TRIM5

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
TRIM5
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи TRIM5, RNF88, TRIM5alpha, tripartite motif containing 5
Зовнішні ІД OMIM: 608487 MGI: 4821183 HomoloGene: 75345 GeneCards: TRIM5
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_033034
NM_033092
NM_033093
NM_001146007
NM_175677
RefSeq (білок)
NP_149023
NP_149083
NP_149084
NP_001139479
NP_783608
Локус (UCSC) Хр. 11: 5.66 – 5.94 Mb Хр. 7: 103.99 – 104 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

TRIM5 (англ. Tripartite motif containing 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 493 амінокислот, а молекулярна маса — 56 338[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MASGILVNVKEEVTCPICLELLTQPLSLDCGHSFCQACLTANHKKSMLDK
GESSCPVCRISYQPENIRPNRHVANIVEKLREVKLSPEGQKVDHCARHGE
KLLLFCQEDGKVICWLCERSQEHRGHHTFLTEEVAREYQVKLQAALEMLR
QKQQEAEELEADIREEKASWKTQIQYDKTNVLADFEQLRDILDWEESNEL
QNLEKEEEDILKSLTNSETEMVQQTQSLRELISDLEHRLQGSVMELLQGV
DGVIKRTENVTLKKPETFPKNQRRVFRAPDLKGMLEVFRELTDVRRYWVD
VTVAPNNISCAVISEDKRQVSSPKPQIIYGARGTRYQTFVNFNYCTGILG
SQSITSGKHYWEVDVSKKTAWILGVCAGFQPDAMCNIEKNENYQPKYGYW
VIGLEEGVKCSAFQDSSFHTPSVPFIVPLSVIICPDRVGVFLDYEACTVS
FFNITNHGFLIYKFSHCSFSQPVFPYLNPRKCGVPMTLCSPSS

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, взаємодія хазяїн-вірус, убіквітинування білків, автофагія, противірусний захист, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

[ред. | ред. код]
  • Yap M.W., Nisole S., Lynch C., Stoye J.P. (2004). Trim5alpha protein restricts both HIV-1 and murine leukemia virus. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 101: 10786—10791. PMID 15249690 DOI:10.1073/pnas.0402876101
  • Sawyer S.L., Wu L.I., Akey J.M., Emerman M., Malik H.S. (2006). High-frequency persistence of an impaired allele of the retroviral defense gene TRIM5alpha in humans. Curr. Biol. 16: 95—100. PMID 16401428 DOI:10.1016/j.cub.2005.11.045
  • Yamauchi K., Wada K., Tanji K., Tanaka M., Kamitani T. (2008). Ubiquitination of E3 ubiquitin ligase TRIM5 alpha and its potential role. FEBS J. 275: 1540—1555. PMID 18312418 DOI:10.1111/j.1742-4658.2008.06313.x
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Passerini L.D., Keckesova Z., Towers G.J. (2006). Retroviral restriction factors Fv1 and TRIM5alpha act independently and can compete for incoming virus before reverse transcription. J. Virol. 80: 2100—2105. PMID 16474118 DOI:10.1128/JVI.80.5.2100-2105.2006
  • Li Y., Li X., Stremlau M., Lee M., Sodroski J. (2006). Removal of arginine 332 allows human TRIM5alpha to bind human immunodeficiency virus capsids and to restrict infection. J. Virol. 80: 6738—6744. PMID 16809279 DOI:10.1128/JVI.00270-06

Примітки

[ред. | ред. код]
  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16276 (англ.) . Архів оригіналу за 12 червня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
  4. UniProt, Q9C035 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]