PTGDS

PTGDS
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4OS8, 2WWP, 3O19, 3O22, 3O2Y, 4IMN, 4IMO, 4ORR, 4ORS, 4ORU, 4ORW, 4ORX, 4ORY, 4OS0, 4OS3
Ідентифікатори
Символи	PTGDS, L-PGDS, LPGDS, PDS, PGD2, PGDS, PGDS2, prostaglandin D2 synthase
Зовнішні ІД	OMIM: 176803 MGI: 99261 HomoloGene: 737 GeneCards: PTGDS
Онтологія гена
Молекулярна функція	• transporter activity; • isomerase activity; • fatty acid binding; • prostaglandin-D synthase activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • small molecule binding; • retinoid binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • комплекс Ґольджі; • rough endoplasmic reticulum; • Ядерна мембрана; • endoplasmic reticulum membrane; • мембрана; • extracellular region; • ендоплазматичний ретикулум; • perinuclear region of cytoplasm; • екзосома; • клітинне ядро; • міжклітинний простір;
Біологічний процес	• prostaglandin metabolic process; • lipid metabolism; • cyclooxygenase pathway; • fatty acid metabolic process; • fatty acid biosynthetic process; • prostaglandin biosynthetic process; • regulation of circadian sleep/wake cycle, sleep; • GO:0015915 транспорт;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	5730
	19215
	ENSG00000107317
	ENSMUSG00000015090
	P41222; Q5SQ11
	O09114
	NM_000954
	NM_008963
	NP_000945
	NP_032989
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PTGDS (англ. Prostaglandin D2 synthase) — білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 190 амінокислот, а молекулярна маса — 21 029^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MATHHTLWMG	LALLGVLGDL	QAAPEAQVSV	QPNFQQDKFL	GRWFSAGLAS
NSSWLREKKA	ALSMCKSVVA	PATDGGLNLT	STFLRKNQCE	TRTMLLQPAG
SLGSYSYRSP	HWGSTYSVSV	VETDYDQYAL	LYSQGSKGPG	EDFRMATLYS
RTQTPRAELK	EKFTAFCKAQ	GFTEDTIVFL	PQTDKCMTEQ

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до ізомераз. Задіяний у таких біологічних процесах як метаболізм жирних кислот, метаболізм ліпідів, транспорт, біосинтез жирних кислот, біосинтез ліпідів, біосинтез простагландинів, метаболізм простагландинів. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, апараті Гольджі. Також секретований назовні.

Література[ред. | ред. код]

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Zahn M., Maeder M., Schmidt B., Bollensen E., Felgenhauer K. (1993). Purification and N-terminal sequence of beta-trace, a protein abundant in human cerebrospinal fluid. Neurosci. Lett. 154: 93—95. PMID 7689714 DOI:10.1016/0304-3940(93)90179-O
Giacomelli S., Leone M.-G., Grima J., Silvestrini B., Cheng C.Y. (1996). Astrocytes synthesize and secrete prostaglandin D synthetase in vitro. Biochim. Biophys. Acta. 1310: 269—276. PMID 8599604 DOI:10.1016/0167-4889(95)00182-4
White D.M., Takeda T., DeGroot L.J., Stefansson K., Arnason B.G.W. (1997). Beta-trace gene expression is regulated by a core promoter and a distal thyroid hormone response element. J. Biol. Chem. 272: 14387—14393. PMID 9162076 DOI:10.1074/jbc.272.22.14387
Halim A., Nilsson J., Ruetschi U., Hesse C., Larson G. (2011). Human urinary glycoproteomics; attachment site specific analysis of N-and O-linked glycosylations by CID and ECD. Mol. Cell. Proteomics: —. PMID 22171320 DOI:10.1074/mcp.M111.013649
Halim A., Ruetschi U., Larson G., Nilsson J. (2013). LC-MS/MS characterization of O-glycosylation sites and glycan structures of human cerebrospinal fluid glycoproteins. J. Proteome Res. 12: 573—584. PMID 23234360 DOI:10.1021/pr300963h