PRKDC

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
PRKDC
Ідентифікатори
Символи PRKDC, DNA-PKcs, DNAPK, DNPK1, HYRC, HYRC1, XRCC7, p350, IMD26, protein kinase, DNA-activated, catalytic polypeptide, DNA-PKC, protein kinase, DNA-activated, catalytic subunit, DNAPKc
Зовнішні ІД OMIM: 600899 MGI: 104779 HomoloGene: 5037 GeneCards: PRKDC
Пов'язані генетичні захворювання
immunodeficiency 26[1]
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_001081640
NM_006904
NM_011159
RefSeq (білок)
NP_001075109
NP_008835
NP_035289
Локус (UCSC) Хр. 8: 47.77 – 47.96 Mb Хр. 16: 15.46 – 15.66 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

PRKDC (англ. Protein kinase, DNA-activated, catalytic polypeptide) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 4 128 амінокислот, а молекулярна маса — 469 089[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MAGSGAGVRCSLLRLQETLSAADRCGAALAGHQLIRGLGQECVLSSSPAV
LALQTSLVFSRDFGLLVFVRKSLNSIEFRECREEILKFLCIFLEKMGQKI
APYSVEIKNTCTSVYTKDRAAKCKIPALDLLIKLLQTFRSSRLMDEFKIG
ELFSKFYGELALKKKIPDTVLEKVYELLGLLGEVHPSEMINNAENLFRAF
LGELKTQMTSAVREPKLPVLAGCLKGLSSLLCNFTKSMEEDPQTSREIFN
FVLKAIRPQIDLKRYAVPSAGLRLFALHASQFSTCLLDNYVSLFEVLLKW
CAHTNVELKKAALSALESFLKQVSNMVAKNAEMHKNKLQYFMEQFYGIIR
NVDSNNKELSIAIRGYGLFAGPCKVINAKDVDFMYVELIQRCKQMFLTQT
DTGDDRVYQMPSFLQSVASVLLYLDTVPEVYTPVLEHLVVMQIDSFPQYS
PKMQLVCCRAIVKVFLALAAKGPVLRNCISTVVHQGLIRICSKPVVLPKG
PESESEDHRASGEVRTGKWKVPTYKDYVDLFRHLLSSDQMMDSILADEAF
FSVNSSSESLNHLLYDEFVKSVLKIVEKLDLTLEIQTVGEQENGDEAPGV
WMIPTSDPAANLHPAKPKDFSAFINLVEFCREILPEKQAEFFEPWVYSFS
YELILQSTRLPLISGFYKLLSITVRNAKKIKYFEGVSPKSLKHSPEDPEK
YSCFALFVKFGKEVAVKMKQYKDELLASCLTFLLSLPHNIIELDVRAYVP
ALQMAFKLGLSYTPLAEVGLNALEEWSIYIDRHVMQPYYKDILPCLDGYL
KTSALSDETKNNWEVSALSRAAQKGFNKVVLKHLKKTKNLSSNEAISLEE
IRIRVVQMLGSLGGQINKNLLTVTSSDEMMKSYVAWDREKRLSFAVPFRE
MKPVIFLDVFLPRVTELALTASDRQTKVAACELLHSMVMFMLGKATQMPE
GGQGAPPMYQLYKRTFPVLLRLACDVDQVTRQLYEPLVMQLIHWFTNNKK
FESQDTVALLEAILDGIVDPVDSTLRDFCGRCIREFLKWSIKQITPQQQE
KSPVNTKSLFKRLYSLALHPNAFKRLGASLAFNNIYREFREEESLVEQFV
FEALVIYMESLALAHADEKSLGTIQQCCDAIDHLCRIIEKKHVSLNKAKK
RRLPRGFPPSASLCLLDLVKWLLAHCGRPQTECRHKSIELFYKFVPLLPG
NRSPNLWLKDVLKEEGVSFLINTFEGGGCGQPSGILAQPTLLYLRGPFSL
QATLCWLDLLLAALECYNTFIGERTVGALQVLGTEAQSSLLKAVAFFLES
IAMHDIIAAEKCFGTGAAGNRTSPQEGERYNYSKCTVVVRIMEFTTTLLN
TSPEGWKLLKKDLCNTHLMRVLVQTLCEPASIGFNIGDVQVMAHLPDVCV
NLMKALKMSPYKDILETHLREKITAQSIEELCAVNLYGPDAQVDRSRLAA
VVSACKQLHRAGLLHNILPSQSTDLHHSVGTELLSLVYKGIAPGDERQCL
PSLDLSCKQLASGLLELAFAFGGLCERLVSLLLNPAVLSTASLGSSQGSV
IHFSHGEYFYSLFSETINTELLKNLDLAVLELMQSSVDNTKMVSAVLNGM
LDQSFRERANQKHQGLKLATTILQHWKKCDSWWAKDSPLETKMAVLALLA
KILQIDSSVSFNTSHGSFPEVFTTYISLLADTKLDLHLKGQAVTLLPFFT
SLTGGSLEELRRVLEQLIVAHFPMQSREFPPGTPRFNNYVDCMKKFLDAL
ELSQSPMLLELMTEVLCREQQHVMEELFQSSFRRIARRGSCVTQVGLLES
VYEMFRKDDPRLSFTRQSFVDRSLLTLLWHCSLDALREFFSTIVVDAIDV
LKSRFTKLNESTFDTQITKKMGYYKILDVMYSRLPKDDVHAKESKINQVF
HGSCITEGNELTKTLIKLCYDAFTENMAGENQLLERRRLYHCAAYNCAIS
VICCVFNELKFYQGFLFSEKPEKNLLIFENLIDLKRRYNFPVEVEVPMER
KKKYIEIRKEAREAANGDSDGPSYMSSLSYLADSTLSEEMSQFDFSTGVQ
SYSYSSQDPRPATGRFRRREQRDPTVHDDVLELEMDELNRHECMAPLTAL
VKHMHRSLGPPQGEEDSVPRDLPSWMKFLHGKLGNPIVPLNIRLFLAKLV
INTEEVFRPYAKHWLSPLLQLAASENNGGEGIHYMVVEIVATILSWTGLA
TPTGVPKDEVLANRLLNFLMKHVFHPKRAVFRHNLEIIKTLVECWKDCLS
IPYRLIFEKFSGKDPNSKDNSVGIQLLGIVMANDLPPYDPQCGIQSSEYF
QALVNNMSFVRYKEVYAAAAEVLGLILRYVMERKNILEESLCELVAKQLK
QHQNTMEDKFIVCLNKVTKSFPPLADRFMNAVFFLLPKFHGVLKTLCLEV
VLCRVEGMTELYFQLKSKDFVQVMRHRDDERQKVCLDIIYKMMPKLKPVE
LRELLNPVVEFVSHPSTTCREQMYNILMWIHDNYRDPESETDNDSQEIFK
LAKDVLIQGLIDENPGLQLIIRNFWSHETRLPSNTLDRLLALNSLYSPKI
EVHFLSLATNFLLEMTSMSPDYPNPMFEHPLSECEFQEYTIDSDWRFRST
VLTPMFVETQASQGTLQTRTQEGSLSARWPVAGQIRATQQQHDFTLTQTA
DGRSSFDWLTGSSTDPLVDHTSPSSDSLLFAHKRSERLQRAPLKSVGPDF
GKKRLGLPGDEVDNKVKGAAGRTDLLRLRRRFMRDQEKLSLMYARKGVAE
QKREKEIKSELKMKQDAQVVLYRSYRHGDLPDIQIKHSSLITPLQAVAQR
DPIIAKQLFSSLFSGILKEMDKFKTLSEKNNITQKLLQDFNRFLNTTFSF
FPPFVSCIQDISCQHAALLSLDPAAVSAGCLASLQQPVGIRLLEEALLRL
LPAELPAKRVRGKARLPPDVLRWVELAKLYRSIGEYDVLRGIFTSEIGTK
QITQSALLAEARSDYSEAAKQYDEALNKQDWVDGEPTEAEKDFWELASLD
CYNHLAEWKSLEYCSTASIDSENPPDLNKIWSEPFYQETYLPYMIRSKLK
LLLQGEADQSLLTFIDKAMHGELQKAILELHYSQELSLLYLLQDDVDRAK
YYIQNGIQSFMQNYSSIDVLLHQSRLTKLQSVQALTEIQEFISFISKQGN
LSSQVPLKRLLNTWTNRYPDAKMDPMNIWDDIITNRCFFLSKIEEKLTPL
PEDNSMNVDQDGDPSDRMEVQEQEEDISSLIRSCKFSMKMKMIDSARKQN
NFSLAMKLLKELHKESKTRDDWLVSWVQSYCRLSHCRSRSQGCSEQVLTV
LKTVSLLDENNVSSYLSKNILAFRDQNILLGTTYRIIANALSSEPACLAE
IEEDKARRILELSGSSSEDSEKVIAGLYQRAFQHLSEAVQAAEEEAQPPS
WSCGPAAGVIDAYMTLADFCDQQLRKEEENASVIDSAELQAYPALVVEKM
LKALKLNSNEARLKFPRLLQIIERYPEETLSLMTKEISSVPCWQFISWIS
HMVALLDKDQAVAVQHSVEEITDNYPQAIVYPFIISSESYSFKDTSTGHK
NKEFVARIKSKLDQGGVIQDFINALDQLSNPELLFKDWSNDVRAELAKTP
VNKKNIEKMYERMYAALGDPKAPGLGAFRRKFIQTFGKEFDKHFGKGGSK
LLRMKLSDFNDITNMLLLKMNKDSKPPGNLKECSPWMSDFKVEFLRNELE
IPGQYDGRGKPLPEYHVRIAGFDERVTVMASLRRPKRIIIRGHDEREHPF
LVKGGEDLRQDQRVEQLFQVMNGILAQDSACSQRALQLRTYSVVPMTSRL
GLIEWLENTVTLKDLLLNTMSQEEKAAYLSDPRAPPCEYKDWLTKMSGKH
DVGAYMLMYKGANRTETVTSFRKRESKVPADLLKRAFVRMSTSPEAFLAL
RSHFASSHALICISHWILGIGDRHLNNFMVAMETGGVIGIDFGHAFGSAT
QFLPVPELMPFRLTRQFINLMLPMKETGLMYSIMVHALRAFRSDPGLLTN
TMDVFVKEPSFDWKNFEQKMLKKGGSWIQEINVAEKNWYPRQKICYAKRK
LAGANPAVITCDELLLGHEKAPAFRDYVAVARGSKDHNIRAQEPESGLSE
ETQVKCLMDQATDPNILGRTWEGWEPWM

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, серин/треонінових протеїнкіназ. Задіяний у таких біологічних процесах як пошкодження ДНК, репарація ДНК, біологічні ритми, рекомбінація ДНК. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

[ред. | ред. код]
  • Anderson C.W., Dunn J.J., Freimuth P.I., Galloway A.M., Allalunis-Turner M.J. (2001). Frameshift mutation in PRKDC, the gene for DNA-PKcs, in the DNA repair-defective, human, glioma-derived cell line M059J. Radiat. Res. 156: 2—9. PMID 11418067 DOI:10.1667/0033-7587(2001)156[0002:FMIPTG]2.0.CO;2
  • Carter T., Vancurova I., Sun I., Lou W., DeLeon S. (1990). A DNA-activated protein kinase from HeLa cell nuclei. Mol. Cell. Biol. 10: 6460—6471. PMID 2247066 DOI:10.1128/MCB.10.12.6460
  • Iijima S., Teraoka H., Date T., Tsukada K. (1992). DNA-activated protein kinase in Raji Burkitt's lymphoma cells. Phosphorylation of c-Myc oncoprotein. Eur. J. Biochem. 206: 595—603. PMID 1597196 DOI:10.1111/j.1432-1033.1992.tb16964.x
  • Bannister A.J., Gottlieb T.M., Kouzarides T., Jackson S.P. (1993). c-Jun is phosphorylated by the DNA-dependent protein kinase in vitro; definition of the minimal kinase recognition motif. Nucleic Acids Res. 21: 1289—1295. PMID 8464713 DOI:10.1093/nar/21.5.1289
  • Connelly M.A., Zhang H., Kieleczawa J., Anderson C.W. (1996). Alternate splice-site utilization in the gene for the catalytic subunit of the DNA-activated protein kinase, DNA-PKcs. Gene. 175: 271—273. PMID 8917110 DOI:10.1016/0378-1119(96)00135-7
  • Shieh S.-Y., Ikeda M., Taya Y., Prives C. (1997). DNA damage-induced phosphorylation of p53 alleviates inhibition by MDM2. Cell. 91: 325—334. PMID 9363941 DOI:10.1016/S0092-8674(00)80416-X

Примітки

[ред. | ред. код]
  1. Захворювання, генетично пов'язані з PRKDC переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9413 (англ.) . Архів оригіналу за 1 квітня 2016. Процитовано 6 лютого 2017.
  5. UniProt, P78527 (англ.) . Архів оригіналу за 25 листопада 2016. Процитовано 6 лютого 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]