TNC

TNC
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1TEN, 2RB8, 2RBL
Ідентифікатори
Символи	TNC, 150-225, DFNA56, GMEM, GP, HXB, JI, TN, TN-C, Tenascin C
Зовнішні ІД	OMIM: 187380 MGI: 101922 HomoloGene: 55636 GeneCards: TNC
Пов'язані генетичні захворювання
рак простати, autosomal dominant nonsyndromic deafness 56
Онтологія гена Молекулярна функція • syndecan binding • extracellular matrix structural constituent • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • interstitial matrix • мембрана • focal adhesion • GO:0005578 Позаклітинна матриця • базальна мембрана • міжклітинний простір • endoplasmic reticulum lumen • extracellular region • collagen-containing extracellular matrix • perisynaptic extracellular matrix Біологічний процес • cellular response to retinoic acid • negative regulation of cell adhesion • bud outgrowth involved in lung branching • mesenchymal-epithelial cell signaling involved in prostate gland development • response to fibroblast growth factor • response to mechanical stimulus • extracellular matrix organization • Загоєння ран • cellular response to vitamin D • odontogenesis of dentin-containing tooth • GO:1901313 positive regulation of gene expression • адгезія клітин • prostate gland epithelium morphogenesis • cellular response to prostaglandin D stimulus • regulation of cell population proliferation • neuromuscular junction development • response to wounding • peripheral nervous system axon regeneration • osteoblast differentiation • positive regulation of cell population proliferation • response to ethanol • neuron projection development • посттрансляційна модифікація Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3371	21923
Ensembl	ENSG00000041982	ENSMUSG00000028364
UniProt	P24821	Q80YX1
RefSeq (мРНК)	NM_002160	NM_011607 NM_001369211 NM_001369212 NM_001369213 NM_001369214
RefSeq (білок)	NP_002151	NP_035737 NP_001356140 NP_001356141 NP_001356142 NP_001356143
Локус (UCSC)	Хр. 9: 115.02 – 115.12 Mb	Хр. 4: 63.88 – 63.97 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TNC (англ. Tenascin C) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 201 амінокислот, а молекулярна маса — 240 853.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGAMTQLLAG		VFLAFLALAT		EGGVLKKVIR		HKRQSGVNAT		LPEENQPVVF
NHVYNIKLPV		GSQCSVDLES		ASGEKDLAPP		SEPSESFQEH		TVDGENQIVF
THRINIPRRA		CGCAAAPDVK		ELLSRLEELE		NLVSSLREQC		TAGAGCCLQP
ATGRLDTRPF		CSGRGNFSTE		GCGCVCEPGW		KGPNCSEPEC		PGNCHLRGRC
IDGQCICDDG		FTGEDCSQLA		CPSDCNDQGK		CVNGVCICFE		GYAGADCSRE
ICPVPCSEEH		GTCVDGLCVC		HDGFAGDDCN		KPLCLNNCYN		RGRCVENECV
CDEGFTGEDC		SELICPNDCF		DRGRCINGTC		YCEEGFTGED		CGKPTCPHAC
HTQGRCEEGQ		CVCDEGFAGV		DCSEKRCPAD		CHNRGRCVDG		RCECDDGFTG
ADCGELKCPN		GCSGHGRCVN		GQCVCDEGYT		GEDCSQLRCP		NDCHSRGRCV
EGKCVCEQGF		KGYDCSDMSC		PNDCHQHGRC		VNGMCVCDDG		YTGEDCRDRQ
CPRDCSNRGL		CVDGQCVCED		GFTGPDCAEL		SCPNDCHGQG		RCVNGQCVCH
EGFMGKDCKE		QRCPSDCHGQ		GRCVDGQCIC		HEGFTGLDCG		QHSCPSDCNN
LGQCVSGRCI		CNEGYSGEDC		SEVSPPKDLV		VTEVTEETVN		LAWDNEMRVT
EYLVVYTPTH		EGGLEMQFRV		PGDQTSTIIQ		ELEPGVEYFI		RVFAILENKK
SIPVSARVAT		YLPAPEGLKF		KSIKETSVEV		EWDPLDIAFE		TWEIIFRNMN
KEDEGEITKS		LRRPETSYRQ		TGLAPGQEYE		ISLHIVKNNT		RGPGLKRVTT
TRLDAPSQIE		VKDVTDTTAL		ITWFKPLAEI		DGIELTYGIK		DVPGDRTTID
LTEDENQYSI		GNLKPDTEYE		VSLISRRGDM		SSNPAKETFT		TGLDAPRNLR
RVSQTDNSIT		LEWRNGKAAI		DSYRIKYAPI		SGGDHAEVDV		PKSQQATTKT
TLTGLRPGTE		YGIGVSAVKE		DKESNPATIN		AATELDTPKD		LQVSETAETS
LTLLWKTPLA		KFDRYRLNYS		LPTGQWVGVQ		LPRNTTSYVL		RGLEPGQEYN
VLLTAEKGRH		KSKPARVKAS		TEQAPELENL		TVTEVGWDGL		RLNWTAADQA
YEHFIIQVQE		ANKVEAARNL		TVPGSLRAVD		IPGLKAATPY		TVSIYGVIQG
YRTPVLSAEA		STGETPNLGE		VVVAEVGWDA		LKLNWTAPEG		AYEYFFIQVQ
EADTVEAAQN		LTVPGGLRST		DLPGLKAATH		YTITIRGVTQ		DFSTTPLSVE
VLTEEVPDMG		NLTVTEVSWD		ALRLNWTTPD		GTYDQFTIQV		QEADQVEEAH
NLTVPGSLRS		MEIPGLRAGT		PYTVTLHGEV		RGHSTRPLAV		EVVTEDLPQL
GDLAVSEVGW		DGLRLNWTAA		DNAYEHFVIQ		VQEVNKVEAA		QNLTLPGSLR
AVDIPGLEAA		TPYRVSIYGV		IRGYRTPVLS		AEASTAKEPE		IGNLNVSDIT
PESFNLSWMA		TDGIFETFTI		EIIDSNRLLE		TVEYNISGAE		RTAHISGLPP
STDFIVYLSG		LAPSIRTKTI		SATATTEALP		LLENLTISDI		NPYGFTVSWM
ASENAFDSFL		VTVVDSGKLL		DPQEFTLSGT		QRKLELRGLI		TGIGYEVMVS
GFTQGHQTKP		LRAEIVTEAE		PEVDNLLVSD		ATPDGFRLSW		TADEGVFDNF
VLKIRDTKKQ		SEPLEITLLA		PERTRDITGL		REATEYEIEL		YGISKGRRSQ
TVSAIATTAM		GSPKEVIFSD		ITENSATVSW		RAPTAQVESF		RITYVPITGG
TPSMVTVDGT		KTQTRLVKLI		PGVEYLVSII		AMKGFEESEP		VSGSFTTALD
GPSGLVTANI		TDSEALARWQ		PAIATVDSYV		ISYTGEKVPE		ITRTVSGNTV
EYALTDLEPA		TEYTLRIFAE		KGPQKSSTIT		AKFTTDLDSP		RDLTATEVQS
ETALLTWRPP		RASVTGYLLV		YESVDGTVKE		VIVGPDTTSY		SLADLSPSTH
YTAKIQALNG		PLRSNMIQTI		FTTIGLLYPF		PKDCSQAMLN		GDTTSGLYTI
YLNGDKAEAL		EVFCDMTSDG		GGWIVFLRRK		NGRENFYQNW		KAYAAGFGDR
REEFWLGLDN		LNKITAQGQY		ELRVDLRDHG		ETAFAVYDKF		SVGDAKTRYK
LKVEGYSGTA		GDSMAYHNGR		SFSTFDKDTD		SAITNCALSY		KGAFWYRNCH
RVNLMGRYGD		NNHSQGVNWF		HWKGHEHSIQ		FAEMKLRPSN		FRNLEGRRKR
A

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

• Glumoff V., Savontaus M., Vehanen J., Vuorio E. (1994). Analysis of aggrecan and tenascin gene expression in mouse skeletal tissues by northern and in situ hybridization using species specific cDNA probes. Biochim. Biophys. Acta. 1219: 613—622. PMID 7524681 DOI:10.1016/0167-4781(94)90220-8
• Gulcher J.R., Nies D.E., Marton L.S., Stefansson K. (1989). An alternatively spliced region of the human hexabrachion contains a repeat of potential N-glycosylation sites. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 86: 1588—1592. PMID 2466295 DOI:10.1073/pnas.86.5.1588
• Burg M.A., Tillet E., Timpl R., Stallcup W.B. (1996). Binding of the NG2 proteoglycan to type VI collagen and other extracellular matrix molecules. J. Biol. Chem. 271: 26110—26116. PMID 8824254 DOI:10.1074/jbc.271.42.26110
• Picariello G., Ferranti P., Mamone G., Roepstorff P., Addeo F. (2008). Identification of N-linked glycoproteins in human milk by hydrophilic interaction liquid chromatography and mass spectrometry. Proteomics. 8: 3833—3847. PMID 18780401 DOI:10.1002/pmic.200701057
• Leahy D.J., Hendrickson W.A., Aukhil I., Erickson H.P. (1992). Structure of a fibronectin type III domain from tenascin phased by MAD analysis of the selenomethionyl protein. Science. 258: 987—991. PMID 1279805 DOI:10.1126/science.1279805
• Nies D.E., Hemesath T.J., Kim J.H., Gulcher J.R., Stefansson K. (1991). The complete cDNA sequence of human hexabrachion (Tenascin). A multidomain protein containing unique epidermal growth factor repeats. J. Biol. Chem. 266: 2818—2823. PMID 1704365

Див. також

• Хромосома 9