В подальшому виступав за велику кількість бразильських клубів, втім трофеї здобув лише в одному з них — «Санту-Андре», вигравши Кубок Пауліста у 2003 році та Кубок Бразилії у 2004, завершивши того ж року професійну ігрову кар'єру у цьому клубі.
Розпочав тренерську кар'єру відразу ж по завершенні кар'єри гравця, 2004 року, очоливши тренерський штаб клубу «Санту-Андре». В подальшому очолював ряд бразильських команд, і виграв у 2014 році з «Сеарою»Лігу Сеаренсе , а наступного року із «Баїєю»Лігу Баїяно. Крім того 2012 року недовго очолював японський клуб «Сересо Осака»
Наразі останнім місцем тренерської роботи був клуб «Лондрина», головним тренером команди якого Сержіу Суареш був протягом частини 2018 року.