Сюжет гри в основному обертається навколо вигаданого підрозділу F.E.A.R. (First Encounter Assault Recon), що покликаний боротися з паранормальною сутністю Альма Вейд, молодою дівчиною, яка була піддослідною в Armacham Technology Corporation і тепер жадає помсти. В першій і третій ігрі ігровий процес відбувається за мовчазного героя, члена F.E.A.R. В Другій грі, протагоністом виступає Майкл Беккет, член Delta Force. Кожна гра має різні цілі, але подібний сюжет.