Мікробіом

 

Мікробіом ( з дав.-гр. μικρός (mikrós) «small», та βίος (bíos) «life» ) — це спільнота мікроорганізмів, які зазвичай живуть разом у якомусь середовищі існування.

Мікробіота складається з усіх живих членів, які утворюють мікробіом. Більшість дослідників мікробіому погоджуються, що бактерії, археї, гриби, водорості та дрібні протисти слід розглядати як члени мікробіому. Інтеграція фагів, вірусів, плазмід і мобільних генетичних елементів є більш суперечливою. Також важливою є роль, яку відіграють вторинні метаболіти в опосередкуванні складних міжвидових взаємодій і забезпеченні виживання в конкурентному середовищі. Відчуття кворуму, викликане малими молекулами, дозволяє бактеріям контролювати спільну діяльність і адаптує їхні фенотипи до біотичного середовища, що призводить, наприклад, до адгезії між клітинами або утворення біоплівки .

Етимологія та Термінологія

Слово мікробіом походить від грецького micro, що означає «маленький» і bíos, що означає «життя»).

Одне з перших визначень терміну вперше запропоновано JL Mohr у 1952 році в The Scientific Monthly для позначення мікроорганізмів, знайдених у певному середовищі.

У 1988 році Whipps та ін.запропонували визначення терміну "певне мікробне співтовариство, що займає досить чітко визначене середовище проживання, яке має відмінні фізико-хімічні властивості".

У 2020 році міжнародна група експертів опублікувала результати своїх дискусій щодо визначення мікробіому. Вони запропонували визначення мікробіому, засноване на відродженні «компактного, чіткого та вичерпного опису терміну», який спочатку надали Whipps та ін., але доповнений двома пояснювальними абзацами. Перший пояснювальний абзац висловлює динамічний характер мікробіому, а другий пояснювальний параграф чітко відокремлює термін мікробіота від терміна мікробіом .