CRISPR: відмінності між версіями

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
Інтерактивний перегляд історії
[неперевірена версія][неперевірена версія]
← Попереднє редагуванняНаступне редагування →
Вилучено вміст Додано вміст
ВізуальнийВікірозмітка
Рядок 25: Рядок 25:
== Примітки ==
== Примітки ==
{{reflist}}
{{reflist}}
== Джерела ==
# Rath, D., Amlinger, L., Rath, A., & Lundgren, M. (2015). [http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0300908415001042 The CRISPR-Cas immune system: Biology, mechanisms and applications]. Biochimie. {{doi|10.1016/j.biochi.2015.03.025}}
# Sampson, T. R. and Weiss, D. S. (2014), Exploiting CRISPR/Cas systems for biotechnology. Bioessays, 36: 34-38. {{doi|10.1002/bies.201300135}}
# Chu, V. T., Weber, T., Wefers, B., Wurst, W., Sander, S., Rajewsky, K., & Kühn, R. (2015). [http://www.nature.com/nbt/journal/vaop/ncurrent/full/nbt.3198.html Increasing the efficiency of homology-directed repair for CRISPR-Cas9-induced precise gene editing in mammalian cells]. Nature biotechnology. {{doi|10.1038/nbt.3198}}
# Cong, L., & Zhang, F. (2015). [http://link.springer.com/protocol/10.1007/978-1-4939-1862-1_10 Genome Engineering Using CRISPR-Cas9 System.] In Chromosomal Mutagenesis. Methods in Molecular Biology Vol. 1239, 2015, pp 197-217. Springer New York.
# Kennedy E.M., Cullen B.R. (2015). [http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0042682215000707 Bacterial CRISPR/Cas DNA endonucleases: A revolutionary technology that could dramatically impact viral research and treatment.] Virology, 479–480, 213–220 {{doi|10.1016/j.virol.2015.02.024}}
# Belhaj, K., Chaparro-Garcia, A., Kamoun, S., Patron, N. J., & Nekrasov, V. (2015). [http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0958166914001943 Editing plant genomes with CRISPR/Cas9]. Current opinion in biotechnology, 32, 76-84. {{doi|10.1016/j.copbio.2014.11.007}}
# [http://www.technologyreview.com/featuredstory/532796/who-owns-the-biggest-biotech-discovery-of-the-century/#comments Who Owns the Biggest Biotech Discovery of the Century? There’s a bitter fight over the patents for CRISPR, a breakthrough new form of DNA editing.]
# Sander, J. D.; Joung, J. K. (2014). CRISPR-Cas systems for editing, regulating and targeting genomes. Nature Biotechnology. {{doi|10.1038/nbt.2842}}. {{PMID|24584096}}.
# Kevin Mayer (2014). [http://genengnews.com/insight-and-intelligence/crispr-fast-easy-and-increasingly-accurate/77900114/ CRISPR—Fast, Easy … and Increasingly Accurate] Genetic Engineering & Biotechnology News.
# Terns, R. M.; Terns, M. P. (2014). CRISPR-based technologies: Prokaryotic defense weapons repurposed. Trends in Genetics, 30 (3): 111. {{doi|10.1016/j.tig.2014.01.003}}. {{PMID|24555991}}.
# Edze R. Westra, Angus Buckling & Peter C. Fineran (2014). CRISPR-Cas systems: beyond adaptive immunity. Nature Reviews Microbiology. {{doi|10.1038/nrmicro3241}}
# {{cite journal | author=Rodolphe Barrangou| title=Cas9 Targeting and the CRISPR Revolution | journal=SCIENCE| year=2014 | pages=707-708 | volume=344 | issue=6185|pmid=| doi=10.1126/science.1252964 }}
# {{cite journal | author=Джагаров Д.Э. | title=[http://www.hij.ru/read/issues/2014/july/4984/ Умные ножницы для ДНК]| journal=«Химия и жизнь -XXI век»| year=2014 | pages= | volume= | issue=7 |pmid=| doi= }}
# {{cite journal | author=Джагаров Д.Э. | title=[https://www.academia.edu/9638231/A_new_method_of_genetic_engineering_-_CRISPR_Cas9._text_in_Russian_ Новый метод генной инженерии - CRISPR/Cas9]| journal=Academia.edu| year=2014 | pages= | volume= | issue= |pmid=| doi= }}
# {{cite journal | author=Джагаров Д.Э. | title=[https://ru.scribd.com/doc/274884849/%D0%9D%D0%BE%D0%B2%D1%8B%D0%B5-%D0%BC%D0%B5%D1%82%D0%BE%D0%B4%D1%8B-%D0%B3%D0%B5%D0%BD%D0%BD%D0%BE%D0%B9-%D0%B8%D0%BD%D0%B6%D0%B5%D0%BD%D0%B5%D1%80%D0%B8%D0%B8-%D0%BE%D1%81%D0%BD%D0%BE%D0%B2%D0%B0%D0%BD%D0%BD%D1%8B%D0%B5-%D0%BD%D0%B0-%D0%B8%D1%81%D0%BF%D0%BE%D0%BB%D1%8C%D0%B7%D0%BE%D0%B2%D0%B0%D0%BD%D0%B8%D0%B8-%D1%81%D0%B8%D1%81%D1%82%D0%B5%D0%BC%D1%8B-CRISPR-Cas9 Новые методы генной инженерии основанные на использовании системы CRISPR/Cas9]| journal=scribd.com| year=2015 | pages= | volume= | issue= |pmid=| doi= }}
# Гоглева А. А., Артамонова И. И. (2014). CRISPR-системы: структура и гипотетические функции. Природа 6 (2014), 16-21;
# Гоглева А. А., Артамонова И. И. (2014). CRISPR-системы: механизм действия и применения. Природа 7 (2014), 3-9.
# Артамонова И.(2014). [http://biomolecula.ru/content/1498/ CRISPR-системы: иммунизация прокариот] «биомолекула.ру»
# {{cite journal | author=ELIZABETH PENNISI | title=[http://diyhpl.us/~nmz787/pdf/The_CRISPR_Craze.pdf The CRISPR Craze]| journal=SCIENCE| year=2013 | pages=834-836 | volume=341 | issue= |pmid=| doi= }}
# {{cite journal | author=Jeffry D Sander & J Keith Joung| title=[http://www.nature.com/nbt/journal/vaop/ncurrent/full/nbt.2842.html CRISPR-Cas systems for editing, regulating and targeting genomes.]| journal=Nature Biotechnology| year=2014 | pages= | volume= | issue= |pmid=| doi=10.1038/nbt.2842}}
# [http://www.genengnews.com/gen-articles/video-genesis-precision-genome-editing-with-crispr-and-raav/5214/ VIDEO: GENESIS™ Precision Genome Editing with CRISPR and rAAV]
# {{cite journal | author=Timothy R. Sampson and David S. Weiss| title=[http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3983513/ CRISPR-Cas systems: new players in gene regulation and bacterial physiology] | journal=Front Cell Infect Microbiol. | year=2014 | pages=37 | volume=4 | pmid= | doi=10.3389/fcimb.2014.00037}}
# {{cite journal | author=Pourcel C, Salvignol G, Vergnaud G | title=CRISPR elements in ''Yersinia pestis'' acquire new repeats by preferential uptake of bacteriophage DNA, and provide additional tools for evolutionary studies | journal=Microbiology | year=2005 | pages=653 | volume=151 | pmid=15758212 | doi=10.1099/mic.0.27437-0}}
# {{cite journal | author=Haft DH, Selengut J, Mongodin EF, Nelson KE | title=A guild of 45 CRISPR-associated (Cas) protein families and multiple CRISPR/Cas subtypes exist in prokaryotic genomes | journal=PLoS Comput Biol. | year=2005 | pages=e60 | volume=1 | issue=6 | pmid=16292354 | doi=10.1371/journal.pcbi.0010060}}
# {{cite journal | author=Makarova KS, Grishin NV, Shabalina SA, Wolf YI, Koonin EV | title=A putative RNA-interference-based immune system in prokaryotes: computational analysis of the predicted enzymatic machinery, functional analogies with eukaryotic RNAi, and hypothetical mechanisms of action | journal=Biol Direct. | year=2006 | pages=7 | volume=1 | pmid=16545108 | doi=10.1186/1745-6150-1-7}}
# {{cite journal | author=Barrangou R, Fremaux C, Deveau H, Richards M, Boyaval P, Moineau S, Romero DA, Horvath P. | title=CRISPR provides acquired resistance against viruses in prokaryotes | journal=Science | year=2007 | pages=1709 | volume=315 | issue=5819 | pmid=17379808 | doi=10.1126/science.1138140}}
# {{cite journal | author=Sorek R, Kunin V, Hugenholtz P | title=CRISPR - a widespread system that provides acquired resistance against phages in bacteria and archaea | journal=[[Nat Rev Microbiol]] | year=2007 | pmid=18157154 | doi=10.1038/nrmicro1793 | volume=6 | pages=181}}
# {{cite journal | author=Andersson AF, Banfield JF | title=Virus population dynamics and acquired virus resistance in natural microbial communities | journal=Science | year=2008 | pmid=18497291 | doi=10.1126/science.1157358 | volume=320 | pages=1047}}
# {{cite journal | author=Brouns SJJ, Jore MM, Lundgren M, Westra ER, Slijkhuis RJH, Snijders APL, Dickman MJ, Makarova KS, Koonin EV, Van der Oost J | title=Small CRISPR RNAs Guide Antiviral Defense in Prokaryotes | journal=Science | year=2008 | pmid=18703739 | doi=10.1126/science.1159689 | volume=321 | pages=960}}
# {{cite journal | author=Heidi Ledford| title=[http://www.nature.com/news/crispr-the-disruptor-1.17673?WT.ec_id=NATURE-20150604#/rise CRISPR, the disruptor]. A powerful gene-editing technology is the biggest game changer to hit biology since PCR. But with its huge potential come pressing concerns. | journal=NATURE | year=2015 | pmid= | doi=10.1038/522020a | volume=522 | pages=20–24}}
== Посилання ==

Версія за 05:07, 14 листопада 2015

Діаграма, що ілюструє можливий механізм CRISPR.

Короткі паліндромні повтори, регулярно розташовані групами (англ. CRISPR — Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats) — це прямі повтори та унікальні послідовності в ДНК бактерій і архей, що розділяють їх, які спільно з асоційованими генами (Cas, англ. CRISPR-associated genes) забезпечують захист клітини від чужорідних генетичних елементів (бактеріофагів, плазмід). CRISPR-касети виявлені в геномах багатьох бактерій і більшості архей[1]. Повтори мають довжину від 24 до 48 пар нуклеотидів; вони мають бівалентну симетрію, але, як правило, не є істинними паліндромами. Повтори розділені варіабельними ділянками ДНК, спейсерами, приблизно однакової довжини. Спейсери відповідають по нуклеотидній послідовності певним фрагментам ДНК чужорідних генетичних елементів (протоспейсерам). У зв'язку з цим було запропоновано і потім показано, що послідовності, що розділяють повтори, походять з послідовностей геномів бактеріофагів, і, відповідно, забезпечують захист клітин від інфекцій.

В результаті досліджень механізму дії CRISPR-системи було зроблено припущення, що вона є прокаріотичним аналогом системи РНК-інтерференції еукаріот і забезпечує бактеріям і археям захист від бактеріофагів[2].

Роль в генетичній регуляції ендогенних бактеріальних генів

Патогенні та синантропні бактерії містять велику кількість білка Cas9 (англ. CRISPR-associated 9). Було показано, що система CRISPR/Cas може брати активну участь у регуляції ендогенних бактеріальних генів, зокрема, при взаємодії бактерій з еукаріотичним організмом, в якому вони паразитують. Наприклад, білок Cas9 з Francisella novicida використовує унікальну, CRISPR/Cas-асоційовану малу РНК (scaRNA) для пригнічення ендогенного транскрипту мРНК, що кодує бактеріальний ліпопротеїн, що дозволяє їй послабити імунну відповідь хазяїна й підвищити її вірулентність[3].

Методи генної інженерії, що базуються на системі CRISPR/Cas9

Розроблено методи високовибіркового активування[4] і інгібування генів[5], що базуються на системі CRISPR/Cas9 (CRISPR-системі II типу)[6][7][8][9][10][11][12][13]. Основними компонентами CRISPR-системи II типу є CRISPR-касета, на основі якої синтезуються направляючі crРНК (англ. CRISPR RNA), нуклеаза Cas9 (Csn1) і tracrРНК (англ. trans-activating crRNA), необхідна для процесингу направляючої РНК[1][14][15]. Для спрямованого редагування генома еукаріотів використовують Cas9 Streptococcus pyogenes, Streptococcus thermophilus, Neisseria meningitidis[16][17], а також Cas9 з Staphylococcus aureus (SaCas9), яка на 25% менша за розмірами, що дозволяє упаковувати її в аденоасоційований вірус (AAV) для доставки вектора в клітини живого організму, як терапевтичний засіб[18][19][20]. Походження ферменту накладає деякі обмеження на вибір ДНК-мішеней: наприклад при використанні Cas9 S. pyogenes, як мішені можна вибирати тільки послідовності, за якими йде 5'-NGG (де N — будь-який нуклеотид). Перед використанням у генетичних конструкціях ген Cas9 потрібно попередньо оптимізовати за використовуваними кодонама відповідно з організмом, геном якого передбачається модифікувати[14].

З метою спрощення маніпуляцій з клонуванням лентивірусних або ретровірусних векторів доставки, crРНК і tracrРНК об'єднують в одну суцільну sgРНК (англ. single guide RNA, sgRNA) — так званий «all-in-one CRISPR-Cas9 cloning vector»[21]. Це дозволяє полегшити конструювання та клонування серії векторів доставки, що відрізняються тільки по пришитій до tracrRNA ланцюжку «гідРНК» (англ. guide RNA),яка впізнає комплементарну їй, послідовність ДНК, вибрану в геномі за замовленням дослідника[22].

Розроблена також технологія самоклонувальних CRISPR/Cas9, що дозволяє взагалі обійтися без клонування, а використовувати коротку дволанцюгову ДНК з послідовністю, що кодує бажаний локус і плазміду, несе саморозщеплювальну паліндромну sgРНК. Це дозволяє скоротити час на підготовки експерименту всього до 2-х годин, а його вартість здешевити в шість разів[23].

Модифікація ДНК-зв'язуючого домену Cas9 і його злиття з різними регуляторними доменами дозволяє отримати вибірково направляючі на потрібні ділянки геному за допомогою РНК-гідів штучні фактори транскрипції (crisprTF) і ефектори[24], штучні ендонуклеази рестрикції[25][26], репрессори, а також ферменти, що модифікують епігеном, такі як ДНК-метилази, деметилази і гістонацетилтрансферази, що дозволяє вибірково регулювати активність певних генів[27]. Крім того знайдені аналоги Cas9, які здатні розщеплювати замість ДНК молекули РНК, що дозволяє редагувати або вибірково пригнічувати активність мікроРНК[28][29]. Так, наприклад, Cas9 з грамнегативної бактерії Francisella novicida (FnCas9) може бути перепрограмований так щоб спрямувати його на РНК геном вірусу гепатиту C, що призводить до інгібування синтезу вірусного білка в клітині[30]. На основі цієї системи можна створити сотні засобів для захисту проти різних вірусів.

Метод сайт-селективного редагування геному за допомогою ферменту, що впізнає необхідну послідовність ланцюга ДНК «за наведенням» комплементарного їй РНК «гіду», обіцяє революційні зміни в дослідженнях та лікуванні цілого ряду захворювань, від раку[31] і невиліковних вірусних хвороб до спадкових генетичних патологій на кшталт серповидноклітинної анемії і синдрому Дауна[32]. Він дозволив здешевити, спростити і прискорити розробку генномодифікованих мікроорганізмів[33], рослин[34][35] і домашньої худоби,а також допоможе в розробленні генної терапії спадкових захворювань у людських ембріонів[36][37]. Так, наприклад, технологія, розроблена Editas, дозволяє взяти клітину з тіла живого організму, замінити певні ділянки ДНК, а потім повернути клітину на колишнє місце. Передбачається, що таким чином можна запустити процес лікування деяких типів захворювань[38].

Методи дослідження, що базуються на системі CRISPR/Cas9

Прикріпивши до білка Cas9 дефектному по екзонуклеазній активності зелений флуоресцентний білок EGFP можна отримати інструмент для візуалізації геномних послідовностей в живих клітинах ссавців і візуального визначення довжини теломер хромосоми, а також відстежувати динаміку генних локусів протягом клітинного циклу[39].

Див. також

Примітки

  1. ↑ а б PMID 21552286 (PMID 21552286)
    Бібліографічний опис з'явиться автоматично через деякий час. Ви можете підставити цитату власноруч або використовуючи бота.
  2. ↑ Kira S. Makarova, Yuri I. Wolf and Eugene V. Koonin (2013) Comparative genomics of defense systems in archaea and bacteria. Nucl. Acids Res. 41(8): 4360-4377. doi: 10.1093/nar/gkt157
  3. ↑ Sampson TR, Saroj SD, Llewellyn AC, Tzeng YL, Weiss DS.(2013). A CRISPR/Cas system mediates bacterial innate immune evasion and virulence. Nature; 497(7448), 254—257. DOI:10.1038/nature12048.
  4. ↑ Pablo Perez-Pinera et al.(2013) RNA-Guided Human Gene Activation by CRISPR/Cas9-Based Engineered Transcription Factors. Nature Methods 10, 973—976 doi:10.1038/nmeth.2600
  5. ↑ Lei S. Qi, Matthew H. Larson, Luke A. Gilbert, Jennifer A. Doudna, Jonathan S. Weissman, Adam P. Arkin, Wendell A. Lim.(2013) Repurposing CRISPR as an RNA-Guided Platform for Sequence-Specific Control of Gene Expression. Cell, 152 (5): 1173—1183 DOI:10.1016/j.cell.2013.02.022
  6. ↑ Cho, S.W., Kim, S., Kim, J.M., and Kim, J.-S (2013) Targeted genome engineering in human cells with the Cas9 RNA-guided endonuclease. Nat. Biotechnol. doi:10.1038/nbt.2507
  7. ↑ Cong, L., Ran, F.A., Cox, D., et al. (2013) Multiplex genome engineering using CRISPR/Cas systems. Science 339, 819—823
  8. ↑ Hwang, W.Y., Fu, Y., Reyon, D., et al. and Joung, J.K. (2013) Efficient genome editing in zebrafish using a CRISPR-Cas system. Nat. Biotechnol. ,doi:10.1038/nbt.2501
  9. ↑ Jiang, W., Bikard, D., Cox, D., Zhang, F., and Marraffini, L.A. (2013) RNA-guided editing of bacterial genomes using CRISPR-Cas systems. Nat. Biotechnol. ,doi:10.1038/nbt.2508
  10. ↑ Jinek, M., East, A., Cheng, A., Lin, S., Ma, E., and Doudna, J. (2013) RNA-programmed genome editing in human cells. eLife 2, e00471. http://dx.doi.org/10.7554/eLife.00471.001
  11. ↑ Mali, P., Yang, L., Esvelt, K.M., et al. and Church, G.M. (2013) RNA-guided human genome engineering via Cas9. Science. 339, 823—826.
  12. ↑ Wang, H; Yang H, Shivalila CS, Dawlaty MM, Cheng AW, Zhang F, Jaenisch R. (2013) One-Step Generation of Mice Carrying Mutations in Multiple Genes by CRISPR/Cas-Mediated Genome Engineering. Cell 153 (4): 910-8. doi:10.1016/j.cell.2013.04.025.
  13. ↑ Houa, Z; Zhangb,Y; Propsona, N; Howdena, S; Chua, L; Sontheimerb, E; and Thomson, J. (2013) Efficient genome engineering in human pluripotent stem cells using Cas9 from Neisseria meningitidis. PNAS. doi:10.1073/pnas.1313587110
  14. ↑ а б PMID 24157548 (PMID 24157548)
    Бібліографічний опис з'явиться автоматично через деякий час. Ви можете підставити цитату власноруч або використовуючи бота.
  15. ↑ Karvelis, T., Gasiunas, G., Miksys, A., Barrangou, R., Horvath, P., & Siksnys, V. (2013). crRNA and tracrRNA guide Cas9-mediated DNA interference in Streptococcus thermophilus. RNA biology, 10(5), 20-19
  16. ↑ Hou, Z., Zhang, Y., Propson, N. E.,et al. & Thomson, J. A. (2013). Efficient genome engineering in human pluripotent stem cells using Cas9 from Neisseria meningitidis. PNAS, 110(39), 15644-15649 doi: 10.1073/pnas.1313587110
  17. ↑ Ines Fonfara, Anaïs Le Rhun, Krzysztof Chylinski, Kira Makarova, Anne-Laure Lécrivain, Janek Bzdrenga, Eugene V. Koonin, Emmanuelle Charpentier (2013) Phylogeny of Cas9 determines functional exchangeability of dual-RNA and Cas9 among orthologous type II CRISPR-Cas systems. Nucleic Acids Research
  18. ↑ CRISPR Clears Major Obstacle Impeding Its Therapeutic Use. GEN News Highlights
  19. ↑ F. Ann Ran, Le Cong, Winston X. Yan,et al., & Feng Zhang (2015). In vivo genome editing using Staphylococcus aureus Cas9. Nature. DOI:10.1038/nature14299
  20. ↑ A smaller Cas9 protein enables in vivo genome engineering via viral vectors
  21. ↑ Malina, A., Mills, J. R., Cencic, R., et al. & Pelletier, J. (2013). Repurposing CRISPR/Cas9 for in situ functional assays. Genes & development, 27(23), 2602—2614. Genes & Dev. . 27:2602-2614 doi:10.1101/gad.227132.113
  22. ↑ Heintze, J., Luft, C., & Ketteler, R. (2014).A CRISPR CASe for high-throughput silencing. Frontiers in genetics, 4. 193 doi: 10.3389/fgene.2013.00193
  23. ↑ Arbab, M., Srinivasan, S., Hashimoto, T., Geijsen, N., & Sherwood, R. I. (2015). Cloning-free CRISPR. Stem cell reports, 5(5), 908–917 DOI: http://dx.doi.org/10.1016/j.stemcr.2015.09.022
  24. ↑ Kearns, N. A., Genga, R. M., Enuameh, M. S.,et al. & Maehr, R. (2014). Cas9 effector-mediated regulation of transcription and differentiation in human pluripotent stem cells. Development, 141(1), 219—223.
  25. ↑ John P Guilinger, David B Thompson & David R Liu (2014). Fusion of catalytically inactive Cas9 to FokI nuclease improves the specificity of genome modification. Nature Biotechnology, DOI:10.1038/nbt.2909
  26. ↑ Shengdar Q Tsai, Nicolas Wyvekens, Cyd Khayter, et al., & J Keith Joung (2014). Dimeric CRISPR RNA-guided FokI nucleases for highly specific genome editing. Nature Biotechnology, DOI:10.1038/nbt.2908
  27. ↑ Isaac B Hilton, Anthony M D’Ippolito, Christopher M Vockley, Pratiksha I. Thakore, Gregory E Crawford, Timothy E Reddy, Charles A Gersbach.(2015). Epigenome editing by a CRISPR-Cas9-based acetyltransferase activates genes from promoters and enhancers. Nature Biotechnology, DOI:10.1038/nbt.3199
  28. ↑ Mitchell R. O’Connell, Benjamin L. Oakes, Samuel H. Sternberg, Alexandra East-Seletsky, Matias Kaplan, Jennifer A. Doudna. Programmable RNA recognition and cleavage by CRISPR/Cas9. Nature, 2014;DOI:10.1038/nature13769
  29. ↑ Hale, C. R., Zhao, P., Olson, S.,et al. & Terns, M. P. (2009). RNA-guided RNA cleavage by a CRISPR RNA-Cas protein complex. Cell, 139(5), 945—956, doi: 10.1016/j.cell.2009.07.040
  30. ↑ Aryn A. Price, Timothy R. Sampson, Hannah K. Ratner, Arash Grakoui, and David S. Weiss. Cas9-mediated targeting of viral RNA in eukaryotic cells. PNAS. DOI:10.1073/pnas.1422340112
  31. ↑ Sidi Chen et al., & Feng Zhang, Phillip A. Sharp (2015). Genome-wide CRISPR Screen in a Mouse Model of Tumor Growth and Metastasis. Cell, DOI: http://dx.doi.org/10.1016/j.cell.2015.02.038
  32. ↑ Yin, H., Xue, W., Chen, S., Bogorad, R. L., Benedetti, E., Grompe, M., … & Anderson, D. G. (2014). Genome editing with Cas9 in adult mice corrects a disease mutation and phenotype. Nature Biotechnology. DOI:10.1038/nbt.2884
  33. ↑ Jiang, W., Bikard, D., Cox, D., Zhang, F. & Marraffini, L.A.(2013) RNA-guided editing of bacterial genomes using CRISPR-Cas systems. Nat. Biotechnol. 31, 233—239
  34. ↑ Wenzhi Jiang, Huanbin Zhou, Honghao Bi, Michael Fromm, Bing Yang, and Donald P. Weeks (2013)Demonstration of CRISPR/Cas9/sgRNA-mediated targeted gene modification in Arabidopsis, tobacco, sorghum and rice. Nucl. Acids Res. (2013) 41 (20): e188 doi:10.1093/nar/gkt780
  35. ↑ Khaoula Belhaj, Angela Chaparro-Garcia, Sophien Kamoun and Vladimir Nekrasov (2013) Plant genome editing made easy: targeted mutagenesis in model and crop plants using the CRISPR/Cas system Plant Methods , 9:39 doi:10.1186/1746-4811-9-39
  36. ↑ Giedrius Gasiunas, Virginijus Siksnys (2013) RNA-dependent DNA endonuclease Cas9 of the CRISPR system: Holy Grail of genome editing? Trends in Microbiology, 21(11), 562—567, doi: 10.1016/j.tim.2013.09.001
  37. ↑ Uri Ben-David (2013) Flowing through the CRISPR-CAScade: Will genome editing boost cell therapies? Molecular and Cellular Therapies 2013, 1:3 doi:10.1186/2052-8426-1-3
  38. ↑ Билл Гейтс вложил $120 млн в редактирование ДНК
  39. ↑ Baohui Chen, Luke A. Gilbert, Beth A. Cimini, et al. & Lei S. Qi, Bo Huang (December 2013) Dynamic Imaging of Genomic Loci in Living Human Cells by an Optimized CRISPR/Cas System. 155(7), 1479—1491 doi: 10.1016/j.cell.2013.12.001

Джерела

  1. Rath, D., Amlinger, L., Rath, A., & Lundgren, M. (2015). The CRISPR-Cas immune system: Biology, mechanisms and applications. Biochimie. DOI:10.1016/j.biochi.2015.03.025
  2. Sampson, T. R. and Weiss, D. S. (2014), Exploiting CRISPR/Cas systems for biotechnology. Bioessays, 36: 34-38. DOI:10.1002/bies.201300135
  3. Chu, V. T., Weber, T., Wefers, B., Wurst, W., Sander, S., Rajewsky, K., & Kühn, R. (2015). Increasing the efficiency of homology-directed repair for CRISPR-Cas9-induced precise gene editing in mammalian cells. Nature biotechnology. DOI:10.1038/nbt.3198
  4. Cong, L., & Zhang, F. (2015). Genome Engineering Using CRISPR-Cas9 System. In Chromosomal Mutagenesis. Methods in Molecular Biology Vol. 1239, 2015, pp 197-217. Springer New York.
  5. Kennedy E.M., Cullen B.R. (2015). Bacterial CRISPR/Cas DNA endonucleases: A revolutionary technology that could dramatically impact viral research and treatment. Virology, 479–480, 213–220 DOI:10.1016/j.virol.2015.02.024
  6. Belhaj, K., Chaparro-Garcia, A., Kamoun, S., Patron, N. J., & Nekrasov, V. (2015). Editing plant genomes with CRISPR/Cas9. Current opinion in biotechnology, 32, 76-84. DOI:10.1016/j.copbio.2014.11.007
  7. Who Owns the Biggest Biotech Discovery of the Century? There’s a bitter fight over the patents for CRISPR, a breakthrough new form of DNA editing.
  8. Sander, J. D.; Joung, J. K. (2014). CRISPR-Cas systems for editing, regulating and targeting genomes. Nature Biotechnology. DOI:10.1038/nbt.2842. PMID 24584096.
  9. Kevin Mayer (2014). CRISPR—Fast, Easy … and Increasingly Accurate Genetic Engineering & Biotechnology News.
  10. Terns, R. M.; Terns, M. P. (2014). CRISPR-based technologies: Prokaryotic defense weapons repurposed. Trends in Genetics, 30 (3): 111. DOI:10.1016/j.tig.2014.01.003. PMID 24555991.
  11. Edze R. Westra, Angus Buckling & Peter C. Fineran (2014). CRISPR-Cas systems: beyond adaptive immunity. Nature Reviews Microbiology. DOI:10.1038/nrmicro3241
  12. Rodolphe Barrangou (2014). Cas9 Targeting and the CRISPR Revolution. SCIENCE. 344 (6185): 707—708. doi:10.1126/science.1252964.
  13. Джагаров Д.Э. (2014). Умные ножницы для ДНК. «Химия и жизнь -XXI век» (7).
  14. Джагаров Д.Э. (2014). Новый метод генной инженерии - CRISPR/Cas9. Academia.edu.
  15. Джагаров Д.Э. (2015). Новые методы генной инженерии основанные на использовании системы CRISPR/Cas9. scribd.com.
  16. Гоглева А. А., Артамонова И. И. (2014). CRISPR-системы: структура и гипотетические функции. Природа 6 (2014), 16-21;
  17. Гоглева А. А., Артамонова И. И. (2014). CRISPR-системы: механизм действия и применения. Природа 7 (2014), 3-9.
  18. Артамонова И.(2014). CRISPR-системы: иммунизация прокариот «биомолекула.ру»
  19. ELIZABETH PENNISI (2013). The CRISPR Craze. SCIENCE. 341: 834—836.
  20. Jeffry D Sander & J Keith Joung (2014). CRISPR-Cas systems for editing, regulating and targeting genomes. Nature Biotechnology. doi:10.1038/nbt.2842.
  21. VIDEO: GENESIS™ Precision Genome Editing with CRISPR and rAAV
  22. Timothy R. Sampson and David S. Weiss (2014). CRISPR-Cas systems: new players in gene regulation and bacterial physiology. Front Cell Infect Microbiol. 4: 37. doi:10.3389/fcimb.2014.00037.{{cite journal}}: Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
  23. Pourcel C, Salvignol G, Vergnaud G (2005). CRISPR elements in Yersinia pestis acquire new repeats by preferential uptake of bacteriophage DNA, and provide additional tools for evolutionary studies. Microbiology. 151: 653. doi:10.1099/mic.0.27437-0. PMID 15758212.
  24. Haft DH, Selengut J, Mongodin EF, Nelson KE (2005). A guild of 45 CRISPR-associated (Cas) protein families and multiple CRISPR/Cas subtypes exist in prokaryotic genomes. PLoS Comput Biol. 1 (6): e60. doi:10.1371/journal.pcbi.0010060. PMID 16292354.{{cite journal}}: Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
  25. Makarova KS, Grishin NV, Shabalina SA, Wolf YI, Koonin EV (2006). A putative RNA-interference-based immune system in prokaryotes: computational analysis of the predicted enzymatic machinery, functional analogies with eukaryotic RNAi, and hypothetical mechanisms of action. Biol Direct. 1: 7. doi:10.1186/1745-6150-1-7. PMID 16545108.{{cite journal}}: Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
  26. Barrangou R, Fremaux C, Deveau H, Richards M, Boyaval P, Moineau S, Romero DA, Horvath P. (2007). CRISPR provides acquired resistance against viruses in prokaryotes. Science. 315 (5819): 1709. doi:10.1126/science.1138140. PMID 17379808.
  27. Sorek R, Kunin V, Hugenholtz P (2007). CRISPR - a widespread system that provides acquired resistance against phages in bacteria and archaea. Nat Rev Microbiol. 6: 181. doi:10.1038/nrmicro1793. PMID 18157154.
  28. Andersson AF, Banfield JF (2008). Virus population dynamics and acquired virus resistance in natural microbial communities. Science. 320: 1047. doi:10.1126/science.1157358. PMID 18497291.
  29. Brouns SJJ, Jore MM, Lundgren M, Westra ER, Slijkhuis RJH, Snijders APL, Dickman MJ, Makarova KS, Koonin EV, Van der Oost J (2008). Small CRISPR RNAs Guide Antiviral Defense in Prokaryotes. Science. 321: 960. doi:10.1126/science.1159689. PMID 18703739.
  30. Heidi Ledford (2015). CRISPR, the disruptor. A powerful gene-editing technology is the biggest game changer to hit biology since PCR. But with its huge potential come pressing concerns. NATURE. 522: 20—24. doi:10.1038/522020a.

Посилання

Отримано з https://uk.wikipedia.org/w/index.php?title=CRISPR&oldid=17047477