Cluster 5: відмінності між версіями

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
Наступне редагування →
Вилучено вміст Додано вміст
ВізуальнийВікірозмітка
Jafaz (обговорення | внесок)
9233 редагування
Створено шляхом перекладу сторінки «Cluster 5»
(Немає відмінностей)

Версія за 15:58, 5 лютого 2022

«Кластер 5», також іменований датським державним інститутом сироватки (SSI) як ΔFVI-spike, є варіантом SARS-CoV-2, вірусу, що викликає COVID-19, який, як вважають, вимер.[1] Його виявили в листопаді 2020 року в Північній Ютландії, Данія, і, як вважають, він поширився від норок до людей через норкові ферми. Після його виявлення популяція норки в Данії була вибракована, щоб запобігти можливому поширенню цієї мутації та зменшити ризик виникнення нових мутацій. У семи муніципалітетах Північної Ютландії введено карантин і обмеження на поїздки, щоб запобігти поширенню мутації, яка може поставити під загрозу національні або міжнародні заходи реагування на пандемію COVID-19.

Всесвітня організація охорони здоров’я (ВООЗ) заявила, що кластер 5 має «помірно знижену чутливість до нейтралізуючих антитіл».[2] SSI попереджає, що мутація може зменшити дію вакцин проти COVID-19, які розробляються, хоча навряд чи зробить їх марними. Після блокування та масового тестування SSI оголосила 19 листопада 2020 року, що кластер 5, ймовірно, вимер.[1]

Фон

Американська норка (Neogale vison)

У 2019 році Данія була найбільшим виробником хутра з норки у світі[3], причому переважна більшість датських ферм розташовані в північній та західній Ютландії.[4] Останніми роками галузь в країні загалом занепадала.[5] Поряд з кажанами, ящерами та людьми, норки є одним із багатьох видів ссавців, які можуть бути заражені коронавірусами.[6]

Хоча роль ящерів у поширенні COVID-19 поступово відкидалася вченими,[7][8] декілька статей стверджували, що китайські норкові ферми, можливо, зіграли роль у появі COVID-19.[9][10][11][12][13] У партнерстві з науковим журналістом Івом Шиамою вони провели розслідування для Reporterre з листопада по грудень 2020 року[14][15][16] Наступного дня передача вірусу від норок до людей та мутації, пов’язані з норкою, були задокументовані в журналі Science[17], що спонукало уряд перенести до кінця 2020 року заборону на вирощування норки, яку раніше планувалося ввести, набув чинності з 2024 року.[18] Після відкриття в Нідерландах влада Данії розпочала широкомасштабну програму нагляду за всіма норковими фермами в країні з регулярним тестуванням і секвенуванням генома.[19] Послідовності датських і голландських вірусів, пов’язаних з норками, були депоновані в базі даних GISAID. [20] Міністерство сільського господарства США (USDA) підтвердило, що випадки захворювання норок, хворих на COVID-19, були задокументовані в штаті Юта в серпні 2020 року.[21] Додаткові спалахи були виявлені в Мічигані, Вісконсині та Орегоні.[22] Станом на 29 листопада 2020 року зараження норок COVID-19 зареєстровано в Данії, Італії, Нідерландах, Іспанії, Швеції та США.[2][23]

Класифікація

У Данії було п’ять кластерів норкових варіантів SARS-CoV-2; Данський державний інститут сироватки (SSI) позначив їх як кластери 1–5 (данська: cluster 1–5). У кластері 5, який SSI також називають ΔFVI ‑ spike[24], було підтверджено кілька різних мутацій у білку спайка вірусу. Специфічні мутації включають 69–70deltaHV (видалення залишків гістидину та валіну на 69-му та 70-му позиціях у білку), Y453F (зміна з тирозину на фенілаланін у позиції 453, всередині домену, що зв’язує рецептор білка шипа), I692V (ізолейцин до валіну в положенні 692), M1229I ( метіонін до ізолейцину в положенні 1229) і неконсервативна заміна S1147L.[25][24][26]

Мутації, пов’язані з норками, які частково нагадують мутації, виявлені в Данії, хоча є частиною окремої геномної групи, відомі з Нідерландів.[17][27]

Наслідки для здоров'я людини

5 листопада BBC News повідомила, що було виявлено 12 випадків зараження людей кластером 5.[28] Через тиждень у звіті про швидку оцінку ризиків ECDC було зазначено, що було зафіксовано 214 випадків захворювання людей, пов’язаних із норками,[27] проте, деякі з них, якщо такі були, вважаються додатковими випадками, пов’язаними зі спалахом кластера 5.[29] До 20 листопада більше не було виявлено жодних випадків штаму Cluster 5 у людей, незважаючи на широке генетичне секвенування, яке виявило 750 випадків, пов’язаних із норкою, і було оцінено, що варіант Cluster 5 більше не циркулює у людей.[30]

Історія

Відкриття

До 2 листопада 2020 року данський державний незалежний науково-дослідний інститут Statens Serum Institut (SSI) виявив мутовані варіанти SARS-CoV-2, які можуть інфікувати людей і мати небезпечні наслідки на фермах норки; інфікування людини було пов'язано з 191 позитивною норковою фермою. Про це вони публічно повідомили 3 листопада, назвавши «Кластером 5» варіанти з відомим об’єднанням до трьох господарств.[31] 4 листопада 2020 року прем'єр-міністр Данії Метте Фредеріксен заявила, що мутований коронавірус передається людям через норки, пов'язані в основному з норковими фермами в Північній Ютландії. У звіті SSI було виявлено, що в Північній Ютландії було зареєстровано 12 інфекцій людини (8 безпосередньо пов’язаних з фермами норки, 4 у сусідній громаді), що включали цю мутацію (його називають «кластером 5»), і його реакція антитіл була слабкішою. . Хоча інститут заявив, що мутація не є небезпечнішою за інші коронавіруси сама по собі, Коре Молбак і Тайра Гроув Краузе з SSI попередили, що мутація потенційно може зменшити дію вакцин проти COVID-19, які зараз розробляються, хоча це малоймовірно. зробити їх непотрібними.[26][32][33] Крім того, було показано, що більш слабка відповідь антитіл знижує імунітет, отриманий в результаті попередньої інфекції.[31] SSI зазначила, що хоча кластер 5 викликає певні занепокоєння, вони також стурбовані потенційними майбутніми мутаціями, які можуть з’явитися в норках, що призвело до їхньої рекомендації закрити всі ферми в країні.[34]

Блокування та вибракування

Як превентивний захід Фредеріксен оголосив, що країна вже зараз винищує свою популяцію норки, яка становить близько 14 мільйонів (первісні звіти про 15–17 мільйони були засновані на оцінках попередніх років, коли галузь була більшою).[35][36] Щоб запобігти поширенню мутації, 5 листопада також було оголошено, що з 6 листопада в муніципалітетах Північної Ютландії Брондерслев, Фредеріксхавн, Йоррінґ, Яммербуґт, Лесе, Тістед і Вестхіммерланд будуть введені блокування та обмеження на пересування.[26][37] Усі заклади культури, кінотеатри, театри, спортивні та розважальні заклади, а також ресторани були закриті, а в’їзд у муніципалітети та з них заборонено. Громадський транспорт припинено 9 листопада. [38] [39] Було розпочато масове тестування (Данія вже мала один із найвищих у світі показників тестування ), а програми відстеження були додатково розширені. Спочатку планувалося, що обмеження в Північній Ютландії триватимуть до 3 грудня, але їх можна було скасувати раніше, залежно від швидкості вибракування норки та масового тестування людей, а також якщо не буде виявлено нових випадків кластеру 5.[40]

ВООЗ оприлюднила заяву щодо варіантів SARS-CoV-2 6 листопада. Він пояснив, що цей кластер мав комбінацію мутацій, які раніше не спостерігалися. Варіант мав помірно знижену чутливість до нейтралізуючих антитіл, але необхідні подальші дослідження, щоб зрозуміти наслідки щодо діагностики, лікування та вакцин.[41] Пізніше це було відображено в оцінці ризику, опублікованій Європейським центром з профілактики та контролю захворювань (ECDC), де зазначається, що ризик для варіантів, пов’язаних з норками, подібний до загального ризику COVID-19, але його можна буде переоцінити, якщо виникнуть занепокоєння. Підсумки щодо імунітету, повторного зараження, вакцинації та лікування підтверджуються, зокрема, коли мова йде про кластер 5, а також відзначається, що циркуляція вірусу на фермах норки може створювати інші проблеми в майбутньому, і надаючи рекомендації щодо управління ризиком.[27][42] Наприкінці листопада було вибраковано понад 10 мільйонів.[43]

Міжнародні реакції

6 листопада Велика Британія оголосила, що Данію буде вилучено з білого списку країн, з яких мандрівники можуть повернутися без самоізоляції протягом 14 днів, посилаючись на варіант кластера 5.[44] 7 листопада Сполучене Королівство оголосило, що також заборонить в'їзд нерезидентам, які подорожують з Данії, і нерезидентам, які були в Данії протягом останніх 14 днів. Громадянам Великобританії все ще дозволили повернутися додому, але вони, як і всі інші члени їхнього домогосподарства, повинні були самоізолюватися на 14 днів. Цю заборону на поїздки мали переглянути через тиждень.[45][46] Зрештою, 28 листопада обмеження були зняті.[47]

Наслідки

Після масового тестування 19 листопада 2020 року SSI оголосила, що не знайшла нових випадків кластера 5, і він, швидше за все, вимер. Спеціальні обмеження, накладені на деякі муніципалітети Північної Ютландії, були зняті 19–20 листопада (на них досі діють стандартні обмеження щодо COVID-19, які поширюються на всю країну і не пов’язані з мутаціями норки).[1]

Політичні наслідки

Наприкінці листопада з’ясувалося, що міністр сільського господарства Могенс Йенсен і п’ять інших міністрів були повідомлені у вересні про те, що вибракування всієї популяції норки в країні, а не лише тих, що знаходяться в заражених районах, буде незаконним. Зіткнувшись із закликами до відставки з парламентської опозиції та різкою публічною критикою[48], прем’єр-міністр Фредеріксен визнав, що наказ про вибракування всіх норок був незаконним, і 18 листопада Дженсен подав у відставку.[49] Пізніше була досягнута угода, щоб ретроактивно зробити розпорядження уряду законним.[50] 21 грудня 2020 року в парламенті Данії уряд і ліві партії парламенту ухвалили законопроект, який забороняє виробництво норки протягом 2021 року [51] . Законопроект не містить положень про зняття юридичної відповідальності за попереднє вибракування, але заднім числом легалізує виплату бонусів за швидші вибракування.[51] Опозиційні партії (V, C, O, NB, LA) виступили проти.[52] 25 січня 2021 року[53] більшість у датському парламенті досягли угоди про компенсацію датським фермерам, які займаються норкою, та іншим особам, які живуть за рахунок вирощування норки, від 15,6 млрд і 18,8 DKK[54] ( прибл. 2.1 млрд євро – прибл. 2.5 млрд євро).

Дивіться також

Примітки

  1. ↑ а б в De fleste restriktioner læmpes i Nordjylland [Most restrictions are relaxed in North Jutland]. Sundheds- og Ældreministeriet. 19 November 2020. Помилка цитування: Некоректний тег <ref>; назва «sum19nov» визначена кілька разів з різним вмістом
  2. ↑ а б 6 countries find coronavirus at mink farms; fears mutation could hinder vaccine. The Times of Israel. 8 November 2020. Процитовано 9 November 2020. Italy, the Netherlands, Spain and Sweden are the other nations to have discovered SARS-CoV-2 in minks, WHO said in a statement. Помилка цитування: Некоректний тег <ref>; назва «:1» визначена кілька разів з різним вмістом
  3. ↑ Denmark to cull up to 17m mink blamed for coronavirus mutation. Financial Times. 4 November 2020.
  4. ↑ Aflivninger rammer hårdt i minkland: – Jeg har mistet alt det, jeg har arbejdet på de sidste 33 år [Killings hit hard in minkland: – I have lost everything I have worked for the last 33 years]. TV2. 5 November 2020.
  5. ↑ Fakta om minkbranchen i Danmark [Facts about the mink industry in Denmark]. Danmark's Statistik. 5 November 2020.
  6. ↑ Huang, Pien. Dutch Minks Contract COVID-19 – And Appear To Infect Humans. All Things Considered. № 25 June 2020. National Public Radio, Inc. Процитовано 3 October 2020.
  7. ↑ Covid-19 : le pangolin est-il vraiment responsable de l'épidémie? [Covid-19: is the pangolin really responsible for the epidemic?]. Sciences et Avenir (фр.). 28 September 2020. Процитовано 10 November 2020.
  8. ↑ COVID-19: time to exonerate the pangolin from the transmission of SARS-CoV-2 to humans. ub.edu/. 17 September 2020.
  9. ↑ Faure, Yann. Origine du Sars-Cov2 : Vers une enquête à " rebrousse-poil " de l'OMS en Chine ? – par Yann Faure [Origin of Sars-Cov2: Towards an investigation against the grain of the WHO in China? – by Yann Faure]. Les-crises.fr.
  10. ↑ Faure, Yann (10 November 2020). Les élevages de visons ont un rôle dans la pandémie de Covid-19 [Mink farms have a role in the Covid-19 pandemic]. reporterre.net.
  11. ↑ Yves Sciama et Yann Faure (21 December 2020). Les élevages de visons sont-ils la source du Covid en Europe? [Are mink farms the source of Covid in Europe?]. reporterre.net.
  12. ↑ Faure, Yann (22 December 2020). Malgré les risques de Covid, les États rechignent à arrêter l'élevage de vison [Despite Covid Risks, States Are Reluctant To Stop Mink Farming]. reporterre.net.
  13. ↑ Yann Faure et Yves Sciama (8 January 2021). Mounting evidence suggests mink farms in China could be the cradle of Covid-19. reporterre.net.
  14. ↑ Torgemen, Emilie (9 January 2021). Covid-19 : et si le vison était le chaînon manquant? [Covid-19: what if mink was the missing link?]. Le Parisien. Процитовано 2 February 2021.
  15. ↑ AMÉLIE POINSSOT ET FRANÇOIS BOUGON (18 January 2021). Emergence du SARS-CoV-2: les soupçons sur les élevages d'animaux à fourrure s'accumulent [Emergence of SARS-CoV-2: the suspicions about the breeding of fur animals accumulate]. Mediapart.
  16. ↑ Anne-Laure Barral (12 January 2021). Covid-19 : le vison dans le viseur des chercheurs chinois [Covid-19: mink in the sights of Chinese researchers]. France Info.
  17. ↑ а б Oude Munnink, B.B. та ін. (2020). Transmission of SARS-CoV-2 on mink farms between humans and mink and back to humans. Science. 371 (6525): 172—177. doi:10.1126/science.abe5901. PMC 7857398. PMID 33172935. Помилка цитування: Некоректний тег <ref>; назва «NLmink» визначена кілька разів з різним вмістом
  18. ↑ Not fur sale: COVID-19 brings Dutch mink farming to an end. The Economist. № 5–11 September 2020.
  19. ↑ FAQ om overvågning og test i mink [FAQ on monitoring and testing in mink]. Miljø- og Fødevareministeriet. Архів оригіналу за 27 November 2020. Процитовано 19 November 2020.
  20. ↑ European Centre for Disease Prevention and Control (12 November 2020). Detection of new SARS-CoV-2 variants related to mink (PDF). European Centre for Disease Prevention and Control (English) . ECDC. с. 3. Процитовано 12 September 2021.
  21. ↑ Cahan, Eli (18 August 2020). COVID-19 hits U.S. mink farms after ripping through Europe. Science. American Association for the Advancement of Science. Процитовано 3 October 2020.
  22. ↑ Elassar, Alaa. An Oregon mink farm has reported a Covid-19 outbreak. CNN. Процитовано 29 November 2020.
  23. ↑ Israelis may be infected with new coronavirus strain from Denmark minks. The Jerusalem Post. 9 November 2020. Процитовано 9 November 2020. Six countries have reported cases of SARS-CoV-2 in farmed minks, including Denmark, the Netherlands, Spain, Sweden, Italy and the US, according to the WHO.
  24. ↑ а б Lassaunière, Ria (11 November 2020). SARS-CoV-2 spike mutations arising in Danish mink and their spread to humans. Statens Serum Institut. Архів оригіналу за 10 November 2020. Процитовано 11 November 2020. [...] (hereafter referred to as ΔFVI-spike). [...] These include: i) 69-70deltaHV – a deletion of a histidine and valine at amino acid positions 69 and 70 in the N-terminal domain of the S1 subunit; ii) I692V – a conservative substitution at position 692 that is located seven amino acids downstream of the furin cleavage site; iii) S1147L – a non-conservative substitution at position 1147 in the S2 subunit; and iv) M1229I – a conservative substitution located within the transmembrane domain
  25. ↑ Rapid Risk Assessment: Detection of new SARS-CoV-2 variants related to mink. European Centre for Disease Prevention and Control (англ.). 12 November 2020. Процитовано 12 November 2020.
  26. ↑ а б в Grove Krause, Tyra. Mutationer i minkvirus [Mutations in the mink virus] (дан.). Statens Serum Institut. Процитовано 6 November 2020. Помилка цитування: Некоректний тег <ref>; назва «ssi» визначена кілька разів з різним вмістом
  27. ↑ а б в Detection of new SARS-CoV-2variants related to mink (PDF). European Centre for Disease Prevention and Control. 12 November 2020. Процитовано 12 November 2020. Помилка цитування: Некоректний тег <ref>; назва «ECDC full» визначена кілька разів з різним вмістом
  28. ↑ Coronavirus: Denmark imposes lockdowns amid mink covid fears. BBC. 5 November 2020. Процитовано 24 December 2020.
  29. ↑ Prasad, R. (7 листопада 2020). No evidence to suggest coronavirus cluster 5 variant found in minks increases virus transmissibility, disease severity. The Hindu (en-IN) . ISSN 0971-751X. Процитовано 4 грудня 2021.
  30. ↑ SARS-CoV-2 mink- associated variant strain – Denmark. www.who.int (англ.). Процитовано 4 грудня 2021.
  31. ↑ а б Statens Serum Institut (3 November 2020). risikovurdering-af-human-sundhed-ved-fortsat-minkavl_03112020.pdf [risk assessment of human health through continued mink breeding] (PDF) (дан.). Архів оригіналу (PDF) за 5 December 2020. Процитовано 9 December 2020.
  32. ↑ Gorman, James (4 November 2020). Denmark Will Kill All Farmed Mink, Citing Coronavirus Infections. The New York Times (амер.). ISSN 0362-4331. Процитовано 6 November 2020.
  33. ↑ Pressemøde med Regerigen og SSI [Press meeting with the Government and SSI]. DR. 6 November 2020.
  34. ↑ Seruminstituttet bakker op om nedslagtning: Vil undgå nye minkvarianter af coronavirus [The Serum Institute supports slaughter: Will avoid new mink variants of coronavirus]. TV2. 7 November 2020.
  35. ↑ Tæt på ni millioner mink i coronaområder er nu aflivet [Close to nine million mink in corona areas have now been killed]. Berlignske. 16 November 2020.
  36. ↑ Denmark to cull up to 17 million mink amid coronavirus fears. BBC News (брит.). 4 November 2020. Процитовано 5 November 2020.
  37. ↑ Barrett, Michael (5 November 2020). How serious is Denmark's mink coronavirus mutation and outbreak?. The Local DK. Процитовано 6 November 2020.
  38. ↑ Coronavirus: Denmark imposes lockdowns amid mink covid fears. BBC News (брит.). 5 November 2020. Процитовано 6 November 2020.
  39. ↑ Fjordbak, Emma. Her er de nye restriktioner i Nordjylland [Here are the new restrictions in North Jutland] (дан.). TV2. Процитовано 6 November 2020.
  40. ↑ Mette F. åbner for at løsne restriktioner i Nordjylland før tid [Mette F. opens to loosen restrictions in North Jutland ahead of time]. Børsen. 11 November 2020.
  41. ↑ WHO | SARS-CoV-2 mink-associated variant strain – Denmark. WHO. Архів оригіналу за 6 November 2020. Процитовано 6 November 2020.
  42. ↑ Cheng, Maria (12 November 2020). EU agency: Coronavirus spread in minks could speed mutations. Medical Xpress. Процитовано 12 November 2020.
  43. ↑ Thousands of mink culled over COVID fears rise from a mass grave in Denmark. CBS News. 27 November 2020.
  44. ↑ Covid: Denmark removed from UK's travel corridor list. BBC. 6 November 2020. Процитовано 6 November 2020.
  45. ↑ Coronavirus: UK bans Denmark visitors over mink Covid-19 fears. BBC. 7 November 2020. Процитовано 7 November 2020.
  46. ↑ Murphy, Simon; Beaumont, Peter (7 November 2020). Travel to UK from Denmark banned amid worries over Covid in mink. The Guardian (брит.). ISSN 0261-3077. Процитовано 7 November 2020.
  47. ↑ The Health Protection (Coronavirus, International Travel) (England) (Amendment) (No. 27) Regulations 2020. legislation.gov.uk. Процитовано 19 February 2021.
  48. ↑ Erdbrink, Thomas; Santora, Marc (19 November 2020). The culling of minks in Denmark prompts a political crisis. The New York Times. Архів оригіналу за 26 November 2020. Процитовано 27 November 2020.
  49. ↑ Wamsley, Laurel (19 November 2020). Danish Agriculture Minister Resigns Amid Criticism For Ordering Mink Cull. NPR. Архів оригіналу за 26 November 2020. Процитовано 27 November 2020.
  50. ↑ Wax, Eddy (18 November 2020). Danish farm minister quits over mink scandal. Politico. Архів оригіналу за 21 November 2020. Процитовано 27 November 2020.
  51. ↑ а б Parliament of Denmark, bill no. 77, 2020–21 session (PDF). ft.dk. 21 December 2020.
  52. ↑ Folketinget (Parliament of Denmark), 2020–21 session, vote no. 170. ft.dk. 21 December 2020.
  53. ↑ Bred aftale sikrer fuldstændig erstatning til minkavlere og følgeerhverv [Broad agreement ensures complete compensation for mink breeders and followers]. fm.dk (дан.). Finansministeriet. Процитовано 26 January 2021.
  54. ↑ Sådan ser minkavlernes erstatning ud: 'De fleste vil få en større erstatning, end de har gæld' [This is what the mink breeders' compensation looks like: 'Most people will receive greater compensation than they have in debt']. DR (дан.). 26 January 2021. Процитовано 26 January 2021.
Отримано з https://uk.wikipedia.org/w/index.php?title=Cluster_5&oldid=34495092