EIF4A2

EIF4A2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3BOR
Ідентифікатори
Символи	EIF4A2, BM-010, DDX2B, EIF4A, EIF4F, eIF-4A-II, eIF4A-II, eukaryotic translation initiation factor 4A2
Зовнішні ІД	OMIM: 601102 MGI: 106906 HomoloGene: 1487 GeneCards: EIF4A2
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • translation initiation factor activity • GO:0008026 helicase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • hydrolase activity • ATP binding • ATPase activity • RNA binding Клітинна компонента • гіалоплазма • perinuclear region of cytoplasm • eukaryotic translation initiation factor 4F complex • ядерце Біологічний процес • nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening • RNA secondary structure unwinding • GO:0022415 viral process • negative regulation of RNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity • Біосинтез білків • regulation of translational initiation • translational initiation • cellular response to leukemia inhibitory factor Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1974	13682
Ensembl	ENSG00000156976	ENSMUSG00000022884
UniProt	Q14240	P10630
RefSeq (мРНК)	NM_001967	NM_001123037 NM_001123038 NM_013506 NM_001347179
RefSeq (білок)	NP_001958	NP_001116509 NP_001116510 NP_001334108 NP_038534
Локус (UCSC)	Хр. 3: 186.78 – 186.79 Mb	Хр. 16: 22.93 – 22.93 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

EIF4A2 (англ. Eukaryotic translation initiation factor 4A2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 407 амінокислот, а молекулярна маса — 46 402.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSGGSADYNR		EHGGPEGMDP		DGVIESNWNE		IVDNFDDMNL		KESLLRGIYA
YGFEKPSAIQ		QRAIIPCIKG		YDVIAQAQSG		TGKTATFAIS		ILQQLEIEFK
ETQALVLAPT		RELAQQIQKV		ILALGDYMGA		TCHACIGGTN		VRNEMQKLQA
EAPHIVVGTP		GRVFDMLNRR		YLSPKWIKMF		VLDEADEMLS		RGFKDQIYEI
FQKLNTSIQV		VLLSATMPTD		VLEVTKKFMR		DPIRILVKKE		ELTLEGIKQF
YINVEREEWK		LDTLCDLYET		LTITQAVIFL		NTRRKVDWLT		EKMHARDFTV
SALHGDMDQK		ERDVIMREFR		SGSSRVLITT		DLLARGIDVQ		QVSLVINYDL
PTNRENYIHR		IGRGGRFGRK		GVAINFVTEE		DKRILRDIET		FYNTTVEEMP
MNVADLI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, факторів ініціації, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як взаємодія хазяїн-вірус, біосинтез білка, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, РНК.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Li W., Belsham G.J., Proud C.G. (2001). Eukaryotic initiation factors 4A (eIF4A) and 4G (eIF4G) mutually interact in a 1:1 ratio in vivo. J. Biol. Chem. 276: 29111—29115. PMID 11408474 DOI:10.1074/jbc.C100284200
• Simmons H.M., Ruis B.L., Kapoor M., Hudacek A.W., Conklin K.F. (2005). Identification of NOM1, a nucleolar, eIF4A binding protein encoded within the chromosome 7q36 breakpoint region targeted in cases of pediatric acute myeloid leukemia. Gene. 347: 137—145. PMID 15715967 DOI:10.1016/j.gene.2004.12.027
• Feng P., Everly D.N. Jr., Read G.S. (2005). mRNA decay during herpes simplex virus (HSV) infections: protein-protein interactions involving the HSV virion host shutoff protein and translation factors eIF4H and eIF4A. J. Virol. 79: 9651—9664. PMID 16014927 DOI:10.1128/JVI.79.15.9651-9664.2005
• Sudo K., Takahashi E., Nakamura Y. (1995). Isolation and mapping of the human EIF4A2 gene homologous to the murine protein synthesis initiation factor 4A-II gene Eif4a2. Cytogenet. Cell Genet. 71: 385—388. PMID 8521730

Див. також

• Хромосома 3