ADARB1

ADARB1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1ZY7, 5ED1, 5ED2, 5HP3, 5HP2
Ідентифікатори
Символи	ADARB1, ADAR2, DRABA2, DRADA2, RED1, adenosine deaminase, RNA specific B1, adenosine deaminase RNA specific B1, NEDHYMS
Зовнішні ІД	OMIM: 601218 MGI: 891999 HomoloGene: 8280 GeneCards: ADARB1
шифр КФ	3.5.4.37
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном металу • adenosine deaminase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • double-stranded RNA binding • mRNA binding • hydrolase activity • double-stranded RNA adenosine deaminase activity • tRNA-specific adenosine deaminase activity Клітинна компонента • нуклеоплазма • ядерце • клітинне ядро • гіалоплазма • цитоплазма Біологічний процес • GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing • процес імунної системи • mRNA processing • base conversion or substitution editing • regulation of cell cycle • negative regulation of cell migration • defense response to virus • negative regulation of protein kinase activity by regulation of protein phosphorylation • positive regulation of viral genome replication • вроджений імунітет • adenosine to inosine editing • negative regulation of cell population proliferation • neuromuscular synaptic transmission • facial nerve morphogenesis • hypoglossal nerve morphogenesis • spinal cord ventral commissure morphogenesis • multicellular organism growth • neuromuscular process controlling posture • іннервація • muscle tissue morphogenesis • motor behavior • motor neuron apoptotic process Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	104	110532
Ensembl	ENSG00000197381	ENSMUSG00000020262
UniProt	P78563	Q91ZS8
RefSeq (мРНК)	NM_001033049 NM_001112 NM_001160230 NM_015833 NM_015834 NM_001346687 NM_001346688	NM_001024837 NM_001024838 NM_001024839 NM_001024840 NM_130895
RefSeq (білок)	NP_001103 NP_001153702 NP_001333616 NP_001333617 NP_056648 NP_056649	NP_001020008 NP_570965 NP_001020009
Локус (UCSC)	Хр. 21: 45.07 – 45.23 Mb	Хр. 10: 77.13 – 77.25 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ADARB1 (англ. Adenosine deaminase, RNA specific B1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 21-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 741 амінокислот, а молекулярна маса — 80 763.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDIEDEENMS		SSSTDVKENR		NLDNVSPKDG		STPGPGEGSQ		LSNGGGGGPG
RKRPLEEGSN		GHSKYRLKKR		RKTPGPVLPK		NALMQLNEIK		PGLQYTLLSQ
TGPVHAPLFV		MSVEVNGQVF		EGSGPTKKKA		KLHAAEKALR		SFVQFPNASE
AHLAMGRTLS		VNTDFTSDQA		DFPDTLFNGF		ETPDKAEPPF		YVGSNGDDSF
SSSGDLSLSA		SPVPASLAQP		PLPVLPPFPP		PSGKNPVMIL		NELRPGLKYD
FLSESGESHA		KSFVMSVVVD		GQFFEGSGRN		KKLAKARAAQ		SALAAIFNLH
LDQTPSRQPI		PSEGLQLHLP		QVLADAVSRL		VLGKFGDLTD		NFSSPHARRK
VLAGVVMTTG		TDVKDAKVIS		VSTGTKCING		EYMSDRGLAL		NDCHAEIISR
RSLLRFLYTQ		LELYLNNKDD		QKRSIFQKSE		RGGFRLKENV		QFHLYISTSP
CGDARIFSPH		EPILEGSRSY		TQAGVQWCNH		GSLQPRPPGL		LSDPSTSTFQ
GAGTTEPADR		HPNRKARGQL		RTKIESGEGT		IPVRSNASIQ		TWDGVLQGER
LLTMSCSDKI		ARWNVVGIQG		SLLSIFVEPI		YFSSIILGSL		YHGDHLSRAM
YQRISNIEDL		PPLYTLNKPL		LSGISNAEAR		QPGKAPNFSV		NWTVGDSAIE
VINATTGKDE		LGRASRLCKH		ALYCRWMRVH		GKVPSHLLRS		KITKPNVYHE
SKLAAKEYQA		AKARLFTAFI		KAGLGAWVEK		PTEQDQFSLT		P

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до гідролаз. Задіяний у таких біологічних процесах як імунітет, вроджений імунітет, процесінг мРНК, антивірусний захист. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, РНК. Локалізований у ядрі.

У мозку миші в ході ембріонального розвитку активність білку зростає. Особливо висока його кількість у таламусі. Активність білка посилюють імпортин KPNA3, який транспортує його в ядро з цитоплазми, та ізомераза PIN1, що стабілізує фермент у ядрі.

Література

• Lai F., Chen C.-X., Carter K.C., Nishikura K. (1997). Editing of glutamate receptor B subunit ion channel RNAs by four alternatively spliced DRADA2 double-stranded RNA adenosine deaminases. Mol. Cell. Biol. 17: 2413—2424. PMID 9111310 DOI:10.1128/MCB.17.5.2413
• Villard L., Tassone F., Haymowicz M., Welborn R., Gardiner K. (1997). Map location, genomic organization and expression patterns of the human RED1 RNA editase. Somat. Cell Mol. Genet. 23: 135—145. PMID 9330641 DOI:10.1007/BF02679972
• Slavov D., Gardiner K. (2002). Phylogenetic comparison of the pre-mRNA adenosine deaminase ADAR2 genes and transcripts: conservation and diversity in editing site sequence and alternative splicing patterns. Gene. 299: 83—94. PMID 12459255 DOI:10.1016/S0378-1119(02)01016-8
• Kawahara Y., Ito K., Ito M., Tsuji S., Kwak S. (2005). Novel splice variants of human ADAR2 mRNA: skipping of the exon encoding the dsRNA-binding domains, and multiple C-terminal splice sites. Gene. 363: 193—201. PMID 16297572 DOI:10.1016/j.gene.2005.07.028
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Maas S., Gommans W.M. (2009). Novel exon of mammalian ADAR2 extends open reading frame. PLoS ONE. 4: E4225—E4225. PMID 19156214 DOI:10.1371/journal.pone.0004225

Див. також

• Хромосома 21