PhenomicDB: відмінності між версіями
Перейти до навігації
Перейти до пошуку
| [неперевірена версія] | [неперевірена версія] |
Вилучено вміст Додано вміст
Немає опису редагування |
Немає опису редагування |
||
| Рядок 1: | Рядок 1: | ||
'''PhenomicDB''' вільною базою даних, що містить інформацію про фенотипи. Вона містить дані для деяких з основних модельних організмів, таких як ''Homo sapiens'', ''Mus musculus'', ''Drosophila melanogaster'' та ін. PhenomicDB поєднує та структурує фенотипічні дані з різних загальнодоступних джерел: [[WormBase]], [[FlyBase]], [[Entrez]], MGI та ZFIN з використанням алгоритмів кластеризації. |
'''PhenomicDB''' є вільною [[База даних|базою даних]], що містить інформацію про [[Фенотип|фенотипи]]. Вона містить дані для деяких з основних [[Модельний організм|модельних організмів]], таких як [[Людина розумна|''Homo sapiens'']], [[Миша хатня|''Mus musculus'']], [[Дрозофіла чорночерева|''Drosophila melanogaster'']] та ін. PhenomicDB поєднує та структурує фенотипічні дані з різних загальнодоступних джерел: [[WormBase]], [[FlyBase]], [[Entrez]], MGI та ZFIN з використанням алгоритмів кластеризації. |
||
== Джерела == |
|||
* {{cite journal |vauthors=Groth P, Kalev I, Kirov I, Traikov B, Leser U, Weiss B |title=Phenoclustering: online mining of cross-species phenotypes |journal=[[Bioinformatics (journal)|Bioinformatics]] |volume=26 |issue=15 |pages=1924–5 |date=August 2010 |pmid=20562418 |pmc=2905556 |doi=10.1093/bioinformatics/btq311 |url=http://bioinformatics.oxfordjournals.org/cgi/pmidlookup?view=long&pmid=20562418 |accessdate=2011-03-17}} |
|||
* {{cite journal |vauthors=Groth P, Pavlova N, Kalev I, Tonov S, Georgiev G, Pohlenz HD, Weiss B |title=PhenomicDB: a new cross-species genotype/phenotype resource |journal=[[Nucleic Acids Research]] |volume=35 |issue=Database issue |pages=D696–9 |date=January 2007 |pmid=16982638 |pmc=1781118 |doi=10.1093/nar/gkl662 |url=http://nar.oxfordjournals.org/cgi/pmidlookup?view=long&pmid=16982638 |accessdate=2011-03-17}} |
|||
* {{cite journal |vauthors=Kahraman A, Avramov A, Nashev LG, Popov D, Ternes R, Pohlenz HD, Weiss B |title=PhenomicDB: a multi-species genotype/phenotype database for comparative phenomics |journal=Bioinformatics |volume=21 |issue=3 |pages=418–20 |date=February 2005 |pmid=15374875 |doi=10.1093/bioinformatics/bti010 |url=http://bioinformatics.oxfordjournals.org/cgi/pmidlookup?view=long&pmid=15374875 |accessdate=2011-03-17}} |
|||
* {{Cite journal | last1 = Groth | first1 = Philip | last2 = Weiss | first2 = Bertram | doi = 10.2174/157489306777828008 | title = Phenotype Data: A Neglected Resource in Biomedical Research? | journal = [[Current Bioinformatics]] | volume = 1 | issue = 3 | pages = 347–358 | year = 2006 | pmid = | pmc = }} |
|||
* {{Cite journal | last1 = Groth | first1 = Philip | last2 = Weiss | first2 = Bertram | last3 = Pohlenz | first3 = Hans-Dieter | last4 = Leser | first4 = Ulf | title = Mining phenotypes for gene function prediction | doi = 10.1186/1471-2105-9-136 | journal = [[BMC Bioinformatics]] | volume = 9 | pages = 136 | year = 2008 | pmid = | pmc = }} |
|||
== Посилання == |
|||
* {{Офіційний веб-сайт|http://www.phenomicdb.de}} |
|||
Версія за 21:48, 8 листопада 2016
PhenomicDB є вільною базою даних, що містить інформацію про фенотипи. Вона містить дані для деяких з основних модельних організмів, таких як Homo sapiens, Mus musculus, Drosophila melanogaster та ін. PhenomicDB поєднує та структурує фенотипічні дані з різних загальнодоступних джерел: WormBase, FlyBase, Entrez, MGI та ZFIN з використанням алгоритмів кластеризації.
Джерела
- Groth P, Kalev I, Kirov I, Traikov B, Leser U, Weiss B (August 2010). Phenoclustering: online mining of cross-species phenotypes. Bioinformatics. 26 (15): 1924—5. doi:10.1093/bioinformatics/btq311. PMC 2905556. PMID 20562418. Процитовано 17 березня 2011.
- Groth P, Pavlova N, Kalev I, Tonov S, Georgiev G, Pohlenz HD, Weiss B (January 2007). PhenomicDB: a new cross-species genotype/phenotype resource. Nucleic Acids Research. 35 (Database issue): D696—9. doi:10.1093/nar/gkl662. PMC 1781118. PMID 16982638. Процитовано 17 березня 2011.
- Kahraman A, Avramov A, Nashev LG, Popov D, Ternes R, Pohlenz HD, Weiss B (February 2005). PhenomicDB: a multi-species genotype/phenotype database for comparative phenomics. Bioinformatics. 21 (3): 418—20. doi:10.1093/bioinformatics/bti010. PMID 15374875. Процитовано 17 березня 2011.
- Groth, Philip; Weiss, Bertram (2006). Phenotype Data: A Neglected Resource in Biomedical Research?. Current Bioinformatics. 1 (3): 347—358. doi:10.2174/157489306777828008.
- Groth, Philip; Weiss, Bertram; Pohlenz, Hans-Dieter; Leser, Ulf (2008). Mining phenotypes for gene function prediction. BMC Bioinformatics. 9: 136. doi:10.1186/1471-2105-9-136.
{{cite journal}}: Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)