GLRA1

GLRA1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1MOT, 1VRY, 2M6B, 2M6I, 4X5T
Ідентифікатори
Символи	GLRA1, HKPX1, STHE, Glycine receptor, alpha 1, glycine receptor alpha 1
Зовнішні ІД	OMIM: 138491 MGI: 95747 HomoloGene: 20083 GeneCards: GLRA1
Реагує на сполуку
гідрон, Анандамід, тетрагідроканнабінол, HU-210, bilobalide, ніфедипін, pregnenolone sulfate, picrotoxin
Онтологія гена Молекулярна функція • zinc ion binding • glycine binding • зв'язування з іоном металу • transmitter-gated ion channel activity • extracellularly glycine-gated chloride channel activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • extracellularly glycine-gated ion channel activity • taurine binding • chloride channel activity • extracellular ligand-gated ion channel activity • ion channel activity • identical protein binding • transmembrane signaling receptor activity • transmitter-gated ion channel activity involved in regulation of postsynaptic membrane potential Клітинна компонента • integral component of membrane • перикаріон • postsynaptic membrane • cell projection • внутрішньоклітинна мембранна органела • мембрана • клітинна мембрана • синапс • integral component of plasma membrane • inhibitory synapse • внутрішньоклітинний • chloride channel complex • міжклітинні контакти • дендрит (нейробіологія) • ендоплазматичний ретикулум • external side of plasma membrane • neuronal cell body • neuron projection • calyx of Held • glycinergic synapse • integral component of presynaptic membrane • integral component of postsynaptic specialization membrane Біологічний процес • Гальмівний постсинаптичний потенціал • м'язове скорочення • переляк • neuromuscular process controlling posture • cellular response to ethanol • protein heterooligomerization • regulation of respiratory gaseous exchange • regulation of membrane potential • ion transport • anion transport • cellular response to zinc ion • regulation of respiratory gaseous exchange by nervous system process • акросомна реакція • positive regulation of acrosome reaction • neuromuscular process • cellular response to amino acid stimulus • synaptic transmission, glycinergic • потенціал дії • chloride transport • righting reflex • neuropeptide signaling pathway • protein homooligomerization • negative regulation of transmission of nerve impulse • зір • adult walking behavior • chloride transmembrane transport • response to alcohol • excitatory postsynaptic potential • chemical synaptic transmission • ion transmembrane transport • GO:0072468 сигнальна трансдукція • response to amino acid • nervous system process Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	2741	14654
Ensembl	ENSG00000145888	ENSMUSG00000000263
UniProt	P23415	Q64018
RefSeq (мРНК)	NM_000171 NM_001146040 NM_001292000	NM_001290821 NM_020492
RefSeq (білок)	NP_000162 NP_001139512 NP_001278929	NP_001277750 NP_065238
Локус (UCSC)	Хр. 5: 151.82 – 151.92 Mb	Хр. 11: 55.41 – 55.5 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

GLRA1 (англ. Glycine receptor alpha 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 457 амінокислот, а молекулярна маса — 52 624.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MYSFNTLRLY		LWETIVFFSL		AASKEAEAAR		SAPKPMSPSD		FLDKLMGRTS
GYDARIRPNF		KGPPVNVSCN		IFINSFGSIA		ETTMDYRVNI		FLRQQWNDPR
LAYNEYPDDS		LDLDPSMLDS		IWKPDLFFAN		EKGAHFHEIT		TDNKLLRISR
NGNVLYSIRI		TLTLACPMDL		KNFPMDVQTC		IMQLESFGYT		MNDLIFEWQE
QGAVQVADGL		TLPQFILKEE		KDLRYCTKHY		NTGKFTCIEA		RFHLERQMGY
YLIQMYIPSL		LIVILSWISF		WINMDAAPAR		VGLGITTVLT		MTTQSSGSRA
SLPKVSYVKA		IDIWMAVCLL		FVFSALLEYA		AVNFVSRQHK		ELLRFRRKRR
HHKSPMLNLF		QEDEAGEGRF		NFSAYGMGPA		CLQAKDGISV		KGANNSNTTN
PPPAPSKSPE		EMRKLFIQRA		KKIDKISRIG		FPMAFLIFNM		FYWIIYKIVR
REDVHNQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, іонних каналів, хлорних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, хлоридом. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, клітинних відростках, синапсах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Miller P.S., Da Silva H.M., Smart T.G. (2005). Molecular basis for zinc potentiation at strychnine-sensitive glycine receptors. J. Biol. Chem. 280: 37877—37884. PMID 16144831 DOI:10.1074/jbc.M508303200
• Yang Z., Taran E., Webb T.I., Lynch J.W. (2012). Stoichiometry and subunit arrangement of alpha1beta glycine receptors as determined by atomic force microscopy. Biochemistry. 51: 5229—5231. PMID 22715885 DOI:10.1021/bi300063m
• Zhang Y., Dixon C.L., Keramidas A., Lynch J.W. (2015). Functional reconstitution of glycinergic synapses incorporating defined glycine receptor subunit combinations. Neuropharmacology. 89: 391—397. PMID 25445488 DOI:10.1016/j.neuropharm.2014.10.026
• Yushmanov V.E., Mandal P.K., Liu Z., Tang P., Xu Y. (2003). NMR structure and backbone dynamics of the extended second transmembrane domain of the human neuronal glycine receptor alpha1 subunit. Biochemistry. 42: 3989—3995. PMID 12667090 DOI:10.1021/bi026767g
• Ma D., Liu Z., Li L., Tang P., Xu Y. (2005). Structure and dynamics of the second and third transmembrane domains of human glycine receptor. Biochemistry. 44: 8790—8800. PMID 15952785 DOI:10.1021/bi050256n

Див. також

• Хромосома 5