6S / SsrS РНК
6S РНК одна з перших ідентифікованих і секвенованих некодуючих РНК.[1] Її функція в бактеріальнвй клітині була невизначеною до недавнього часу. РНК складається з 184 нуклеотидів; тривимірна структура РНК є великою «шпилькою», що містить великий одноланцюговий фрагмент.
6S РНК ассоціюється з РНК-полімеразою, що містить у своєму складі фактор специфічності сігма-70 (sigma70 specificity factor). Ця взаємодія блокує експресію з сігма-70-залежних промоторів впродовж стаціонарної фази.[2] Гомологи 6S РНК нещодавно були ідентифіковані в більшості бактеріальних геномів.[3][4] Багато Грам-позитивних видів мають по дві копії 6S РНК. В Bacillus subtilis обидві копії взаємодіють з РНК-полімеразами із сігма-факторами та експресуються під час різних фаз росту. В багатьох протеобактеріях 6S РНК може бути утворена з транскрипту кодуючого гомологічні форми E. coli YgfA білку, який ймовірно є метенилтетрагідрофолат синтетазою. Різні версії 6S РНК в інших бактеріях.[5][6] Експериментально було доведено, що purD РНК мотиви перекриваються з 6S РНК.[5]
Примітки[ред. | ред. код]
- ↑ Brownlee GG (February 1971). Sequence of 6S RNA of E. coli. Nature New Biol. Т. 229, № 5. с. 147—9. doi:10.1038/229147a0. PMID 4929322.
- ↑ Wassarman, KM; Storz G (2000). 6S RNA regulates E. coli RNA polymerase activity. Cell. Т. 101, № 6. с. 613—623. doi:10.1016/S0092-8674(00)80873-9. PMID 10892648.
- ↑ Trotochaud, AE; Wassarman KM (2005). A highly conserved 6S RNA structure is required for regulation of transcription. Nat Struct Mol Biol. Т. 12, № 4. с. 313—319. doi:10.1038/nsmb917. PMID 15793584.
- ↑ Barrick, JE; Sudarsan N; Weinberg Z; Ruzzo WL; Breaker RR (2005). 6S RNA is a widespread regulator of eubacterial RNA polymerase that resembles an open promoter. RNA. Т. 11, № 5. с. 774—784. doi:10.1261/rna.7286705. PMC 1370762. PMID 15811922.
- ↑ а б Sharma CM; Hoffmann S; Darfeuille F та ін. (February 2010). The primary transcriptome of the major human pathogen Helicobacter pylori. Nature. Т. 464, № 7286. с. 250—5. doi:10.1038/nature08756. PMID 20164839.
{{cite news}}: Проігноровано невідомий параметр|name-list-format=(можливо,|name-list-style=?) (довідка) - ↑ Weinberg Z; Wang JX; Bogue J та ін. (March 2010). Comparative genomics reveals 104 candidate structured RNAs from bacteria, archaea, and their metagenomes. Genome Biol. Т. 11, № 3. с. R31. doi:10.1186/gb-2010-11-3-r31. PMC 2864571. PMID 20230605.
{{cite news}}: Проігноровано невідомий параметр|name-list-format=(можливо,|name-list-style=?) (довідка)Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)