UniProt

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до: навігація, пошук
UniProt
Файл:UPlogo1.png
Доступні мови Англійська
Стан розробки активний
Тип База даних протеїнів
Ліцензія Creative Commons Attribution-NoDerivs
Сайт www.uniprot.org

UniProt — це база даних, що містить інформацію про послідовності протеїнів та дані щодо їх функцій, отримані з проектів секвенсингу геномів. База даних містить також великий масив даних про біологічні функції протеїнів з журнальних статей, що містять оригінальні дослідження.

Консорціум UniProt[ред.ред. код]

Консорціум UniProt утворюють Європейський Інститут Біоінформатики (ЕВІ), Швейцарський Інститут Біоіформатики (SIB) та Ресурс Інформації про Протеїни (PIR). EBI містить різноманітні сервіси та бази даних, що розташовані в Wellcome Trust Genome Campus в м. Гінкстоні, Великобританія. SIB розташований в м. Женеві (Швейцарія) та підтримує функціонування серверів з ExPASy (Expert Protein Analysis System) — центральним ресурсом баз даних протеоміки. PIR розташований на базі Національної біомедичної науково-дослідної фундації (National Biomedical Research Foundation (NBRF) в Джорджтаунському університетському медичному центрі в м. Вашингтон (США) та забезпечує підтримку найдавнішої бази даних послідовностей протеїнів — Атлас протеїнових послідовностей та структури імені Margaret Oakley Dayhoff, що був вперше опублікований в 1965 році.[1] EBI, SIB та PIR приєдналися до UniProt консорціуму в 2002 році.[2]

Підтримка баз даних UniProt[ред.ред. код]

Кожен член консорціуму робить значний внесок в технічну підтримку та оновлення в ту чи іншу частину бази даних UniProt. Зокрема, EBI та SIB розробляли бази даних Swiss-Prot та TrEMBL, а PIR займався Базою даних послідовностей протеїнів (Protein Sequence Database (PIR-PSD).[3][4][5]

Організація UniProt[ред.ред. код]

До складу UniProt входять основні чотири бази даних: UniProtKB (з під-базами Swiss-Prot та TrEMBL), UniParc, UniRef, and UniMes.

Фінансування UniProt[ред.ред. код]

UniProt фінансується з грантів Національного інституту дослідження геному (National Human Genome Research Institute), Національний інститут охорони здоров'я США Національного інститут здоров'я (National Institutes of Health або скорочено NIH), Європейська комісія, Федеральний уряд Швейцарії через федеральний офіс освіти та науки, NCI-caBIG (The cancer Biomedical Informatics Grid), та Департамент оборони.

Посилання[ред.ред. код]

  1. Dayhoff, Margaret O. (1965). Atlas of protein sequence and structure. Silver Spring, Md: National Biomedical Research Foundation. 
  2. http://www.genome.gov/page.cfm?pageID=10005283
  3. PMID 12230036 (PubMed)
    Citation will be completed automatically in a few minutes. Jump the queue or expand by hand
  4. PMID 12520019 (PubMed)
    Citation will be completed automatically in a few minutes. Jump the queue or expand by hand
  5. PMID 12520024 (PubMed)
    Citation will be completed automatically in a few minutes. Jump the queue or expand by hand