Аурелін (пептид)
Аурелін (англ. aurelin) — антимікробний пептид, що складається з 40 амінокислотних залишків, активний проти грампозитивних і грамнегативних бактерій; виділений із мезоглеї сцифоїдної медузи аурелії (Aurelia aurita).[1]
Препроаурелін із 84 амінокислотними залишками містить передбачуваний сигнальний пептид (22 амінокислоти) і пропептид такого ж розміру (22 амінокислоти), які видаляються; молекулярна маса зрілого пептиду 4297 Da.[1]
Амінокислотна послідовність препроауреліну: MGCFKVLVLF AAILCMSLLV CAEDEVNLQA QIEEGPMEAI RSRRAACSDR AHGHICESFK SFCKDSGRNG VKLRANCKKT CGLC;
амінокислотна послідовність зрілого пептиду: AACSDRAHGH ICESFKSFCK DSGRNGVKLR ANCKKTCGLC.
Аурелін являє собою компактну глобулу, що має дві α-спіральні ділянки, які зшиті трьома дисульфідними зв'язками (в позиціях цистеїнів 47-84, 56-77 та 63-81).[2][3]
Аурелін не має структурної гомології з будь-якими антимікробними пептидами, але виявляє часткову подібність як до дефензинів, так і до токсинів, що блокують K+ канали морських анемон, і належить до сімейства доменів ShKT.[1]
Аурелін активний проти грампозитивної лістерії Listeria monocytogenes та грамнегативної Escherichia coli.[1]
- ↑ а б в г Ovchinnikova, Tatiana V.; Balandin, Sergey V.; Aleshina, Galina M.; Tagaev, Andrey A.; Leonova, Yulia F.; Krasnodembsky, Eugeny D.; Men’shenin, Alexander V.; Kokryakov, Vladimir N. (2006-09). Aurelin, a novel antimicrobial peptide from jellyfish Aurelia aurita with structural features of defensins and channel-blocking toxins. Biochemical and Biophysical Research Communications (англ.). Т. 348, № 2. с. 514—523. doi:10.1016/j.bbrc.2006.07.078. Процитовано 25 жовтня 2022.
- ↑ Shenkarev, Zakhar O.; Panteleev, Pavel V.; Balandin, Sergey V.; Gizatullina, Albina K.; Altukhov, Dmitry A.; Finkina, Ekaterina I.; Kokryakov, Vladimir N.; Arseniev, Alexander S.; Ovchinnikova, Tatiana V. (2012-12). Recombinant expression and solution structure of antimicrobial peptide aurelin from jellyfish Aurelia aurita. Biochemical and Biophysical Research Communications (англ.). Т. 429, № 1-2. с. 63—69. doi:10.1016/j.bbrc.2012.10.092. Процитовано 25 жовтня 2022.
- ↑ Q0MWV8 · AURE_AURAU. UniProt (англ.) . Процитовано 25 жовтня 2022.