TET2

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
TET2
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи TET2, KIAA1546, MDS, tet methylcytosine dioxygenase 2, Tet methylcytosine dioxygenase 2, IMD75
Зовнішні ІД OMIM: 612839 MGI: 2443298 HomoloGene: 49498 GeneCards: TET2
Пов'язані генетичні захворювання
рак молочної залози, меланома, справжня поліцитемія, мієлодиспластичний синдром, гострий мієлоїдний лейкоз, blood platelet count[1]
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_001127208
NM_017628
NM_001040400
NM_145989
NM_001346736
RefSeq (білок)
NP_001120680
NP_060098
NP_001035490
NP_001333665
Локус (UCSC) Хр. 4: 105.15 – 105.28 Mb Хр. 3: 133.17 – 133.25 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

TET2 (англ. Tet methylcytosine dioxygenase 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 4-й хромосомі.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 002 амінокислот, а молекулярна маса — 223 811[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MEQDRTNHVEGNRLSPFLIPSPPICQTEPLATKLQNGSPLPERAHPEVNG
DTKWHSFKSYYGIPCMKGSQNSRVSPDFTQESRGYSKCLQNGGIKRTVSE
PSLSGLLQIKKLKQDQKANGERRNFGVSQERNPGESSQPNVSDLSDKKES
VSSVAQENAVKDFTSFSTHNCSGPENPELQILNEQEGKSANYHDKNIVLL
KNKAVLMPNGATVSASSVEHTHGELLEKTLSQYYPDCVSIAVQKTTSHIN
AINSQATNELSCEITHPSHTSGQINSAQTSNSELPPKPAAVVSEACDADD
ADNASKLAAMLNTCSFQKPEQLQQQKSVFEICPSPAENNIQGTTKLASGE
EFCSGSSSNLQAPGGSSERYLKQNEMNGAYFKQSSVFTKDSFSATTTPPP
PSQLLLSPPPPLPQVPQLPSEGKSTLNGGVLEEHHHYPNQSNTTLLREVK
IEGKPEAPPSQSPNPSTHVCSPSPMLSERPQNNCVNRNDIQTAGTMTVPL
CSEKTRPMSEHLKHNPPIFGSSGELQDNCQQLMRNKEQEILKGRDKEQTR
DLVPPTQHYLKPGWIELKAPRFHQAESHLKRNEASLPSILQYQPNLSNQM
TSKQYTGNSNMPGGLPRQAYTQKTTQLEHKSQMYQVEMNQGQSQGTVDQH
LQFQKPSHQVHFSKTDHLPKAHVQSLCGTRFHFQQRADSQTEKLMSPVLK
QHLNQQASETEPFSNSHLLQHKPHKQAAQTQPSQSSHLPQNQQQQQKLQI
KNKEEILQTFPHPQSNNDQQREGSFFGQTKVEECFHGENQYSKSSEFETH
NVQMGLEEVQNINRRNSPYSQTMKSSACKIQVSCSNNTHLVSENKEQTTH
PELFAGNKTQNLHHMQYFPNNVIPKQDLLHRCFQEQEQKSQQASVLQGYK
NRNQDMSGQQAAQLAQQRYLIHNHANVFPVPDQGGSHTQTPPQKDTQKHA
ALRWHLLQKQEQQQTQQPQTESCHSQMHRPIKVEPGCKPHACMHTAPPEN
KTWKKVTKQENPPASCDNVQQKSIIETMEQHLKQFHAKSLFDHKALTLKS
QKQVKVEMSGPVTVLTRQTTAAELDSHTPALEQQTTSSEKTPTKRTAASV
LNNFIESPSKLLDTPIKNLLDTPVKTQYDFPSCRCVEQIIEKDEGPFYTH
LGAGPNVAAIREIMEERFGQKGKAIRIERVIYTGKEGKSSQGCPIAKWVV
RRSSSEEKLLCLVRERAGHTCEAAVIVILILVWEGIPLSLADKLYSELTE
TLRKYGTLTNRRCALNEERTCACQGLDPETCGASFSFGCSWSMYYNGCKF
ARSKIPRKFKLLGDDPKEEEKLESHLQNLSTLMAPTYKKLAPDAYNNQIE
YEHRAPECRLGLKEGRPFSGVTACLDFCAHAHRDLHNMQNGSTLVCTLTR
EDNREFGGKPEDEQLHVLPLYKVSDVDEFGSVEAQEEKKRSGAIQVLSSF
RRKVRMLAEPVKTCRQRKLEAKKAAAEKLSSLENSSNKNEKEKSAPSRTK
QTENASQAKQLAELLRLSGPVMQQSQQPQPLQKQPPQPQQQQRPQQQQPH
HPQTESVNSYSASGSTNPYMRRPNPVSPYPNSSHTSDIYGSTSPMNFYST
SSQAAGSYLNSSNPMNPYPGLLNQNTQYPSYQCNGNLSVDNCSPYLGSYS
PQSQPMDLYRYPSQDPLSKLSLPPIHTLYQPRFGNSQSFTSKYLGYGNQN
MQGDGFSSCTIRPNVHHVGKLPPYPTHEMDGHFMGATSRLPPNLSNPNMD
YKNGEHHSPSHIIHNYSAAPGMFNSSLHALHLQNKENDMLSHTANGLSKM
LPALNHDRTACVQGGLHKLSDANGQEKQPLALVQGVASGAEDNDEVWSDS
EQSFLDPDIGGVAVAPTHGSILIECAKRELHATTPLKNPNRNHPTRISLV
FYQHKSMNEPKHGLALWEAKMAEKAREKEEECEKYGPDYVPQKSHGKKVK
REPAEPHETSEPTYLRFIKSLAERTMSVTTDSTVTTSPYAFTRVTGPYNR
YI

Кодований геном білок за функціями належить до оксидоредуктаз, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, альтернативний сплайсинг, метилювання. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном заліза, ДНК.

Література[ред. | ред. код]

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Nagase T., Kikuno R., Nakayama M., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVIII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 273—281. PMID 10997877 DOI:10.1093/dnares/7.4.271
  • Chen Q., Chen Y., Bian C., Fujiki R., Yu X. (2013). TET2 promotes histone O-GlcNAcylation during gene transcription. Nature. 493: 561—564. PMID 23222540 DOI:10.1038/nature11742
  • Katoh M., Katoh M. (2004). Identification and characterization of human CXXC10 gene in silico. Int. J. Oncol. 25: 1193—1199. PMID 15375572

Примітки[ред. | ред. код]

Див. також[ред. | ред. код]