Віроїд веретеноподібності бульб картоплі: відмінності між версіями

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
Інтерактивний перегляд історії
[перевірена версія][перевірена версія]
Наступне редагування →
Вилучено вміст Додано вміст
ВізуальнийВікірозмітка
Створена сторінка: {{пишу}}
 
Створено шляхом перекладу сторінки «Potato spindle tuber viroid»
Рядок 1: Рядок 1:
'''Віроїд веретеноподібності бульб картоплі''' ( '''«PSTVd»)''' - [[віроїд]] з родини ''Pospiviroidae,'' перший віроїд, що ідентифікований науковцями. <ref name="pmid5095900">{{Cite journal|last=Diener TO|date=August 1971|title=Potato spindle tuber "virus". IV. A replicating, low molecular weight RNA|journal=Virology|volume=45|issue=2|pages=411–28|doi=10.1016/0042-6822(71)90342-4|pmid=5095900}}</ref> <ref>{{Cite web|url=http://www.ars.usda.gov/is/timeline/viroid.htm|title=ARS Research Timeline - Tracking the Elusive Viroid|date=2006-03-02|accessdate=2007-07-18}}</ref> <ref name="NYT-20140925-CZ">{{Cite news|last=Zimmer|first=Carl|authorlink1=Carl Zimmer|title=A Tiny Emissary From the Ancient Past|url=https://www.nytimes.com/2014/09/25/science/a-tiny-emissary-from-the-ancient-past.html|date=September 25, 2014|work=[[New York Times]]|accessdate=September 26, 2014}}</ref> PSTVd - це невелика одноланцюгова [[Кільцеві РНК|кільцева молекула РНК]] <ref>{{Cite book
{{пишу}}
|url=https://rd.springer.com/content/pdf/10.1007%2F978-3-642-68347-3_12.pdf
|title=Nucleic Acids and Proteins in Plants II : Structure, Biochemistry and Physiology of Nucleic Acids
|last=Sanger
|first=H.L.
|date=1982
|publisher=Springer Berlin Heidelberg
|location=Berlin, Heidelberg
|page=383
|doi=10.1007/978-3-642-68347-3_12
|isbn=978-3-642-68349-7
|accessdate=13 March 2019
}}</ref>. Природними господарями віроїду є [[картопля]] (''Solanum tuberosum'') та [[Помідор|помідори]] (''Solanum lycopersicum''). Природні інфекції також спостерігались в [[Авокадо|авокадо,]] а в лабораторії інфіковані інші [[пасльонові]] культури. У 2017 року PSTVd виявили у ''[[Solanum sisymbriifolium]].''

== Штами та їхні симптоми ==
Існують різні штами PSTVd і викликані ними зміни варіюються від легких до важких. Легкі штами не викликають видимих змін. Зміни, викликані важкими штамами, залежать від умов навколишнього середовища і найважче виявляються при підвищеній температурі. Зміни зазвичай легкі при первинному зараженні, але стають важчими в наступних поколіннях рослин. Загальні симптоми важкого протікання інфекції включають в себе: зміна кольору листя, зменшення розміру бульб і їх веретеноподібне подовження. Пророщування також відбувається повільніше, ніж у незараженої картоплі. Повільні зміни проявляються в інфікованих томатів і включають погане зростання і кущистість верхівки, викликані укороченими міжвузлями. Листя стають жовтими або фіолетовими і скрученими. В остаточному підсумку відбувається некроз судин нижнього і середнього листя, але верхні листки не вмирають, а зменшуються. Процес дозрівання плодів також страждає, приводячи до маленьких, твердих, темно-зелених плодів.

Поширення PSTVd на великі відстані зазвичай відбувається через заражене насіння, хоча трапляється перенесення через [[Myzus persicae|оранжерейну попелицю]] (''Myzus persicae''), але тільки в присутності [[Вірус скручування листя картоплі|вірусу скручування листя картоплі]] (PLRV). Механічне перенесення також можливе, як тільки на певній території зараження.

== Первинна та вторинна структура PSTVd ==
PSTVd містить 359 [[Нуклеотиди|нуклеотидів]] .
{|
| align="center" |'''Первинна структура'''
|-
|{{Clear}}
1 CGGAACUAAA CUCGUGGUUC CUGUGGUUCA CACCUGACCU CCUGAGCAGA AAAGAAAAAA
61 GAAGGCGGCU CGGAGGAGCG CUUCAGGGAU CCCCGGG '''GAA AC''' CUGGAGCG AACUGGCAAA
121 AAAGGACGGU GGGGAGUGCC CAGCGGCCGA CAGGAGUAAU UCCCGCCGAA ACAGGGUUUU
181 CACCCUUCCU UUCUUCGGGU GUCCUUCCUC GCGCCCGCAG GACCACCCCU CGCCCCCUUU
241 GCGCUGUCGC UUCGGCUACU ACCCGGUGGA AACAACUGAA GCUCCCGAGA ACCGCUUUU
301 CUCUAUCUUA CUUGCUUCGG GGCGAGGGUG UUUAGCCCUU GGAACCGCAG UUGGUUCCU
|-
| align="center" | '''Вторинна структура'''
|-
|{{Clear}}[[Файл:PSTviroid.png|центр|міні|800x800пкс| Путативна вторинна структура вірусу PSTVd. Виділені нуклеотиди містяться в більшості інших вірусів.]]
|-
|}

== Бібліографія ==

* Agrios, George N., 1936- ''Plant pathology'' (3rd edition) San Diego: Academic Press, 1988.
* [https://web.archive.org/web/20081217084442/http://www.aphidwatch.com/potato/potato-spindle-virus.pdf Singh, R.P; Fletcher J.D.; "Background of disease (potato spindle tuber) and method of control"], ''Agriculture and Agri food Canada, Crop & Food Research New Zealand'' Retrieved November 15, 2007
* [https://web.archive.org/web/20060214225336/http://www.defra.gov.uk/planth/pestnote/pstv.htm DEFRA Plant Health]
* "Pathogen and plant damage (potato spindle tuber)" Retrieved November 15, 2007, from George N. Agrois, Plant Pathology (3rd Ed) San Diego: Academic Press,(1988).
[[Категорія:Шкідники та хвороби помідору]]
[[Категорія:Шкідники та захворювання картоплі]]

Версія за 22:00, 14 грудня 2020

Віроїд веретеноподібності бульб картоплі ( «PSTVd») - віроїд з родини Pospiviroidae, перший віроїд, що ідентифікований науковцями. [1] [2] [3] PSTVd - це невелика одноланцюгова кільцева молекула РНК [4]. Природними господарями віроїду є картопля (Solanum tuberosum) та помідори (Solanum lycopersicum). Природні інфекції також спостерігались в авокадо, а в лабораторії інфіковані інші пасльонові культури. У 2017 року PSTVd виявили у Solanum sisymbriifolium.

Штами та їхні симптоми

Існують різні штами PSTVd і викликані ними зміни варіюються від легких до важких. Легкі штами не викликають видимих змін. Зміни, викликані важкими штамами, залежать від умов навколишнього середовища і найважче виявляються при підвищеній температурі. Зміни зазвичай легкі при первинному зараженні, але стають важчими в наступних поколіннях рослин. Загальні симптоми важкого протікання інфекції включають в себе: зміна кольору листя, зменшення розміру бульб і їх веретеноподібне подовження. Пророщування також відбувається повільніше, ніж у незараженої картоплі. Повільні зміни проявляються в інфікованих томатів і включають погане зростання і кущистість верхівки, викликані укороченими міжвузлями. Листя стають жовтими або фіолетовими і скрученими. В остаточному підсумку відбувається некроз судин нижнього і середнього листя, але верхні листки не вмирають, а зменшуються. Процес дозрівання плодів також страждає, приводячи до маленьких, твердих, темно-зелених плодів.

Поширення PSTVd на великі відстані зазвичай відбувається через заражене насіння, хоча трапляється перенесення через оранжерейну попелицю (Myzus persicae), але тільки в присутності вірусу скручування листя картоплі (PLRV). Механічне перенесення також можливе, як тільки на певній території зараження.

Первинна та вторинна структура PSTVd

PSTVd містить 359 нуклеотидів .

Первинна структура 
 1 CGGAACUAAA CUCGUGGUUC CUGUGGUUCA CACCUGACCU CCUGAGCAGA AAAGAAAAAA
 61 GAAGGCGGCU CGGAGGAGCG CUUCAGGGAU CCCCGGG GAA AC CUGGAGCG AACUGGCAAA
121 AAAGGACGGU GGGGAGUGCC CAGCGGCCGA CAGGAGUAAU UCCCGCCGAA ACAGGGUUUU
181 CACCCUUCCU UUCUUCGGGU GUCCUUCCUC GCGCCCGCAG GACCACCCCU CGCCCCCUUU
241 GCGCUGUCGC UUCGGCUACU ACCCGGUGGA AACAACUGAA GCUCCCGAGA ACCGCUUUU
301 CUCUAUCUUA CUUGCUUCGG GGCGAGGGUG UUUAGCCCUU GGAACCGCAG UUGGUUCCU
Вторинна структура
Путативна вторинна структура вірусу PSTVd. Виділені нуклеотиди містяться в більшості інших вірусів.

Бібліографія

  1. ↑ Diener TO (August 1971). Potato spindle tuber "virus". IV. A replicating, low molecular weight RNA. Virology. 45 (2): 411—28. doi:10.1016/0042-6822(71)90342-4. PMID 5095900.
  2. ↑ ARS Research Timeline - Tracking the Elusive Viroid. 2 березня 2006. Процитовано 18 липня 2007.
  3. ↑ Zimmer, Carl (25 вересня 2014). A Tiny Emissary From the Ancient Past. New York Times. Процитовано 26 вересня 2014.
  4. ↑ Sanger, H.L. (1982). Nucleic Acids and Proteins in Plants II : Structure, Biochemistry and Physiology of Nucleic Acids (PDF). Berlin, Heidelberg: Springer Berlin Heidelberg. с. 383. doi:10.1007/978-3-642-68347-3_12. ISBN 978-3-642-68349-7. Процитовано 13 March 2019.
Отримано з https://uk.wikipedia.org/w/index.php?title=Віроїд_веретеноподібності_бульб_картоплі&oldid=30310292