PKNOX2

PKNOX2
Ідентифікатори
Символи	PKNOX2, PREP2, PBX/knotted 1 homeobox 2
Зовнішні ІД	OMIM: 613066 MGI: 2445415 HomoloGene: 32527 GeneCards: PKNOX2
Пов'язані генетичні захворювання
ожиріння, токсикоманія, alcohol dependence
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • sequence-specific DNA binding • actin filament binding • actin monomer binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • цитоплазма • microtubule cytoskeleton • actin cytoskeleton • клітинне ядро • нуклеоплазма • intercellular bridge Біологічний процес • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	63876	208076
Ensembl	ENSG00000165495	ENSMUSG00000035934
UniProt	Q96KN3	Q8BG99
RefSeq (мРНК)	NM_022062	NM_001029838 NM_148950
RefSeq (білок)	NP_001369252 NP_001369253 NP_001369254 NP_001369255 NP_001369256 NP_001369257 NP_001369258 NP_001369259 NP_001369260 NP_001369261 NP_001369262 NP_001369263 NP_001369264 NP_001369265 NP_001369266 NP_001369267 NP_001369268 NP_001369269 NP_001369270	NP_001025009 NP_683752
Локус (UCSC)	Хр. 11: 125.16 – 125.43 Mb	Хр. 9: 36.8 – 37.06 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PKNOX2 (англ. PBX/knotted 1 homeobox 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 11-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 472 амінокислот, а молекулярна маса — 52 028.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MMQHASPAPA		LTMMATQNVP		PPPYQDSPQM		TATAQPPSKA		QAVHISAPSA
AASTPVPSAP		IDPQAQLEAD		KRAVYRHPLF		PLLTLLFEKC		EQATQGSECI
TSASFDVDIE		NFVHQQEQEH		KPFFSDDPEL		DNLMVKAIQV		LRIHLLELEK
VNELCKDFCN		RYITCLKTKM		HSDNLLRNDL		GGPYSPNQPS		INLHSQDLLQ
NSPNSMSGVS		NNPQGIVVPA		SALQQGNIAM		TTVNSQVVSG		GALYQPVTMV
TSQGQVVTQA		IPQGAIQIQN		TQVNLDLTSL		LDNEDKKSKN		KRGVLPKHAT
NIMRSWLFQH		LMHPYPTEDE		KRQIAAQTNL		TLLQVNNWFI		NARRRILQPM
LDASNPDPAP		KAKKIKSQHR		PTQRFWPNSI		AAGVLQQQGG		APGTNPDGSI
NLDNLQSLSS		DSATMAMQQA		MMAAHDDSLD		GTEEEDEDEM		EEEEEEELEE
EVDELQTTNV		SDLGLEHSDS		LE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Imoto I., Sonoda I., Yuki Y., Inazawa J. (2001). Identification and characterization of human PKNOX2, a novel homeobox-containing gene. Biochem. Biophys. Res. Commun. 287: 270—276. PMID 11549286 DOI:10.1006/bbrc.2001.5578

Див. також

• Хромосома 11