GYPC

GYPC
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2EJY
Ідентифікатори
Символи	GYPC, CD236, CD236R, GE, GPC, GPD, GYPD, PAS-2, PAS-2', glycophorin C (Gerbich blood group), GE:GPC:GPD:GYPD
Зовнішні ІД	OMIM: 110750 MGI: 1098566 HomoloGene: 128415 GeneCards: GYPC
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • signaling receptor binding • protein homodimerization activity • cell adhesion molecule binding Клітинна компонента • integral component of membrane • cortical cytoskeleton • integral component of plasma membrane • мембрана • клітинна мембрана • extrinsic component of plasma membrane Біологічний процес • leukocyte migration • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • heterophilic cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules • cell recognition Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	2995	71683
Ensembl	ENSG00000136732	ENSMUSG00000090523
UniProt	P04921	Q78HU7
RefSeq (мРНК)	NM_001256584 NM_002101 NM_016815	NM_001048207 NM_027863 NM_001347610
RefSeq (білок)	NP_001243513 NP_002092 NP_058131	NP_001041672 NP_001334539
Локус (UCSC)	Хр. 2: 126.66 – 126.7 Mb	Хр. 18: 32.66 – 32.69 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

GYPC (англ. Glycophorin C (Gerbich blood group)) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 2-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 128 амінокислот, а молекулярна маса — 13 811.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MWSTRSPNST		AWPLSLEPDP		GMASASTTMH		TTTIAEPDPG		MSGWPDGRME
TSTPTIMDIV		VIAGVIAAVA		IVLVSLLFVM		LRYMYRHKGT		YHTNEAKGTE
FAESADAALQ		GDPALQDAGD		SSRKEYFI

A: Аланін
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з сіаловими кислотами. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• High S., Tanner M.J.A. (1987). Human erythrocyte membrane sialoglycoprotein beta. The cDNA sequence suggests the absence of a cleaved N-terminal signal sequence. Biochem. J. 243: 277—280. PMID 3606576 DOI:10.1042/bj2430277
• le van Kim C., Mitjavila M.T., Clerget M., Cartron J.-P., Colin Y. (1990). An ubiquitous isoform of glycophorin C is produced by alternative splicing. Nucleic Acids Res. 18: 3076—3076. PMID 2349119 DOI:10.1093/nar/18.10.3076
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Dahr W., Beyreuther K., Kordowicz M., Krueger J. (1982). N-terminal amino acid sequence of sialoglycoprotein D (glycophorin C) from human erythrocyte membranes. Eur. J. Biochem. 125: 57—62. PMID 7106126 DOI:10.1111/j.1432-1033.1982.tb06650.x
• El-Maliki B., Blanchard D., Dahr W., Beyreuther K., Cartron J.-P. (1989). Structural homology between glycophorins C and D of human erythrocytes. Eur. J. Biochem. 183: 639—643. PMID 2776757 DOI:10.1111/j.1432-1033.1989.tb21093.x
• High S., Tanner M.J.A., Macdonald E.N., Anstee D.J. (1989). Rearrangements of the red-cell membrane glycophorin C (sialoglycoprotein beta) gene. A further study of alterations in the glycophorin C gene. Biochem. J. 262: 47—54. PMID 2818576 DOI:10.1042/bj2620047

Див. також

• Хромосома 2