MBD2

MBD2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2L2L
Ідентифікатори
Символи	MBD2, DMTase, NY-CO-41, methyl-CpG binding domain protein 2
Зовнішні ІД	OMIM: 603547 MGI: 1333813 HomoloGene: 2918 GeneCards: MBD2
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • protein domain specific binding • methyl-CpG binding • C2H2 zinc finger domain binding • chromatin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • siRNA binding • nucleosomal DNA binding • satellite DNA binding • mRNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • histone deacetylase complex • GO:0035328 Гетерохроматин • Хроматин • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • positive regulation of Wnt signaling pathway • regulation of cell population proliferation • maternal behavior • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0010260 старіння людини • response to mechanical stimulus • response to estradiol • GO:1904579 cellular response to organic cyclic compound • response to nutrient levels • GO:1904578 response to organic cyclic compound • positive regulation of chromatin binding • heart development • embryonic organ development • rDNA heterochromatin assembly • regulation of DNA methylation • DNA methylation-dependent heterochromatin assembly Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8932	17191
Ensembl	ENSG00000134046	ENSMUSG00000024513
UniProt	Q9UBB5	Q9Z2E1
RefSeq (мРНК)	NM_015832 NM_003927	NM_010773 NM_001311071
RefSeq (білок)	NP_003918 NP_056647 NP_056647.1	NP_001298000 NP_034903
Локус (UCSC)	Хр. 18: 54.15 – 54.22 Mb	Хр. 18: 70.7 – 70.76 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

MBD2 (англ. Methyl-CpG binding domain protein 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 411 амінокислот, а молекулярна маса — 43 255.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRAHPGGGRC		CPEQEEGESA		AGGSGAGGDS		AIEQGGQGSA		LAPSPVSGVR
REGARGGGRG		RGRWKQAGRG		GGVCGRGRGR		GRGRGRGRGR		GRGRGRPPSG
GSGLGGDGGG		CGGGGSGGGG		APRREPVPFP		SGSAGPGPRG		PRATESGKRM
DCPALPPGWK		KEEVIRKSGL		SAGKSDVYYF		SPSGKKFRSK		PQLARYLGNT
VDLSSFDFRT		GKMMPSKLQK		NKQRLRNDPL		NQNKGKPDLN		TTLPIRQTAS
IFKQPVTKVT		NHPSNKVKSD		PQRMNEQPRQ		LFWEKRLQGL		SASDVTEQII
KTMELPKGLQ		GVGPGSNDET		LLSAVASALH		TSSAPITGQV		SAAVEKNPAV
WLNTSQPLCK		AFIVTDEDIR		KQEERVQQVR		KKLEEALMAD		ILSRAADTEE
MDIEMDSGDE		A

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Hendrich B., Bird A. (1998). Identification and characterization of a family of mammalian methyl-CpG binding proteins. Mol. Cell. Biol. 18: 6538—6547. PMID 9774669 DOI:10.1128/MCB.18.11.6538
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Bhattacharya S.K., Ramchandani S., Cervoni N., Szyf M. (1999). A mammalian protein with specific demethylase activity for mCpG DNA. Nature. 397: 579—583. PMID 10050851 DOI:10.1038/17533
• Tatematsu K., Yamazaki T., Ishikawa F. (2000). MBD2-MBD3 complex binds to hemi-methylated DNA and forms a complex containing DNMT1 at the replication foci in late S phase. Genes Cells. 5: 677—688. PMID 10947852 DOI:10.1046/j.1365-2443.2000.00359.x
• Boeke J., Ammerpohl O., Kegel S., Moehren U., Renkawitz R. (2000). The minimal repression domain of MBD2b overlaps with the methyl-CpG-binding domain and binds directly to Sin3A. J. Biol. Chem. 275: 34963—34967. PMID 10950960 DOI:10.1074/jbc.M005929200
• Sekimata M., Takahashi A., Murakami-Sekimata A., Homma Y. (2001). Involvement of a novel zinc finger protein, MIZF, in transcriptional repression by interacting with a methyl-CpG-binding protein, MBD2. J. Biol. Chem. 276: 42632—42638. PMID 11553631 DOI:10.1074/jbc.M107048200

Див. також

• Хромосома 18