TRIM21

TRIM21
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2IWG
Ідентифікатори
Символи	TRIM21, RNF81, RO52, Ro/SSA, SSA, SSA1, tripartite motif containing 21, Tripartite motif-containing protein 21
Зовнішні ІД	OMIM: 109092 MGI: 106657 HomoloGene: 2365 GeneCards: TRIM21
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • identical protein binding • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • transferase activity Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • SCF ubiquitin ligase complex • P-body • внутрішньоклітинний • autophagosome • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • клітинне ядро • нуклеоплазма • Рибонуклеопротеїни Біологічний процес • negative regulation of protein deubiquitination • response to interferon-gamma • positive regulation of autophagy • interferon-gamma-mediated signaling pathway • protein trimerization • positive regulation of viral entry into host cell • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity • protein monoubiquitination • regulation of type I interferon production • positive regulation of cell cycle • protein destabilization • Убіквітин-залежний протеоліз • клітинний цикл • negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity • protein autoubiquitination • вроджений імунітет • protein polyubiquitination • negative regulation of viral transcription Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6737	20821
Ensembl	ENSG00000132109	ENSMUSG00000030966
UniProt	P19474	Q62191
RefSeq (мРНК)	NM_003141	NM_001082552 NM_009277
RefSeq (білок)	NP_003132	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 11: 4.38 – 4.39 Mb	Хр. 7: 102.21 – 102.21 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TRIM21 (англ. Tripartite motif containing 21) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 475 амінокислот, а молекулярна маса — 54 170.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MASAARLTMM		WEEVTCPICL		DPFVEPVSIE		CGHSFCQECI		SQVGKGGGSV
CPVCRQRFLL		KNLRPNRQLA		NMVNNLKEIS		QEAREGTQGE		RCAVHGERLH
LFCEKDGKAL		CWVCAQSRKH		RDHAMVPLEE		AAQEYQEKLQ		VALGELRRKQ
ELAEKLEVEI		AIKRADWKKT		VETQKSRIHA		EFVQQKNFLV		EEEQRQLQEL
EKDEREQLRI		LGEKEAKLAQ		QSQALQELIS		ELDRRCHSSA		LELLQEVIIV
LERSESWNLK		DLDITSPELR		SVCHVPGLKK		MLRTCAVHIT		LDPDTANPWL
ILSEDRRQVR		LGDTQQSIPG		NEERFDSYPM		VLGAQHFHSG		KHYWEVDVTG
KEAWDLGVCR		DSVRRKGHFL		LSSKSGFWTI		WLWNKQKYEA		GTYPQTPLHL
QVPPCQVGIF		LDYEAGMVSF		YNITDHGSLI		YSFSECAFTG		PLRPFFSPGF
NDGGKNTAPL		TLCPLNIGSQ		GSTDY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, рибонуклеопротеїнів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, цитоплазматичних везикулах.

Література

• Itoh K., Itoh Y., Frank M.B. (1991). Protein heterogeneity in the human Ro/SSA ribonucleoproteins. The 52- and 60-kD Ro/SSA autoantigens are encoded by separate genes. J. Clin. Invest. 87: 177—186. PMID 1985094 DOI:10.1172/JCI114968
• Chan E.K., Hamel J.C., Buyon J.P., Tan E.M. (1991). Molecular definition and sequence motifs of the 52-kD component of human SS-A/Ro autoantigen. J. Clin. Invest. 87: 68—76. PMID 1985112 DOI:10.1172/JCI115003
• Tsugu H., Horowitz R., Gibson N., Frank M.B. (1994). The location of a disease-associated polymorphism and genomic structure of the human 52-kDa Ro/SSA locus (SSA1). Genomics. 24: 541—548. PMID 7713506 DOI:10.1006/geno.1994.1664
• Keech C.L., Gordon T.P., McCluskey J. (1996). Structural differences between the human and mouse 52-kD Ro autoantigens associated with poorly conserved autoantibody activity across species. Clin. Exp. Immunol. 104: 255—263. PMID 8625517 DOI:10.1046/j.1365-2249.1996.16726.x
• Bepler G., O'Briant K.C., Kim Y.-C., Schreiber G., Pitterle D.M. (1999). A 1.4-Mb high-resolution physical map and contig of chromosome segment 11p15.5 and genes in the LOH11A metastasis suppressor region. Genomics. 55: 164—175. PMID 9933563 DOI:10.1006/geno.1998.5659
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 11