMUSG00000035769
UniProt	O75191	Q3TNA1
RefSeq (мРНК)	NM_005108 NM_001349178 NM_001349179 NM_001349180	NM_001033209 NM_001199568 NM_001359699
RefSeq (білок)	NP_005099 NP_001336107 NP_001336108 NP_001336109	NP_001028381 NP_001186497 NP_001346628
Локус (UCSC)	Хр. 3: 38.35 – 38.42 Mb	Хр. 9: 119.19 – 119.22 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

XYLB (англ. Xylulokinase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 3-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 536 амінокислот, а молекулярна маса — 58 382.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAEHAPRRCC		LGWDFSTQQV		KVVAVDAELN		VFYEESVHFD		RDLPEFGTQG
GVHVHKDGLT		VTSPVLMWVQ		ALDIILEKMK		ASGFDFSQVL		ALSGAGQQHG
SIYWKAGAQQ		ALTSLSPDLR		LHQQLQDCFS		ISDCPVWMDS		STTAQCRQLE
AAVGGAQALS		CLTGSRAYER		FTGNQIAKIY		QQNPEAYSHT		ERISLVSSFA
ASLFLGSYSP		IDYSDGSGMN		LLQIQDKVWS		QACLGACAPH		LEEKLSPPVP
SCSVVGAISS		YYVQRYGFPP		GCKVVAFTGD		NPASLAGMRL		EEGDIAVSLG
TSDTLFLWLQ		EPMPALEGHI		FCNPVDSQHY		MALLCFKNGS		LMREKIRNES
VSRSWSDFSK		ALQSTEMGNG		GNLGFYFDVM		EITPEIIGRH		RFNTENHKVA
AFPGDVEVRA		LIEGQFMAKR		IHAEGLGYRV		MSKTKILATG		GASHNREILQ
VLADVFDAPV		YVIDTANSAC		VGSAYRAFHG		LAGGTDVPFS		EVVKLAPNPR
LAATPSPGAS		QVYEALLPQY		AKLEQRILSQ		TRGPPE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ. Задіяний у таких біологічних процесах, як вуглеводний обмін, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Bunker R.D., Bulloch E.M., Dickson J.M., Loomes K.M., Baker E.N. (2013). Structure and function of human xylulokinase, an enzyme with important roles in carbohydrate metabolism. J. Biol. Chem. 288: 1643—1652. PMID 23179721 DOI:10.1074/jbc.M112.427997
• Tamari M., Daigo Y., Ishikawa S., Nakamura Y. (1998). Genomic structure of a novel human gene (XYLB) on chromosome 3p22-->p21.3 encoding a xylulokinase-like protein. Cytogenet. Cell Genet. 82: 101—104. PMID 9763671

Див. також

• Хромосома 3