CYP2D6

CYP2D6
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2F9Q, 3QM4, 3TBG, 3TDA, 4WNT, 4WNU, 4WNV, 4WNW, 4XRY, 4XRZ
Ідентифікатори
Символи	CYP2D6, CPD6, CYP2D, CYP2D7AP, CYP2D7BP, CYP2D7P2, CYP2D8P2, CYP2DL1, CYPIID6, P450-DB1, P450C2D, P450DB1, cytochrome P450 family 2 subfamily D member 6, Cytochrome P450 2D6
Зовнішні ІД	OMIM: 124030 HomoloGene: 133550 GeneCards: CYP2D6
Реагує на сполуку
raubasine
Онтологія гена Молекулярна функція • iron ion binding • зв'язування з іоном металу • heme binding • GO:0050602 oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen • oxidoreductase activity • aromatase activity • oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen, reduced flavin or flavoprotein as one donor, and incorporation of one atom of oxygen • steroid hydroxylase activity • monooxygenase activity Клітинна компонента • organelle membrane • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • внутрішньоклітинна мембранна органела • ендоплазматичний ретикулум • мітохондрія • цитоплазма Біологічний процес • steroid metabolic process • alkaloid metabolic process • coumarin metabolic process • lipid metabolism • isoquinoline alkaloid metabolic process • GO:1900774, GO:1900783, GO:1900795, GO:1901084, GO:1900780, GO:1900777, GO:1900771, GO:1901014, GO:1902180, GO:1900987, GO:1900990 alkaloid catabolic process • oxidative demethylation • heterocycle metabolic process • negative regulation of binding • monoterpenoid metabolic process • xenobiotic metabolic process • arachidonic acid metabolic process • negative regulation of cellular organofluorine metabolic process • long-chain fatty acid biosynthetic process • organic acid metabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1565	24303
Ensembl	ENSG00000100197 ENSG00000275211 ENSG00000280905 ENSG00000282966 ENSG00000283284 ENSG00000272532	ENSRNOG00000029179
UniProt	P10635	P12938
RefSeq (мРНК)	NM_000106 NM_001025161	NM_173093
RefSeq (білок)	NP_000097 NP_001020332	NP_775116
Локус (UCSC)	Хр. 22: 42.13 – 42.13 Mb	н/д
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CYP2D6 (англ. Cytochrome P450 family 2 subfamily D member 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі 22-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 497 амінокислот, а молекулярна маса — 55 769.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGLEALVPLA		VIVAIFLLLV		DLMHRRQRWA		ARYPPGPLPL		PGLGNLLHVD
FQNTPYCFDQ		LRRRFGDVFS		LQLAWTPVVV		LNGLAAVREA		LVTHGEDTAD
RPPVPITQIL		GFGPRSQGVF		LARYGPAWRE		QRRFSVSTLR		NLGLGKKSLE
QWVTEEAACL		CAAFANHSGR		PFRPNGLLDK		AVSNVIASLT		CGRRFEYDDP
RFLRLLDLAQ		EGLKEESGFL		REVLNAVPVL		LHIPALAGKV		LRFQKAFLTQ
LDELLTEHRM		TWDPAQPPRD		LTEAFLAEME		KAKGNPESSF		NDENLRIVVA
DLFSAGMVTT		STTLAWGLLL		MILHPDVQRR		VQQEIDDVIG		QVRRPEMGDQ
AHMPYTTAVI		HEVQRFGDIV		PLGVTHMTSR		DIEVQGFRIP		KGTTLITNLS
SVLKDEAVWE		KPFRFHPEHF		LDAQGHFVKP		EAFLPFSAGR		RACLGEPLAR
MELFLFFTSL		LQHFSFSVPT		GQPRPSHHGV		FAFLVSPSPY		ELCAVPR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до оксидоредуктаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як метаболізм ліпідів, метаболізм стероїдів, метаболізм стеролів, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном заліза, гемом. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, мікросомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Evert B., Griese E.U., Eichelbaum M. (1994). A missense mutation in exon 6 of the CYP2D6 gene leading to a histidine 324 to proline exchange is associated with the poor metabolizer phenotype of sparteine. Naunyn Schmiedebergs Arch. Pharmacol. 350: 434—439. PMID 7845481 DOI:10.1007/BF00178963
• Daly A.K., Leathart J.B., London S.J., Idle J.R. (1995). An inactive cytochrome P450 CYP2D6 allele containing a deletion and a base substitution. Hum. Genet. 95: 337—341. PMID 7868129 DOI:10.1007/BF00225204
• Masimirembwa C., Persson I., Bertilsson L., Hasler J., Ingelman-Sundberg M. (1996). A novel mutant variant of the CYP2D6 gene (CYP2D6*17) common in a black African population: association with diminished debrisoquine hydroxylase activity. Br. J. Clin. Pharmacol. 42: 713—719. PMID 8971426 DOI:10.1046/j.1365-2125.1996.00489.x
• Kimura S., Umeno M., Skoda R.C., Meyer U.A., Gonzalez F.J. (1989). The human debrisoquine 4-hydroxylase (CYP2D) locus: sequence and identification of the polymorphic CYP2D6 gene, a related gene, and a pseudogene. Am. J. Hum. Genet. 45: 889—904. PMID 2574001
• Wang S.L., Lai M.D., Huang J.D. (1999). G169R mutation diminishes the metabolic activity of CYP2D6 in Chinese. Drug Metab. Dispos. 27: 385—388. PMID 10064570

Див. також

• Хромосома 22