AGO2

AGO2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3LUC, 3LUD, 3LUG, 3LUH, 3LUJ, 3LUK, 3QX8, 3QX9, 4F3T, 4OLA, 4OLB, 4W5N, 4W5O, 4W5Q, 4W5R, 4W5T, 4Z4C, 4Z4D, 4Z4E, 4Z4F, 4Z4G, 4Z4H, 4Z4I, 5JS1, 5JS2
Ідентифікатори
Символи	AGO2, EIF2C2, Q10, argonaute 2, RISC catalytic component, PPD, CASC7, LINC00980, argonaute RISC catalytic component 2, LESKRES
Зовнішні ІД	OMIM: 606229 MGI: 2446632 HomoloGene: 81825 GeneCards: AGO2
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein C-terminus binding • зв'язування з іоном металу • nuclease activity • endoribonuclease activity, cleaving miRNA-paired mRNA • hydrolase activity • translation initiation factor activity • endonuclease activity • endoribonuclease activity, cleaving siRNA-paired mRNA • single-stranded RNA binding • double-stranded RNA binding • RNA polymerase II complex binding • nucleic acid binding • mRNA binding • miRNA binding • endoribonuclease activity • RNA 7-methylguanosine cap binding • siRNA binding • mRNA cap binding • RNA binding • endoribonuclease activity, producing 5'-phosphomonoesters Клітинна компонента • цитоплазма • Полісома • мембрана • P-body • дендрит (нейробіологія) • RISC-loading complex • RISC • гіалоплазма • клітинне ядро • нуклеоплазма • mRNA cap binding complex • міжклітинні контакти • екзосома • Рибонуклеопротеїни Біологічний процес • mRNA destabilization-mediated gene silencing by miRNA • RNA secondary structure unwinding • transcription, DNA-templated • regulation of translation • GO:0035194 РНК-інтерференція • Біосинтез білків • positive regulation of nuclear-transcribed mRNA catabolic process, deadenylation-dependent decay • GO:1901313 positive regulation of gene expression • production of miRNAs involved in gene silencing by miRNA • mRNA destabilization-mediated gene silencing by siRNA • positive regulation of nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening • pre-miRNA processing • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • post-embryonic development • RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic • translational initiation • Wnt signaling pathway, calcium modulating pathway • miRNA-mediated gene silencing by inhibition of translation • negative regulation of translational initiation • GO:0061715 miRNA metabolic process • GO:0070919 production of siRNA involved in RNA interference • Сайленсинг генів • GO:1905616 regulation of gene silencing by miRNA • negative regulation of gene expression • positive regulation of angiogenesis • positive regulation of trophoblast cell migration • negative regulation of amyloid precursor protein biosynthetic process Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	27161	239528
Ensembl	ENSG00000123908	ENSMUSG00000036698
UniProt	Q9UKV8	Q8CJG0
RefSeq (мРНК)	NM_001164623 NM_012154	NM_153178
RefSeq (білок)	NP_001158095 NP_036286	NP_694818
Локус (UCSC)	Хр. 8: 140.52 – 140.64 Mb	Хр. 15: 72.97 – 73.06 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

AGO2 (англ. Argonaute 2, RISC catalytic component) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 859 амінокислот, а молекулярна маса — 97 208.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MYSGAGPALA		PPAPPPPIQG		YAFKPPPRPD		FGTSGRTIKL		QANFFEMDIP
KIDIYHYELD		IKPEKCPRRV		NREIVEHMVQ		HFKTQIFGDR		KPVFDGRKNL
YTAMPLPIGR		DKVELEVTLP		GEGKDRIFKV		SIKWVSCVSL		QALHDALSGR
LPSVPFETIQ		ALDVVMRHLP		SMRYTPVGRS		FFTASEGCSN		PLGGGREVWF
GFHQSVRPSL		WKMMLNIDVS		ATAFYKAQPV		IEFVCEVLDF		KSIEEQQKPL
TDSQRVKFTK		EIKGLKVEIT		HCGQMKRKYR		VCNVTRRPAS		HQTFPLQQES
GQTVECTVAQ		YFKDRHKLVL		RYPHLPCLQV		GQEQKHTYLP		LEVCNIVAGQ
RCIKKLTDNQ		TSTMIRATAR		SAPDRQEEIS		KLMRSASFNT		DPYVREFGIM
VKDEMTDVTG		RVLQPPSILY		GGRNKAIATP		VQGVWDMRNK		QFHTGIEIKV
WAIACFAPQR		QCTEVHLKSF		TEQLRKISRD		AGMPIQGQPC		FCKYAQGADS
VEPMFRHLKN		TYAGLQLVVV		ILPGKTPVYA		EVKRVGDTVL		GMATQCVQMK
NVQRTTPQTL		SNLCLKINVK		LGGVNNILLP		QGRPPVFQQP		VIFLGADVTH
PPAGDGKKPS		IAAVVGSMDA		HPNRYCATVR		VQQHRQEIIQ		DLAAMVRELL
IQFYKSTRFK		PTRIIFYRDG		VSEGQFQQVL		HHELLAIREA		CIKLEKDYQP
GITFIVVQKR		HHTRLFCTDK		NERVGKSGNI		PAGTTVDTKI		THPTEFDFYL
CSHAGIQGTS		RPSHYHVLWD		DNRFSSDELQ		ILTYQLCHTY		VRCTRSVSIP
APAYYAHLVA		FRARYHLVDK		EHDSAEGSHT		SGQSNGRDHQ		ALAKAVQVHQ
DTLRTMYFA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, гідролаз, рибонуклеопротеїнів, нуклеаз, ендонуклеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як регуляція трансляції, транскрипція, регуляція транскрипції, РНК-залежне заглушення генів, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном магнію, РНК, іоном марганцю. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Martinez J., Tuschl T. (2004). RISC is a 5' phosphomonoester-producing RNA endonuclease. Genes Dev. 18: 975—980. PMID 15105377 DOI:10.1101/gad.1187904
• Pillai R.S., Artus C.G., Filipowicz W. (2004). Tethering of human Ago proteins to mRNA mimics the miRNA-mediated repression of protein synthesis. RNA. 10: 1518—1525. PMID 15337849 DOI:10.1261/rna.7131604
• Gregory R.I., Chendrimada T.P., Cooch N., Shiekhattar R. (2005). Human RISC couples microRNA biogenesis and posttranscriptional gene silencing. Cell. 123: 631—640. PMID 16271387 DOI:10.1016/j.cell.2005.10.022
• Maniataki E., Mourelatos Z. (2005). A human, ATP-independent, RISC assembly machine fueled by pre-miRNA. Genes Dev. 19: 2979—2990. PMID 16357216 DOI:10.1101/gad.1384005
• Sen G.L., Blau H.M. (2005). Argonaute 2/RISC resides in sites of mammalian mRNA decay known as cytoplasmic bodies. Nat. Cell Biol. 7: 633—636. PMID 15908945 DOI:10.1038/ncb1265

Див. також

• Хромосома 8