Люмікан

Люмікан
Ідентифікатори
Символи	LUM, LDC, SLRR2D, lumican
Зовнішні ІД	OMIM: 600616 MGI: 109347 HomoloGene: 37614 GeneCards: LUM
Онтологія гена Молекулярна функція • collagen binding • extracellular matrix structural constituent • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • extracellular matrix structural constituent conferring compression resistance Клітинна компонента • GO:0005578 Позаклітинна матриця • fibrillar collagen trimer • lysosomal lumen • Golgi lumen • екзосома • міжклітинний простір • extracellular region • collagen-containing extracellular matrix Біологічний процес • GO:1904578 response to organic cyclic compound • аксоноґенеза • collagen fibril organization • extracellular matrix organization • positive regulation of transforming growth factor beta1 production • cartilage development • keratan sulfate catabolic process • response to growth factor • keratan sulfate biosynthetic process • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • зір Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4060	17022
Ensembl	ENSG00000139329	ENSMUSG00000036446
UniProt	P51884	P51885
RefSeq (мРНК)	NM_002345	NM_008524
RefSeq (білок)	NP_002336	NP_032550
Локус (UCSC)	Хр. 12: 91.1 – 91.11 Mb	Хр. 10: 97.4 – 97.41 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Люмікан (англ. Lumican) – білок, який кодується геном LUM, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 338 амінокислот, а молекулярна маса — 38 429.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSLSAFTLFL		ALIGGTSGQY		YDYDFPLSIY		GQSSPNCAPE		CNCPESYPSA
MYCDELKLKS		VPMVPPGIKY		LYLRNNQIDH		IDEKAFENVT		DLQWLILDHN
LLENSKIKGR		VFSKLKQLKK		LHINHNNLTE		SVGPLPKSLE		DLQLTHNKIT
KLGSFEGLVN		LTFIHLQHNR		LKEDAVSAAF		KGLKSLEYLD		LSFNQIARLP
SGLPVSLLTL		YLDNNKISNI		PDEYFKRFNA		LQYLRLSHNE		LADSGIPGNS
FNVSSLVELD		LSYNKLKNIP		TVNENLENYY		LEVNQLEKFD		IKSFCKILGP
LSYSKIKHLR		LDGNRISETS		LPPDMYECLR		VANEVTLN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

• Grover J., Chen X.-N., Korenberg J.R., Roughley P.J. (1995). The human lumican gene. Organization, chromosomal location, and expression in articular cartilage. J. Biol. Chem. 270: 21942—21949. PMID 7665616 DOI:10.1074/jbc.270.37.21942
• Chakravarti S., Stallings R.L., Sundar-Raj N., Cornuet P.K., Hassell J.R. (1995). Primary structure of human lumican (keratan sulfate proteoglycan) and localization of the gene (LUM) to chromosome 12q21.3-q22. Genomics. 27: 481—488. PMID 7558030 DOI:10.1006/geno.1995.1080
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Onnerfjord P., Heathfield T.F., Heinegaard D. (2004). Identification of tyrosine sulfation in extracellular leucine-rich repeat proteins using mass spectrometry. J. Biol. Chem. 279: 26—33. PMID 14551184 DOI:10.1074/jbc.M308689200
• Bunkenborg J., Pilch B.J., Podtelejnikov A.V., Wisniewski J.R. (2004). Screening for N-glycosylated proteins by liquid chromatography mass spectrometry. Proteomics. 4: 454—465. PMID 14760718 DOI:10.1002/pmic.200300556

Див. також

• Хромосома 12