ZKSCAN5

ZKSCAN5
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2EM5, 2EMM, 2EMZ, 2EN3, 2EOM, 2EON, 2EOO, 2YSO, 2YTG
Ідентифікатори
Символи	ZKSCAN5, ZFP95, ZNF914, ZSCAN37, ZFP-95, zinc finger with KRAB and SCAN domains 5
Зовнішні ІД	OMIM: 611272 MGI: 107533 HomoloGene: 8734 GeneCards: ZKSCAN5
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • zinc ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • внутрішньоклітинний • клітинне ядро Біологічний процес • transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23660	22757
Ensembl	ENSG00000196652	ENSMUSG00000055991
UniProt	Q9Y2L8	Q9Z1D8
RefSeq (мРНК)	NM_014569 NM_145102 NM_001318082 NM_001318083 NM_001318084	NM_001167944 NM_016683 NM_001359187 NM_001359188 NM_001359189 NM_001359190 NM_001359191 NM_001359192
RefSeq (білок)	NP_001305011 NP_001305012 NP_001305013 NP_055384 NP_659570	NP_001161416 NP_057892 NP_001346116 NP_001346117 NP_001346118 NP_001346119 NP_001346120 NP_001346121
Локус (UCSC)	Хр. 7: 99.5 – 99.53 Mb	Хр. 5: 145.14 – 145.16 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ZKSCAN5 (англ. Zinc finger with KRAB and SCAN domains 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 839 амінокислот, а молекулярна маса — 96 903.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MIMTESREVI		DLDPPAETSQ		EQEDLFIVKV		EEEDCTWMQE		YNPPTFETFY
QRFRHFQYHE		ASGPREALSQ		LRVLCCEWLR		PELHTKEQIL		ELLVLEQFLT
ILPEEFQPWV		REHHPESGEE		AVAVIENIQR		ELEERRQQIV		ACPDVLPRKM
ATPGAVQESC		SPHPLTVDTQ		PEQAPQKPRL		LEENALPVLQ		VPSLPLKDSQ
ELTASLLSTG		SQKLVKIEEV		ADVAVSFILE		EWGHLDQSQK		SLYRDDRKEN
YGSITSMGYE		SRDNMELIVK		QISDDSESHW		VAPEHTERSV		PQDPDFAEVS
DLKGMVQRWQ		VNPTVGKSRQ		NPSQKRDLDA		ITDISPKQST		HGERGHRCSD
CGKFFLQASN		FIQHRRIHTG		EKPFKCGECG		KSYNQRVHLT		QHQRVHTGEK
PYKCQVCGKA		FRVSSHLVQH		HSVHSGERPY		GCNECGKNFG		RHSHLIEHLK
RHFREKSQRC		SDKRSKNTKL		SVKKKISEYS		EADMELSGKT		QRNVSQVQDF
GEGCEFQGKL		DRKQGIPMKE		ILGQPSSKRM		NYSEVPYVHK		KSSTGERPHK
CNECGKSFIQ		SAHLIQHQRI		HTGEKPFRCE		ECGKSYNQRV		HLTQHQRVHT
GEKPYTCPLC		GKAFRVRSHL		VQHQSVHSGE		RPFKCNECGK		GFGRRSHLAG
HLRLHSREKS		HQCRECGEIF		FQYVSLIEHQ		VLHMGQKNEK		NGICEEAYSW
NLTVIEDKKI		ELQEQPYQCD		ICGKAFGYSS		DLIQHYRTHT		AEKPYQCDIC
RENVGQCSHT		KQHQKIYSST		KSHQCHECGR		GFTLKSHLNQ		HQRIHTGEKP
FQCKECGMNF		SWSCSLFKHL		RSHERTDPIN		TLSVEGSLL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Dreyer S.D., Zheng Q., Zabel B., Winterpacht A., Lee B. (1999). Isolation, characterization, and mapping of a zinc finger gene, ZFP95, containing both a SCAN box and an alternatively spliced KRAB A domain. Genomics. 62: 119—122. PMID 10585779 DOI:10.1006/geno.1999.5981

Див. також

• Хромосома 7